Galvenā atšķirība starp Shine Dalgarno un Kozak sekvenci ir tāda, ka Shine Dalgarno sekvence ir ribosomu saistīšanās vieta baktēriju un arheālo vēstnešu RNS, savukārt Kozaka sekvence ir proteīna translācijas iniciācijas vieta lielākajā daļā eikariotu messenger RNS.
Shine Dalgarno un Kozak secības ir divas konsensa secības, kas ir ļoti svarīgas tulkošanas uzsākšanai. Molekulārajā bioloģijā translācija ir process, kurā citoplazmas ribosomas pēc transkripcijas procesa sintezē olb altumvielas. Tulkošanā mRNS (ziņnesis RNS) tiek dekodēta ribosomā, lai ārpus kodola izveidotu specifisku aminoskābju ķēdi. Parasti ribosoma inducē dekodēšanas procesu, atvieglojot komplementāru tRNS antikodonu sekvenču saistīšanos ar mRNS kodoniem. Tulkošana notiek trīs posmos: iniciēšana, pagarināšana un izbeigšana.
Kas ir Shine Dalgarno Sequence?
Shine Dalgarno sekvence ir ribosomu saistīšanās vieta baktēriju un arheālo vēstnešu RNS. Tas parasti atrodas aptuveni 8 bāzes augšpus starta kodona AUG. Šī RNS secība palīdz piesaistīt ribosomas ziņojuma RNS, saskaņojot ribosomu ar mRNS sākuma kodonu. Tādējādi tas sāk olb altumvielu sintēzi. Pēc vervēšanas tRNS var pievienot aminoskābes secīgi, kā to nosaka mRNS kodoni. Šī īpašā secība ir izplatīta baktērijās, bet retāk sastopama arhejās. Turklāt tas ir arī hloroplastu un mitohondriju transkriptos. Shine Dalgarno secību pirmo reizi ierosināja Austrālijas zinātnieki Džons Šīns un Lina Dalgarno. Sešu bāzu konsensa secība ir AGGAGG. Piemēram, Escherichia coli secība ir AGGAGGU.
Attēls 01: Spodrināt Dalgarno secību
Iniciācijas vietas (AUG) izvēle ir atkarīga no mijiedarbības starp ribosomas 30S apakšvienību un mRNS veidni. Pirimidīnu bagātais reģions 30S apakšvienības 16srRNS komponentā saistās ar purīnu bagāto reģionu, kas pazīstams kā Shine Dalgarno secība augšpus AUG iniciācijas kodona mRNS. Turklāt iniciācijas kompleksa veidošanās laikā šīs komplementārās nukleotīdu sekvences savienojas, veidojot divpavedienu RNS struktūru. Tas atvieglo mRNS saistīšanos ar ribosomu tādā veidā, ka iniciācijas kodons tiek novietots ribosomas P vietā.
Kas ir Kozaka secība?
Kozaka secība ir proteīna translācijas iniciācijas vieta lielākajā daļā eikariotu mRNS. Šo secību sauc arī par Kozaka konsensa secību. Kozaka secība ir optimālā secība translācijas uzsākšanai eikariotos. Šī secība ir neatņemams olb altumvielu regulēšanas aspekts. Tas ir ļoti svarīgi arī vispārējai šūnu veselībai. Tas palīdz koriģēt proteīnu translāciju no ģenētiskajiem ziņojumiem, veicinot ribosomu montāžu un translācijas iniciāciju.
2. attēls: Kozaka secība
Šī secība tika nosaukta zinātnieces Merilinas Kozakas vārdā, kura to atklāja. Viņa to atklāja, detalizēti analizējot DNS genoma sekvences. Kozaka secība ir 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Lielie burti norāda uz konservētām bāzēm, bet mazie burti norāda uz parastajām mainīgajām bāzēm. R norāda uz purīnu (adenīnu vai guanīnu), kas vienmēr atrodas šajā vietā.
Kādas ir līdzības starp Shine Dalgarno un Kozak secību?
- Shine Dalgarno un Kozak secības ir divas konsensa secības, kas ir ļoti svarīgas tulkošanas uzsākšanā.
- Abas ir RNS sekvences.
- Ribosomas mazākā apakšvienība saistās ar abām sekvencēm.
- Abas sekvences mediē pareizu ribosomu montāžu un translācijas iniciāciju.
- Tie ir olb altumvielu regulēšanas un vispārējās šūnu veselības neatņemami aspekti.
Kāda ir atšķirība starp Shine Dalgarno un Kozak Sequence?
Shine Dalgarno sekvence ir ribosomu saistīšanās vieta, kas atrodama baktēriju un arheālo vēstnešu RNS, savukārt Kozaka sekvence ir proteīna translācijas iniciācijas vieta, kas atrodama lielākajā daļā eikariotu vēstnešu RNS. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp Shine Dalgarno un Kozak secību. Turklāt Shine Dalgarno secība ir 5'AGGAGGU3', savukārt Kozaka secība ir 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
Šajā infografikā tabulas veidā ir norādītas atšķirības starp Shine Dalgarno un Kozak sekvencēm, lai salīdzinātu līdzās.
Kopsavilkums - Shine Dalgarno vs Kozak Sequence
Shine Dalgarno un Kozak sekvences ir divas konsensa RNS sekvences, kas ir ļoti svarīgas ribosomu montāžai un translācijas ierosināšanai. Shine Dalgarno sekvence ir ribosomu saistīšanās vieta baktēriju un arheālo vēstnešu RNS, savukārt Kozaka sekvence ir proteīna translācijas iniciācijas vieta lielākajā daļā eikariotu messenger RNS. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp Shine Dalgarno un Kozak secību.
