Galvenā atšķirība starp dATP un ddATP ir tāda, ka dATP nepārtrauc DNS sintēzi, savukārt ddATP spēj pārtraukt DNS sintēzi. Tas ir tāpēc, ka ddATP ir H atoms, kas pievienots pentozes cukura 3' pozīcijā, savukārt dATP ir OH grupa, kas pievienota 3' pozīcijā.
dNTP ir DNS pamatelementi. Saskaņā ar purīna vai pirimidīna bāzēm ir četri dNTP veidi - viens no tiem ir dATP. dATP slāpekļa bāze ir adenozīns. ddNTP ir nukleotīdi, ko izmanto Sangera sekvencēšanā. Ir četri ddNTP veidi. ddATP ir ddNTP.
Kas ir dATP?
Deoksiadenozīna trifosfāts ir nukleotīds, kas ir DNS celtniecības bloks. DNS polimerāzes enzīms izmanto dATP kā substrātu DNS sintēzei. dATP ir trīs sastāvdaļas: dezoksiribozes cukura molekula, adenozīns un trīs fosfātu grupas. Tāpēc tas ir purīna nukleozīdu trifosfāts. dATP ķīmiskā formula ir C10H16N5O12 P3, un tā molekulmasa ir 491,182.
01. attēls: dATP
dATP atšķiras no ATP (adenozīntrifosfāta) cukura komponentu ziņā. ATP satur ribozes cukuru. dATP bāzes pāri ar uracila nukleotīdu transkripcijas laikā. Papildus dalībai DNS sintēzē dATP var darboties kā enerģiju pārnesoša molekula, lai saglabātu arī šūnu dzīvotspēju. Augsts dATP līmenis organismā ir toksisks, jo tas var darboties kā nekonkurējošs enzīma ribonukleotīdu reduktāzes inhibitors. Tas var izraisīt imūnsistēmas darbības traucējumus.
Kas ir ddATP?
Dideoksiadenozīna trifoafāts jeb ddATP ir viens no četriem nukleotīdu veidiem, ko izmanto Sangera sekvencēšanas metodē. Strukturāli ddATP ir arī trīs komponenti, kas ir līdzīgi dATP. Tie ir adenīna bāze, dezoksiribozes cukurs un trīs fosfāti.
2. attēls: ddATP
Atšķirībā no dATP, ddATP nav OH grupas pentozes cukura 3' pozīcijā, lai veidotu fosfodiestera saiti ar blakus esošo nukleotīdu un turpinātu ķēdes pagarinājumu. Tam ir H atoms 3' pozīcijā. Tāpēc, tiklīdz ddATP ir iekļauts, DNS sintēze beidzas. Tas ir Sangera sekvencēšanas pamatprincips. Tāpēc ddATP darbojas kā ķēdes pagarinājuma inhibitors Sangera sekvencēšanā. Sangera sekvencē tiek izmantotas četras caurules, un ddATP tiek pievienots vienai caurulei.
Kādas ir līdzības starp dATP un ddATP?
- dATP un ddATP ir nukleotīdi.
- Abus veido adenīns, dezoksiriboze un trīs fosfāti.
- Tie ir organiski savienojumi.
- Gan dATP, gan ddATP tiek pievienoti mēģenēs, izmantojot Sangera secību.
Kāda ir atšķirība starp dATP un ddATP?
dATP ir OH grupa pentozes cukura 3' pozīcijā, savukārt ddATP trūkst OH grupas pentozes cukura 3' pozīcijā. Turklāt dATP ir monomērs, ko izmanto DNS sintēzē, savukārt ddATP tiek izmantots, lai pārtrauktu ķēdes pagarinājumu Sangera sekvencēšanas laikā. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp dATP un ddATP. Turklāt dATP var veidot fosfodiestera saites, savukārt ddATP nevar veidot fosfodiestera saites.
Zemāk infografikā ir parādītas vairāk atšķirību starp dATP un ddATP tabulas veidā, lai salīdzinātu līdzās.
Kopsavilkums - dATP pret ddATP
Īsi sakot, dATP ir DNS sintēzes priekštecis, savukārt ddATP ir nukleotīds, ko izmanto DNS sintēzes pārtraukšanai Sangera sekvencēšanā. Turklāt dATP ir OH grupa pentozes cukura 3' pozīcijā, un tas ļauj veidot fosfodiestera saiti ar nākamo nukleotīdu. Tikmēr ddATP trūkst OH grupas 3ʹ pozīcijā; līdz ar to tas nespēj veidot fosfodiestera saiti ar nākamo nukleotīdu. Tā rezultātā DNS secība pārtrauc savu pagarināšanos. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp dATP un ddATP.
