Galvenā atšķirība starp serīna un tirozīna rekombināzi ir tāda, ka serīna rekombināzē serīns ir nukleofīlā aminoskābe, ko ferments izmanto, lai uzbruktu DNS vietai specifiskas rekombinācijas laikā, savukārt tirozīna rekombināzē tirozīns ir izmantotā nukleofīlā aminoskābe. ar fermentu, lai uzbruktu DNS vietai specifiskas rekombinācijas laikā.
Vietnei specifiska rekombinācija (konservatīva vietai specifiska rekombinācija) ir ģenētiskās rekombinācijas tehnikas veids, kurā DNS virknes apmaiņa notiek starp segmentiem, kuriem ir noteikta sekvences homoloģijas pakāpe. Vietnei raksturīgās rekombināzes regulē vietai raksturīgo rekombinācijas procesu. Šie fermenti ir sagrupēti divās ģimenēs kā serīna rekombināžu saime un tirozīna rekombināžu saime. Nosaukumi nāk no konservētiem nukleofīlo aminoskābju atlikumiem, kas atrodas iepriekš minētajās divās rekombināžu klasēs, kuras izmanto, lai uzbruktu DNS un kas ar to kļūst kovalenti saistītas virknes apmaiņas laikā vietai specifiskā rekombinācijā.
Kas ir serīna rekombināze?
Vietnei specifiskās rekombinācijas metodē divas īsas DNS sekvences ("mērķa vietas") tiek nogrieztas noteiktos punktos abos pavedienos, un nogrieztie gali tiek atkārtoti savienoti ar jauniem partneriem. Vietnei specifiskas rekombinācijas tehnoloģijas ir genoma instrumenti gēnu inženierijā, kas ir atkarīgi no rekombināzes enzīmiem, lai aizstātu DNS mērķa sadaļu. Ir konstatēts, ka daudzas vietnei specifiskas rekombinācijas sistēmas veic šos DNS pārkārtojumus dažādiem mērķiem. Bet visi šie rekombināzes enzīmi pieder divām ģimenēm. Serīna rekombināze ir viena no tām. Tie var veicināt līdz pat trīs veidu DNS pārkārtojumiem: integrāciju, izgriešanu un inversiju.
01. attēls: serīna rekombināze
Vietai specifiskās rekombināzes, piemēram, serīna rekombināze, veic DNS pārkārtošanos, atpazīstot un saistoties ar īsu DNS sekvenci (mērķa vietu), kurā tās sašķeļ DNS mugurkaulu. Vēlāk notiek divu DNS spirāļu apmaiņa un DNS virkņu atkalapvienošanās. Serīna rekombināzē serīns ir aminoskābe, ko ferments izmanto, lai uzbruktu DNS vietai specifiskas rekombinācijas laikā. DNS šķelšanās laikā proteīna-DNS saite veidojas, izmantojot pāresterifikācijas reakciju. Fosfodiestera saite tiek aizstāta ar fosfoserīna saiti starp 5'fosfāta grupu šķelšanās vietā un konservēta serīna atlikuma hidroksilgrupu. Jaunā saite uzglabā enerģiju, kas tiek tērēta DNS šķelšanai mērķa vietā. Šo enerģiju vēlāk izmanto, lai atkārtoti savienotu DNS ar attiecīgo dezoksiribozes hidroksilgrupu otrā vietā. Serīna rekombināžu piemēri ir serīna rezolvazes/invertāzes un serīna integrāzes.
Kas ir tirozīna rekombināze?
Tirozīna rekombināze ir cita enzīmu klase, kas regulē konservatīvu vietai specifisku rekombināciju. Kā aprakstīts iepriekš, tirozīna rekombināze arī veic DNS pārkārtošanos tādā pašā veidā, atpazīstot un saistoties ar īsu DNS sekvenci (mērķa vietu), kurā tie sašķeļ DNS mugurkaulu. Vēlāk notiek divu DNS spirāļu apmaiņa un DNS virkņu atkārtota savienošana.
2. attēls: tirozīna rekombināze
Bet tirozīna rekombināzē tirozīns ir aminoskābe, ko ferments izmanto, lai uzbruktu DNS vietai specifiskas rekombinācijas laikā. Šīs klases kopīgā iezīme ir konservēts nukleofīlais tirozīna atlikums, kas uzbrūk šķeļveida DNS fosfātam, veidojot 3'-fosfotirozīna saiti. Tirozīna rekombināzes (A1) un tirozīna integrāzes (A2) ir ievērojamākās enzīmu grupas tirozīna rekombināzes enzīmu saimē.
Kādas ir serīna un tirozīna rekombināzes līdzības?
- Tie ir rekombināzes enzīmu klase.
- Abas regulē vietnei raksturīgo rekombināciju.
- Tās ir olb altumvielas.
- Galvenā ķīmiskā reakcija abām ir vienāda.
- Abas katalizē pāresterifikācijas reakcijas.
Kāda ir atšķirība starp serīnu un tirozīna rekombināzi?
Serīna rekombināzē serīns ir nukleofīlā aminoskābe, ko ferments izmanto, lai uzbruktu DNS vietai specifiskas rekombinācijas laikā. No otras puses, tirozīna rekombināzē tirozīns ir nukleofīlā aminoskābe, ko ferments izmanto, lai uzbruktu DNS vietai specifiskas rekombinācijas laikā. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp serīna un tirozīna rekombināzi. Serīna rekombināzes kopīgā iezīme ir tāda, ka tā veido fosfoserīna saiti ar DNS, bet tirozīna rekombināze veido fosfotirozīna saiti ar DNS vietas specifiskās rekombinācijas procesa laikā.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir norādītas atšķirības starp serīnu un tirozīna rekombināzi.
-
Atšķirība starp serīnu un tirozīna rekombināzi tabulas formā
Kopsavilkums - serīns pret tirozīna rekombināzi
Rekombinācija var notikt starp līdzīgām DNS molekulām kā homologu rekombinācijā vai atšķirīgām molekulām kā nehomologu rekombinācijā. Vietnei specifiska rekombinācija ir ģenētiskās rekombinācijas veids, kurā DNS virknes apmaiņa notiek starp segmentiem, kuriem ir vismaz noteikta sekvences homoloģijas pakāpe. To katalizē rekombināzes. Lielākā daļa rekombināžu ir sagrupētas divās ģimenēs: serīna rekombināze un tirozīna rekombināze. Serīna rekombināze izmanto serīnu kā nukleofīlo aminoskābi, lai uzbruktu DNS vietai specifiskā rekombinācijas procesa laikā. Tirozīna rekombināze izmanto tirozīnu kā nukleofīlo aminoskābi, lai uzbruktu DNS vietai specifiskā rekombinācijas procesa laikā. Tāpēc šī ir galvenā atšķirība starp serīna un tirozīna rekombināzi.
