Galvenā atšķirība starp šūnām nesaturošu DNS un cirkulējošo audzēja DNS ir tā, ka bezšūnu DNS ir dažādas DNS formas, kas brīvi cirkulē asinīs, savukārt cirkulējošā audzēja DNS ir fragmentēta no audzēja iegūta DNS, kas cirkulē asinīs.
DNS bez šūnām un cirkulējošā audzēja DNS ir divu veidu cirkulējošās nukleīnskābes. Cirkulējošās nukleīnskābes atklāja Mandels un Metāls 1948. gadā. Vēlāk tika atklāts, ka cirkulējošo nukleīnskābju daudzums slimiem pacientiem ir ievērojami augsts. Šis atklājums pirmo reizi tika veikts saistībā ar lupus pacientiem. Turklāt cirkulējošām nukleīnskābēm ir augstāka prognostiskā vērtība, un tās var izmantot kā biomarķieri dažādu slimību noteikšanai.
Kas ir DNS bez šūnām?
Šūnu nesaturoša DNS (Cf DNS) attiecas uz dažādām DNS formām, piemēram, cirkulējošo audzēja DNS, bezšūnu mitohondriju DNS un bezšūnām augļa DNS utt., kas brīvi cirkulē asinīs. Paaugstināts bezšūnu DNS līmenis tiek novērots tādām progresējošām slimībām kā vēzis, traumas, sepse, miokarda infarkts, diabēts, insults, sirpjveida šūnu slimība utt. Papildus vēža un augļa zālēm bezšūnu DNS ir noderīgs biomarķieris daudzām slimībām. Šo DNS var izmantot arī transplantāta atgrūšanas noteikšanai. Tos izmanto arī parastā stresa noteikšanā, pirmsdzemdību dzimuma atšķiršanā un paternitātes pārbaudē.
Attēls 01: DNS bez šūnām
Šūnu nesaturoša DNS parasti ir divpavedienu ekstracelulāra DNS molekula. Tas sastāv no maziem fragmentiem (50 līdz 200 bp) un lielākiem fragmentiem (21 kb). Turklāt tas jau ir atzīts par uzticamu biomarķieri prostatas un krūts vēža diagnosticēšanai. Šūnu brīvā DNS pārsvarā cirkulē asinsritē kā nukleosomas. Nukleosomas ir histonu un DNS kodolkompleksi. Cf DNS var kvantitatīvi noteikt, izmantojot dažādas metodes, piemēram, PCR, masveidā paralēlu sekvencēšanu, ultravioleto spektrometriju, PicoGreen krāsošanu un ELISA. Tā kā Cf DNS noteikšana asinsritē ir ātra, vienkārša, neinvazīva, atkārtota metode, nākotnē tā būs potenciāls biomarķieris daudzu slimību, piemēram, autoimūnu reimatisku slimību un audzēju, diagnosticēšanai.
Kas ir cirkulējošā audzēja DNS?
Cirkulējošā audzēja DNS (Ct DNS) ir fragmentēta audzēja DNS, kas cirkulē asinīs. Tam ir audzēja izcelsme. Tā kā cirkulējošs audzējs var atspoguļot visu audzēja genomu, tas ir ieguvis plašu pievilcību tā potenciālās lietderības dēļ klīniskajos iestatījumos. Šķidrās biopsijas, kurās tiek ņemtas asinis, var izmantot, lai pārbaudītu cirkulējošo audzēju.
Attēls 02: Cirkulējošā audzēja DNS
Bioloģiskie procesi, kas, iespējams, ir saistīti ar Ct DNS izdalīšanos, ir apoptoze un nekroze no mirstošām šūnām vai aktīva atbrīvošanās no audzēja šūnām. Veselos audos infiltrējošie fagocīti var attīrīt Ct DNS. Turklāt, lai analizētu cirkulējošā audzēja DNS, var izmantot dažādas metodes, piemēram, pilienu digitālo PCR, BEAMing, CAPP-Seq (dziļās sekvencēšanas), drošās sekvencēšanas un dupleksās sekvencēšanas.
Kādas ir līdzības starp DNS bez šūnām un cirkulējošā audzēja DNS?
- DNS bez šūnām un cirkulējošā audzēja DNS ir divu veidu cirkulējošās nukleīnskābes.
- Tos sastāv no nukleotīdiem.
- Abus veidus var izmantot kā potenciālos marķierus, lai diagnosticētu dažādas slimības klīniskajos iestatījumos.
- Tie ir atrodami asinsritē.
- Abas ir DNS molekulu ekstracelulāras formas.
- Tos abus attīra infiltrējošie fagocīti.
Kāda ir atšķirība starp DNS bez šūnām un cirkulējošā audzēja DNS?
Šūnu nesaturoša DNS ir dažādas DNS formas, piemēram, cirkulējoša audzēja DNS, bezšūnu mitohondriju DNS un bezšūnu augļa DNS utt., kas brīvi cirkulē asinīs, savukārt cirkulējošā audzēja DNS ir fragmentēta audzēja DNS. kas cirkulē asinīs. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp DNS bez šūnām un cirkulējošo audzēja DNS. Turklāt bez šūnām DNS cirkulē fragmentos no 50 līdz 220 bp, savukārt cirkulējošā audzēja DNS cirkulē fragmentos no 134 līdz 144 bp.
Šajā infografikā tabulas veidā ir parādīta atšķirība starp DNS bez šūnām un cirkulējošo audzēja DNS, lai salīdzinātu līdzās.
Kopsavilkums - DNS bez šūnām pret cirkulējošā audzēja DNS
Cirkulējošās nukleīnskābes tiek izmestas asinsritē, izmantojot regulētus vai nejaušus mehānismus. DNS bez šūnām un cirkulējošā audzēja DNS ir divu veidu cirkulējošās nukleīnskābes. Šūnu nesaturoša DNS ir dažādas DNS formas, piemēram, cirkulējoša audzēja DNS, bezšūnu mitohondriju DNS, bezšūnu augļa DNS, kas brīvi cirkulē asinīs, savukārt cirkulējošā audzēja DNS ir fragmentēta audzēja DNS, kas cirkulē asinīs. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp DNS bez šūnām un cirkulējošo audzēja DNS.
