Galvenā atšķirība - minisatelīts pret mikrosatelītu
Atkārtota DNS ir nukleotīdu sekvences, kas organismu genomā atkārtojas atkal un atkal. Atkārtota DNS veido ievērojamu daļu no genoma DNS, un ir trīs galvenie veidi, ko sauc par tandēma atkārtojumiem, termināla atkārtojumiem un savstarpēji saistītiem atkārtojumiem. Tandēma atkārtojumi ir ļoti atkārtotas secības, kas atrodas blakus viena otrai bez pārtraukuma. Mugurkaulnieku genomā ir trīs galvenie tandēma atkārtojumu veidi. Tie ir satelīta DNS, mikrosatelītu DNS un minisatelītu DNS. Minisatelīts ir ļoti atkārtotas DNS sadaļa, kas sastāv no atkārtotas secības, kas sastāv no 10 līdz 100 bāzu pāriem. Mikrosatelīts ir atkārtotas DNS sadaļa, kas sastāv no īsām atkārtotām sekvencēm, kas sastāv no 1 līdz 9 bāzes pāriem. Tāpēc galvenā atšķirība starp minisatelītu un mikrosatelītu ir atkārtojošās secības lielums vai garums.
Kas ir minisatelīts?
Minisatelīta DNS ir DNS daļa, kas ietver virkni īsu DNS atkārtošanās secību, kuras garums ir no 10 līdz 60 bāzes pāriem. Minisatelītus dēvē arī par mainīga skaita tandēma atkārtojumiem (VNTR). Minisatelītus bieži sajauc ar mikrosatelītiem. Tomēr zinātnieki tagad izšķir minisatelītus un mikrosatelītus, pamatojoties uz atkārtotās secības lielumu.
Minisatelītus cilvēka genomā var redzēt vairāk nekā 1000 vietās. Šīs īsās sekvences ir bagātas ar G un C. Atkārtojumu skaits konkrētajā minisatelītā dažādiem indivīdiem ir ļoti atšķirīgs.
Pirmo cilvēka minisatelītu identificēja A. R. Vaimens un R. Vaits 1980. gadā. Vēlāk Alekss Džefrijs atklāja organismu minisatelītu kopiju skaita ārkārtējo polimorfismu. Šie atklājumi padarīja minisatelītus par ideāliem marķieriem DNS pirkstu nospiedumu noņemšanai, saikņu analīzei un populācijas pētījumiem. Minisatelīti arī palīdz regulēt gēnu ekspresiju, transkripciju, alternatīvu savienošanu utt.
Kas ir mikrosatelīts?
Mikrosatelīts ir DNS daļa, kurai ir vienkārši secību atkārtojumi no 1 līdz 10 bāzes pāriem. Mikrosatelītus sauc arī par īsu secību atkārtojumiem (SSR) vai vienkāršiem tandēma atkārtojumiem (STR). Ir divu veidu mikrosatelīti, ko sauc par vienkāršiem mikrosatelītiem un saliktiem mikrosatelītiem. Vienkārši mikrosatelīti sastāv tikai no viena veida atkārtotām sekvencēm. Saliktie mikrosatelīti sastāv no vairāk nekā viena veida atkārtojumiem. Mikrosatelītiem visbiežāk ir poli A/T reģioni. Mikrosatelīti ir kodominanti un bagātīgi sastopami eikariotu genomos.
Līdzīgi minisatelītiem, arī mikrosatelīti uzrāda polimorfismu starp indivīdiem. Atkārtojumu skaits konkrētam mikrosatelītam dažādiem indivīdiem ir atšķirīgs. Tāpēc mikrosatelītus var izmantot arī kā ģenētiskos marķierus DNS pirkstu nospiedumu noņemšanā. Mikrosatelītu polimorfismu var viegli identificēt ar PCR un gēla elektroforēzi. Mikrosatelīta blakus esošais reģions ir ļoti konservēts radniecīgās sugās.
Kādas ir līdzības starp minisatelītu un mikrosatelītu?
- Minisatelīti un mikrosatelīti ir nekodējošas DNS sekvences.
- Abi ir tandēma atkārtojumi.
- Abas sastāv no ļoti atkārtotām secībām.
- Abus var izmantot kā spēcīgus ģenētiskos marķierus DNS pirkstu nospiedumu noņemšanai.
Kāda ir atšķirība starp minisatelītu un mikrosatelītu?
Minisatelīts pret mikrosatelītu |
|
| Minisatelīti ir tandēma atkārtojumi ar monomēra atkārtojuma garumu no 10 līdz 100 bāzes pāriem. | Mikrosatelīti ir īsi tandēma atkārtojumi, kas sastāv no 1 līdz 9 bāzes pāru monomēru atkārtošanās secībām. |
| Atkārtotas secības lielums | |
| Minisatelītam ir atkārtotas secības no 10 līdz 100 bāzes pāriem. | Mikrosatelītam ir īsas secības no 1 līdz 9 bāzes pāriem. |
| Kopējās bāzes | |
| Minisatelīti ir bagāti ar G un C bāzēm. | Mikrosatelīti ir bagāti ar A un T bāzēm. |
| Citi vārdi | |
| Minisatelīti ir zināmi arī kā mainīga skaita tandēma atkārtojumi (VNTR). | Mikrosatelītus sauc arī par īsu secību atkārtojumiem (SSR) vai vienkāršiem tandēma atkārtojumiem (STR). |
Kopsavilkums - minisatelīts pret mikrosatelītu
Minisatelīts un mikrosatelīts ir divu veidu tandēma atkārtojumi. Tos izšķir, pamatojoties uz bāzu skaitu atkārtojošā secībā vai secības lielumu. Minisatelītam ir 10 līdz 100 bāzes pāru garuma atkārtošanās secība, savukārt mikrosatelītam ir 1 līdz 9 bāzes pāru garuma atkārtošanās secība. Šī ir galvenā atšķirība starp minisatelītu un mikrosatelītu. Atkārtotu secību kopiju skaits minisatelītos un mikrosatelītos cilvēkiem ir ļoti atšķirīgs. Gan minisatelīti, gan mikrosatelīti ir spēcīgi DNS marķieri, lai analizētu ģenētiskās variācijas sugu populācijās un starp tām.
Lejupielādēt PDF versiju Minisatellite vs Microsatellite
Varat lejupielādēt šī raksta PDF versiju un izmantot to bezsaistē, kā norādīts citēšanas piezīmēs. Lūdzu, lejupielādējiet PDF versiju šeit Atšķirība starp minisatelītu un mikrosatelītu.
