Galvenā atšķirība starp gēna nokautēšanu un notriekšanu ir tāda, ka gēna nokautēšana ir metode, kurā interesējošais gēns tiek pilnībā noņemts (nedarbīgs stāvoklis), lai pētītu gēna funkcijas, savukārt gēnu notriekšana ir vēl viena metode, kurā tiek izmantots gēns. interese tiek apklusināta, lai izpētītu konkrētā gēna lomu bioloģiskā sistēmā.
Izmanto dažādas ģenētiskas metodes, lai pētītu gēnu darbību dzīvās bioloģiskajās sistēmās. Gēnu nokauts un nokauts ir divi šādi paņēmieni. Šīs metodes palīdz zinātniekiem noteikt dažādu dzīvo organismu gēnu funkcionālos aspektus.
Kas ir Gene Knockout?
Gēnu izslēgšana ir ģenētiska metode, kas padara vienu vai vairākus gēnus nedarbīgus dzīvos organismos. Tas ir arī organisma gēna izslēgšanas vai dzēšanas process. Šīs metodes galvenais pielietojums ir gēnu funkcijas izpēte. Process novērtē pazaudētā vai izņemtā gēna ietekmi. Izslēgšanas process ietver arī noteiktus enzīmus un savienošanas paņēmienus.
Attēls 01: Gene Knockout
Gēnu izslēgšanas tehnikā ir dažas variācijas, pamatojoties uz iesaistīto gēnu skaitu. Tie ir dubultais nokauts (divu gēnu nokauts), trīskāršais nokauts (trīs gēnu nokauts) un četrkāršais nokauts (četru gēnu nokauts). Gēnu nokauts tiek iedalīts divās grupās; heterozigoti nokauti un homozigoti nokauti.
Kas ir Gene Knockdown?
Gēnu notriekšana ir eksperimentāla procedūra, kurā šī procedūra nomāc vai samazina noteikta organisma gēna vai gēnu ekspresiju. Gēnu klusēšana ir izplatīta gēnu notriekšanas definīcija. Šīs procedūras laikā iegūtās mRNS aktivizēšana vai degradācija ietver RNS traucējumus (RNAi), mazo traucējošo RNS (siRNS) un īso matadata RNS (shRNS).
2. attēls: gēnu klusēšana
Gēnu notriekšanas primārais pielietojums ir izpētīt konkrētā gēna lomu bioloģiskajā sistēmā. Tāpēc ar šo metodi tiek pētīti onkogēni (Bcl-2 un P53) un gēni, kas izraisa neiroloģiskas slimības, vīrusu infekcijas un iedzimtas slimības.
Kādas ir līdzības starp Gene Knockout un Knockdown?
- Gan gēnu izslēgšana, gan gēnu notriekšana ir ģenētiskas metodes.
- Šie divi paņēmieni var novērst gēnu ekspresiju.
- Abu metožu primārais lietojums ir interesējošā gēna funkcijas izpēte.
- Abi spēj identificēt dažādus slimību stāvokļus (ģenētiskus).
- Tos abus varētu izmantot vienam vai vairākiem interesējošiem gēniem.
Kāda ir atšķirība starp Gene Knockout un Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Gēnu nokautēšana ir organisma gēnu darbība (gēnu izņemšana no DNS), izmantojot dažādas ģenētiskas metodes. | Gēnu nojaukšana ir eksperimentāla procedūra, lai nomāktu (samazinātu vai apklusinātu) noteikta organisma gēna vai gēnu ekspresiju. |
| Funkcija | |
| Atvieglo gēnu funkciju izpēti, analizējot pazaudētā gēna rezultātus. | Atvieglo onkogēnu izpēti, gēnus, kas izraisa neiroloģiskas slimības, vīrusu infekcijas un iedzimtas slimības. |
| RNS aģentu iesaistīšana | |
| RNS aģentu iesaiste šajā tehnikā ir nenozīmīga. | Šajā procesā tiek izmantoti tādi aģenti kā siRNS, shRNS un RNAi, lai inaktivētu mRNS. |
| Ķīmisko aģentu lietošana | |
| Tiek izmantoti fermentatīvie līdzekļi. | Tādas ķīmiskās vielas netiek izmantotas. |
| Ietekme uz Gene | |
| Pilnībā noņem gēnu no DNS. | Apspiest vai apklusināt gēnu. |
| Klasifikācija | |
| Dubultais nokauts, trīskāršs nokauts un četrkāršs nokauts un heterozigots un homozigots nokauts ir dažādi gēnu nokauti. | Gēnu klusēšanai nav pieejamas šādas klasifikācijas sistēmas. |
Kopsavilkums - Gene Knockout vs Gene Knockdown
Abas metodes, kuras mēs šeit apspriedām; gēnu nokautēšana un notriekšana ir metodes dažādu gēnu funkciju izpētei. Gēnu izslēgšana pilnībā padara gēnu nedarbīgu, savukārt gēnu izslēgšana apklusina interesējošo gēnu. Tomēr abas procedūras novērš gēnu ekspresiju. Šos divus procesus spēj veikt dažādi aģenti. Gēnu izslēgšana ir dzēšanas veids, savukārt gēnu izslēgšana ir inaktivācijas veids. Šī ir atšķirība starp gēnu nokautēšanu un notriekšanu.
