Galvenā atšķirība starp savienotāju un adapteri ir tāda, ka savienotājam nav saliedētu galu, savukārt adapterim ir viens saliedēts gals.
DNS ligēšana ir process, kurā divas DNS molekulas savieno kopā, veidojot fosfodiestera saites. Ferments, ko sauc par DNS ligāzi, katalizē šo reakciju. Tas ir viens no kritiskajiem soļiem mūsdienu molekulāri bioloģiskajās jomās, piemēram, rekombinantās DNS tehnoloģijā un DNS klonāšanā. Ligācijas efektivitāte ir atkarīga no ligējamo DNS molekulu galiem. Ir divu veidu DNS gali: lipīgi un neasi gali. Siešanas efektivitāte ir augstāka ar lipīgiem galiem nekā ar neasiem galiem. Ja mērķa DNS molekulām ir neasi gali, noderēs molekulas, ko sauc par adapteriem vai linkeriem. Adapteri un linkeri ir ķīmiski sintezētas oligonukleotīdu molekulas, kas palīdz DNS ligācijā. Viņiem ir arī iekšējo ierobežojumu vietnes. Adapterim ir viens lipīgs gals un viens neass gals, savukārt savienotājam ir divi neasi gali.
Kas ir saistītājs?
Linker ir ķīmiski sintezēta oligonukleotīdu secība, kas ir divpavedienu. Linkerim ir divi neasi gali. Linkeru izmanto, lai saistītu DNS molekulas ar neasiem galiem ar vektoriem. Tajā ir viena vai vairākas iekšējo ierobežojumu vietnes. Šīs restrikcijas vietas darbojas kā restrikcijas enzīmu atpazīšanas vietas.
Attēls 01: Linker
Pēc ligāšanas DNS atkal tiek ierobežota ar restrikcijas enzīmiem, lai radītu saliedētus galus. EcoRI-linkeri un sal-I saitītāji ir parasti izmantotie saistītāji.
Kas ir adapteris?
Adapteris ir divpavedienu oligonukleotīdu secība, ko izmanto, lai savienotu divas DNS molekulas. Tā ir īsa secība ar vienu neasu galu un vienu lipīgu vai saliedētu galu. Tāpēc tā vienā galā sastāv no vienpavediena astes, kas uzlabo DNS ligācijas efektivitāti.
Attēls 02: DNS ligācija ar adapteri
Turklāt adapterim ir iekšējas ierobežojumu vietnes. Tāpēc pēc ligācijas DNS var ierobežot ar atbilstošiem restrikcijas enzīmiem, lai izveidotu jaunu izvirzītu galu. Viens no adapteru trūkumiem ir tas, ka divi adapteri var veidot dimmerus, savienojot bāzi pārī ar sevi. No tā var izvairīties, apstrādājot tos ar enzīmu, ko sauc par sārmaino fosfatāzi.
Kādas ir līdzības starp Linker un Adaptor?
- Gan saistītājs, gan adapteris ir divpavedienu īsas oligonukleotīdu sekvences.
- Tās ir iekšēju ierobežojumu vietnes.
- Turklāt tās ir ķīmiski sintezētas DNS molekulas un sintētiskas molekulas.
- Tās var savienot divas DNS molekulas.
- Pēc linkeru un adapteru ligēšanas DNS atkal tiek ierobežota ar restrikcijas enzīmiem, lai radītu lipīgus galus.
Kāda ir atšķirība starp savienotāju un adapteri?
Saistītājs ir ķīmiski sintezēts īss oligonukleotīdu duplekss ar diviem neasiem galiem. Adapteris ir ķīmiski sintezēts īss oligonukleotīdu duplekss ar vienu lipīgu galu un vienu neasu galu. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp savienotāju un adapteri. Turklāt adapteri var veidot dimērus, savukārt linkeri neveido dimērus. Tātad šī ir vēl viena būtiska atšķirība starp savienotāju un adapteri.
Tālāk ir sniegts kopsavilkums par atšķirībām starp savienotāju un adapteri tabulas veidā.
Kopsavilkums - Linker vs Adaptor
Saistītājs un adapteris ir divu veidu ķīmiski sintezēti oligonukleotīdi, kas ir noderīgi neaso galu DNS ligēšanai. Linkeram ir divi neasi gali, savukārt adapterim ir viens neass gals un viens saliedēts gals. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp savienotāju un adapteri. Tās ir divpavedienu molekulas, kurām ir iekšējas restrikcijas vietas. Tos plaši izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā un DNS klonēšanā.
