Galvenā atšķirība starp CRISPR un CRISPR Cas9 ir tāda, ka CRISPR (kopā regulāri izvietots īss palindromisks atkārtojums) ir dabiski sastopams prokariotu imūnās aizsardzības mehānisms, savukārt CRISPR cas9 ir RNS vadīta Cas9 nukleāze, kas ir daļa no CRISPR adaptīvās sistēmas. imūnsistēma.
CRISPR ir pretvīrusu aizsardzības imūnsistēma, kas atrodama baktērijās un arhejās. Tā ir DNS sekvenču saime, kas atrodama baktēriju genomā. Tas sastāv no starpliku sekvencēm, kas iegūtas no bakteriofāgu DNS fragmentiem, kas tos iepriekš bija inficējuši. Turpmākajās vīrusu infekcijās baktērijas izmanto šīs sekvences, lai iznīcinātu vīrusa DNS. CRISPR sekvencēm ir īsi palindromiski atkārtojumi un starplikas. Turklāt CRISPR atkārtotajām starplikas sekvencēm bieži ir saistīti gēni, kas kodē Cas proteīnus. Cas9 ir RNS vadīta endonukleāze. Kopā ar CRISPR sekvencēm Cas9 proteīns darbojas kā adaptīva imūnsistēma baktērijās pret bakteriofāgiem.
Kas ir CRISPR?
CRISPR apzīmē Clustered Regularly Interspaced Short palindromic Repeats. Tā ir DNS sekvenču kopa, kas atrodama baktēriju genomā. Tas darbojas kā dabisks aizsardzības mehānisms baktērijām, un tas pirmo reizi tika identificēts E. coli. Baktērijās tas darbojas kā adaptīva imūnaizsardzība, īpaši pret bakteriofāgiem. Tāpēc tas ir secībai specifisks mehānisms.
01. attēls: CRISPR
CRISPR sistēma satur vairākas īsi segmentētas DNS atkārtojumu sekvences. Šie atkārtojumi ir palindromiski, tiem ir tāda pati bāzes secība, lasot no 5' līdz 3', bet otrs nodrošina tādu pašu secību, lasot no 3' līdz 5'. Turklāt atkārtojumi ir identiski. Tās atrodas starp īsām “starplīnijas” DNS sekvencēm, kas nav identiskas. Bet šīs starplikas DNS sekvences ir līdzīgas vai sakrīt ar svešu bakteriofāgu DNS. Gēni, kas saistīti ar CRISPR, ir pazīstami kā CRISPR saistītie gēni vai Cas gēni. Cas gēni kodē Cas proteīnus, kas ir helikāzes vai nukleāzes. Helikāzes atvieno DNS, bet nukleāzes sagriež DNS. Kopumā, ņemot vērā CRISPR, tā ir baktēriju imūnsistēma, kas darbojas pret bakteriofāgiem (baktērijām, kas inficē vīrusus).
Kas ir CRISPR Cas9?
Cas9 vai CRISPR saistītais proteīns 9 ir baktēriju RNS vadīta endonukleāze. Tāpēc tas ir enzīms, kas atpazīst un sagriež mērķa DNS (īpaši bakteriofāga DNS), kas ir komplementāra vadošajai RNS. Tas veic šķipsnai raksturīgu šķelšanos. Cas9 proteīnu kodē ar CRISPR saistīts gēns. CRISPR cas9 ir RNS vadīta CRISPR-Cas9 nukleāzes sistēma, ko var izmantot kā RNS programmējamu DNS mērķauditorijas atlases un rediģēšanas platformu genoma rediģēšanai, transkripcijas perturbācijai, epiģenētiskai modulācijai un genoma attēlveidošanai. Šī CRISPR cas9 sistēma ir ļoti populāra pašreizējās genoma rediģēšanas sistēmās.
2. attēls: CRISPR Cas9
Pašlaik CRISPR/Cas9 sistēma tiek izmantota, lai mainītu vai modificētu zīdītāju genomu, izmantojot transkripcijas represijas vai aktivizēšanu. Zīdītāju šūnas var reaģēt uz CRISPR / Cas9 izraisītiem DNS pārtraukumiem, pieņemot labošanas mehānismu. To var veikt, izmantojot nehomologu galu savienošanas metodi (NHEJ) vai uz homoloģiju vērstu remontu (HDR). Abi šie remonta mehānismi notiek, ieviešot divpavedienu pārtraukumus. Tā rezultātā notiek zīdītāju gēnu rediģēšana. NHEJ var izraisīt gēnu mutāciju ablāciju, un to var izmantot, lai radītu funkciju zudumu. HDR var izmantot, lai ieviestu specifiskas punktveida mutācijas vai dažāda garuma DNS segmentus. Pašlaik CRISPR/Cas sistēma tiek izmantota ārstniecības, biomedicīnas, lauksaimniecības un pētniecības jomās.
Kādas ir līdzības starp CRISPR un CRISPR Cas9?
- Cas9 ir daļa no CRISPR Cas sistēmas.
- Crisper cas9 sistēma ir imūnsistēma, kas dabiski atrodama baktērijās.
Kāda ir atšķirība starp CRISPR un CRISPR Cas9?
CRISPR ir baktēriju genomā atrodamu DNS sekvenču kopums, kas darbojas kā dabiska aizsardzības sistēma pret bakteriofāgiem. Tas sastāv no regulāri izvietotiem īsiem palindromiskiem atkārtojumiem, starplikām un saistītiem gēniem. Turpretim cas9 ir ar CRISPR saistīts proteīns 9, kas ir RNS vadīts endonukleāzes enzīms. Tas atpazīst un šķeļ vīrusu DNS dubultās virknes. Faktiski tā ir daļa no CRISPR aizsardzības sistēmas. Tātad šī ir galvenā atšķirība starp CRISPR un CRISPR cas9.
Kopsavilkums - CRISPR pret CRISPR Cas9
CRISPR Cas sistēma ir mikrobu aizsardzības sistēma. CRISPR ir DNS sekvenču kopa, kas sastāv no palindromiskiem īsiem atkārtojumiem, starpliku sekvencēm un saistītiem gēniem. Cas9 ir viens Cas proteīns, kas ir RNS vadīta endonukleāze. CRISPR un Cas9 proteīns veido imūnsistēmu, kas darbojas pret bakteriofāgu infekcijām baktērijās. Cas9 proteīns spēj sašķelt svešu vīrusu DNS un tos izjaukt. CrRNA vada cas9, lai atpazītu vīrusa DNS. Tāpēc CRISPR cas9 sistēma ir dabiska imūnsistēma, kas atrodama baktērijās pret vīrusiem. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp CRISPR un CRISPR cas9.
