Galvenā atšķirība starp konservēto un konsensa secību ir tāda, ka konservētā secība attiecas uz līdzīgām nukleīnskābju vai aminoskābju sekvencēm, kas sastopamas dažādās vai vienādās sugās paaudžu laikā, savukārt konsensa secība ir bieži sastopama nukleotīdu secība vai atrasta aminoskābju secība. ļoti konservētā DNS, RNS vai proteīna reģionā.
Organismiem ir līdzīgas, kā arī atšķirīgas īpašības. Pētot organismu savstarpējās attiecības un tos klasificējot, ļoti svarīgs ir organismu genoms jeb ģenētiskā uzbūve. Ir dažas nukleotīdu vai aminoskābju sekvences, kas ir izplatītas dažādiem organismiem. Konservēta secība ir nukleīnskābes vai aminoskābju secība, kas ir konsekventa starp sugām. Tāpēc tie ir filoģenētiski svarīgi, veidojot filoģenētiskos kokus. Konservētās sekvencēs ir specifiskas nukleotīdu sekvences, kas ir biežāk sastopamas. Tās ir zināmas kā konsensa secības.
Kas ir saglabātā secība?
Konservēta secība ir nukleīnskābes vai aminoskābju secība, kas ir līdzīga starp sugām. Tāpēc tas ir konsekvents visās sugās visā evolūcijas laikā. Parasti šīs sekvences uztur dabiskā atlase. Tie paliek nemainīgi tālu filoģenētiskajā kokā. Tādējādi konservētas sekvences ir svarīgas filoģenētisko koku veidošanā. Tiek uzskatīts, ka ļoti konservētām sekvencēm bieži ir svarīga funkcionāla vērtība. Tie ir noderīgi arī ģenētisko slimību identificēšanā. Tomēr konservētas sekvences var būt kodējošas vai nekodējošas nukleīnskābju sekvences. Turklāt konservētās sekvences uzrāda lēnāku mutāciju ātrumu. Tādējādi to sastāvā ir ļoti minimālas izmaiņas; dažreiz tie neuzrāda izmaiņas paaudžu garumā.
Attēls 01: saglabāta secība
Ribosomu RNS komponenti ir sastopami visās dzīves jomās, homeoboksa sekvences eikariotos un tmRNS baktērijās ir vairāki ļoti konservētu secību piemēri. Konservētu secību identificēšana ir vienkārša, ja tiek izmantotas bioinformātikas pieejas, īpaši secību pielīdzināšanas rīks. Turklāt vairāku secību izlīdzināšana atvieglo konservētu secību vizualizāciju.
Kas ir konsensa secība?
Konsensa secība ir secība, kas parasti atrodama noteiktā DNS vai RNS konservētajā reģionā. Tā ir ļoti specifiska nukleotīdu secība. Piemēram, E. coli promotoros ir konsensa secība pie -10 kā TATAAT (Pribnow box), kas ir ļoti konservētas sekvences. Tāpat ir vēl viena vienprātības secība: TTGACA arī E. coli promotoros pie -35. Vienprātības secības ir zināmas arī kā “kastes”.
2. attēls: vienprātības secība
Papildus DNS un RNS olb altumvielām ir arī konsensa aminoskābju sekvences. Proteīnu saistošās vietas bieži attēlo konsensa secības. Restrikcijas enzīmiem ir arī konsensa sekvences. Turklāt savienojuma vietas ir arī konsensa secības. Līdzīgi kā konservētās sekvences, konsensa secības var aprēķināt un vizualizēt ar bioinformātikas rīkiem.
Kādas ir līdzības starp saglabāto un konsensa secību?
- Konservētās un konsensa sekvences ir nukleīnskābju vai aminoskābju sekvences, kas ir kopīgas dažādām sugām.
- Gan konservētās, gan konsensa secības var vizualizēt ar bioinformātikas rīkiem.
- Tos plaši izmanto molekulārajā bioloģijā.
Kāda ir atšķirība starp saglabāto un konsensa secību?
Konservētā secība ir nukleīnskābes vai aminoskābju secība, kas ir konsekventa starp sugām, savukārt konsensa secības ir ļoti specifiskas un bieži sastopamas bāzes vai aminoskābes noteiktā konservētajā reģionā. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp konservēto un konsensa secību. Turklāt vēl viena atšķirība starp konservēto un konsensa secību ir tāda, ka konservētās sekvences ir filoģenētiski svarīgas, savukārt konsensa sekvences bieži ir proteīnu saistīšanās vietas, savienojuma vietas, restrikcijas enzīmu griešanas vietas utt.
Kopsavilkums - saglabātā secība pret konsensa secību
Konservētās sekvences ir nukleīnskābju vai proteīnu sekvences, kas ir līdzīgas dzīvām sugām. Promotors, ribosomu saistīšanās vieta, replikācijas sākums un histona proteīna aminoskābju secība ir vairāki konservētu secību piemēri. Turpretim konsensa sekvences ir specifiskas bāzes vai aminoskābes, kas biežāk atrodamas noteiktā konservētā secībā. -10 kastītes, -35 kastītes E. coli promotora, proteīnu saistīšanās vietas, savienojuma vietas un restrikcijas enzīmu atpazīšanas vietas ir vairāki konsensa secību piemēri. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp saglabāto un konsensa secību.
