Galvenā atšķirība starp kandidātgēnu un GWAS ir tāda, ka kandidātgēnu pieeja pēta ģenētiskās variācijas nelielā skaitā iepriekš noteiktu interesējošo gēnu, savukārt GWAS pēta visu genomu, lai noteiktu kopēju ģenētisko variāciju, kas ir aiz konkrēta slimības stāvokļa.
Kandidātu gēnu pieeja un genoma mēroga asociācijas pētījumi (GWAS) ir divas metodes, kas ir svarīgas, lai noteiktu ģenētisko uzņēmību pret slimībām. Kandidātgēnu pieeja ir balstīta uz iepriekš noteiktu nelielu gēnu skaitu, savukārt GWAS pamatā ir visa genoma pārbaude. Tādējādi kandidāta gēnu pieejai ir nepieciešamas iepriekšējas zināšanas par gēniem, kas ir saistīti ar slimību, atšķirībā no GWAS.
Kas ir Gēnu kandidāts?
Kandidāta gēnu pieeja ir viena no metodēm, kas pēta saistību starp ģenētisko variāciju iepriekš noteiktos interesējošos gēnos un fenotipiem vai slimības stāvokļiem. Šajā pieejā ir nepieciešamas iepriekšējas zināšanas par gēna bioloģisko funkcionālo ietekmi uz konkrēto pazīmi vai slimību. Pamatojoties uz šīm zināšanām, tiek atlasīts neliels skaits gēnu un analizētas ģenētiskās variācijas.
Attēls 01: Kandidāta gēnu pieeja
Šajā pieejā gēnu atlase tiek veikta, pamatojoties uz bioloģisko, fizioloģisko un funkcionālo saistību ar attiecīgo slimību. Šī pieeja bieži tiek veidota kā gadījuma kontroles pētījums.
Kas ir GWAS?
GWAS apzīmē genoma mēroga asociācijas pētījumu. Tas attiecas arī uz visa genoma asociācijas pētījumiem. Šie pētījumi galvenokārt koncentrējas uz novērošanas pētījumiem. Viņi analizē dažādu indivīdu ģenētiskos variantus, kas parasti saistīti ar noteiktu pazīmi. Viss genoms ir svarīgs GWAS analīzei.
GWAS ir svarīgs instruments, lai analizētu viena nukleotīda polimorfismus, kas saistīti ar dažādām slimībām. Tas ir dažādu viena nukleotīda polimorfismu salīdzinošs pētījums plašā populācijā. GWAS pētījuma izlase ir ļoti augsta; tāpēc tas tiek izmantots arī šķērsgriezuma kohortas pētījuma formātā.
2. attēls: GWAS
Pirmais GWAS pētījums tika veikts saistībā ar miokarda infarktu un ar miokarda infarktu saistīto gēnu analīzi. Pašlaik GWAS ir svarīga loma sarežģītu slimību ar nezināmu etioloģiju ģenētiskā fona noteikšanā.
Kādas ir līdzības starp kandidātu Gēnu un GWAS?
- Gan kandidātgēnu pieeja, gan GWAS ir metodes, kas analizē ģenētisko saistību starp genotipu un slimības fenotipu.
- Abas pieejas palīdz izprast uzņēmības pret slimībām ģenētisko pamatu.
Kāda ir atšķirība starp kandidātu Gēnu un GWAS?
Kandidāta gēnu pieeja ir balstīta uz kandidātgēniem vai iepriekš noteiktiem gēniem, savukārt GWAS pamatā ir viss genoms. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp kandidāta gēnu un GWAS. Arī kandidātgēnu pieejā gēnu atlase ir nepieciešama, kamēr tā nav nepieciešama GWAS.
Turklāt kandidātgēnu pieejai ir nepieciešamas priekšzināšanas par gēniem, kas attiecas uz šo slimību, bet tas nav nepieciešams GWAS.
Zemāk infografikā ir sniegts detalizētāks salīdzinājums saistībā ar atšķirību starp kandidātgēnu un GWAS.
Kopsavilkums - kandidāts Gēns pret GWAS
Kandidāta gēns un GWAS ir divi gēnu asociācijas pētījumi. Kandidātgēnu pieeja koncentrējas uz ģenētisko variāciju, kas saistīta ar slimību nelielā skaitā iepriekš noteiktu gēnu. Turpretī GWAS pēta ģenētiskās variācijas, kas saistītas ar slimību visā genomā. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp kandidāta gēnu un GWAS. Abas metodes ir svarīgas, lai izprastu uzņēmības pret slimībām ģenētisko pamatu.
