Galvenā atšķirība starp motīvu un domēnu ir tāda, ka motīvs nav neatkarīgi stabils, kamēr domēns ir neatkarīgi stabils.
Olb altumvielas ir svarīgas mūsu organismā esošās bioloģiskās makromolekulas. No otras puses, gēna ģenētiskais kods noteiks proteīna aminoskābju secību. Turklāt olb altumvielām ir primārā, sekundārā un terciārā struktūra. Primārā struktūra ir polipeptīdu ķēdes aminoskābju secība. Kad polipeptīdu ķēdes salokās viena ar otru, tas veido proteīna sekundāro struktūru. Alfa spirāles, beta loksnes un supersekundārās struktūras pieder pie sekundārajām struktūrām. Noteiktas supersekundāro elementu grupas ir zināmas kā olb altumvielu motīvi. Olb altumvielas terciārā struktūra attiecas uz tās trīsdimensiju struktūru, kas nosaka proteīna funkciju. Domēns ir salocīta proteīna molekulas daļa, kas ir lodveida un kurai ir atsevišķa funkcija. Tā ir proteīna funkcionālā un trīsdimensiju struktūra.
Kas ir motīvs?
Motīvs ir noteikta proteīnu supersekundāro elementu grupa, piemēram, alfa spirāles un beta struktūras. Tie ir sava veida modeļi, kas atrodas dažādos proteīnos. Motīvi apraksta sekundāro strukturālo elementu locīšanas modeļus un to mijiedarbību. Šie locīšanas modeļi stabilizējas ar līdzīgām saitēm, kas atrodas terciārajās struktūrās. Tomēr tās nav tik sarežģītas kā terciārās struktūras.
01. attēls: motīvs
Tās ir vienkāršas proteīnu sekundāro struktūru kombinācijas. Motīvs pats par sevi nav stabils. Turklāt motīvi izskaidro proteīna struktūru, bet neparedz proteīna darbību. Olb altumvielu motīvu piemēri ir beta-alfa-beta motīvs, grieķu atslēgas motīvs, beta muca, beta-meander motīvs utt.
Kas ir domēns?
Domēns ir proteīna pamata, funkcionāla un trīsdimensiju vienība. Tas veic noteiktu funkciju. Vienam proteīnam var būt vairāki atšķirīgi domēni. Katrs domēns ir neatkarīga vienība. Tā ir lodveida struktūra. Tas ir atbildīgs par noteiktu funkciju vai mijiedarbību. Domēnus var izmantot, lai izvirzītu hipotēzi par neraksturīga proteīna funkciju. Analizējot proteīnu, ir svarīgi ņemt vērā, jo domēni ir proteīna funkcionālās vienības.
Attēls 02: trīs dažādi piruvāta kināzes domēni
Domēni ir ļoti stabilas un kompaktas struktūras. Tos var viegli atšķirt no citiem reģioniem. Piruvāta kināzei ir trīs atšķirīgi domēni, kā parādīts 02. attēlā. Domēna garums var atšķirties, un vidējais garums ir 100 aminoskābes. Katrā domēnā ir hidrofobs kodols, kas veidots no sekundārajām struktūrvienībām. Vairāki domēni kopā veido proteīna terciāro struktūru.
Kādas ir līdzības starp motīvu un domēnu?
- Motīvs un domēns ir vienības, kas atrodas pašās olb altumvielu molekulās.
- Tie ir noderīgi, klasificējot olb altumvielu saimes.
Kāda ir atšķirība starp motīvu un domēnu?
Motīvs ir noteikta proteīnu supersekundāro elementu grupa, piemēram, alfa spirāles un beta struktūras, savukārt domēns ir proteīna funkcionālā vienība. Turklāt motīvs ir sekundāra struktūra, savukārt domēns ir atbildīgs par proteīna terciāro struktūru. Turklāt domēns atšķirībā no motīva ir neatkarīga vienība. Arī domēns attēlo proteīna funkciju, bet motīvs nav. Šīs ir galvenās atšķirības starp motīvu un domēnu. Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā parādīta atšķirība starp motīvu un domēnu.
Kopsavilkums - motīvs pret domēnu
Motīvs ir proteīna molekulas sekundāro struktūru izkārtojums. Atšķirībā no domēna tas parasti nav stabils pats par sevi. Domēns ir neatkarīgi stabila proteīna struktūra. Tāpēc tā var būt daļa vai vesela proteīna molekula. Tā ir proteīna trīsdimensiju funkcionālā pamatvienība. Turklāt tai ir funkcija, un tā ir neatkarīga vienība. Motīvs var būt daļa no domēna. Taču domēns nevar būt daļa no motīva. Šī ir atšķirība starp motīvu un domēnu.
