Galvenā atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu sekvencēšanu ir tā, ka gēnu kartēšana ir paņēmiens, kas nosaka gēna atrašanās vietu genomā un attālumus starp gēniem, savukārt gēnu sekvencēšana ir metode, kas identificē precīzu nukleotīdu secību gēns.
Gēnu kartēšana un gēnu sekvencēšana ir svarīga ģenētiskajā diagnostikā, lai noteiktu un apstiprinātu gēnu klātbūtni. Tādējādi molekulārajām metodēm, piemēram, gēla elektroforēzei un polimerāzes ķēdes reakcijai, ir svarīga loma gēnu kartes izsecināšanā. Turklāt, lai ģenerētu gēnu secību, ir svarīgi izmantot dažādas sekvencēšanas metodes, piemēram, Sangera sekvencēšanu un nākamās paaudzes sekvencēšanu.
Kas ir gēnu kartēšana?
Gēnu kartēšana ir paņēmiens, lai ģenerētu pilnīgu gēnu atrašanās vietu karti hromosomā. Hromosomu kartēšana ir sinonīms gēnu kartēšanai. Turklāt šī metode sniedz informāciju par specifiskajiem gēniem, kas atrodas hromosomā. Turklāt gēnu kartēšanā kartēšanas procesā tiek izmantotas fiziskas kartēšanas metodes.
Attēls 01: Gēnu kartēšana
Gēnu kartēšana var palīdzēt atrast hromosomu aberācijas. Tāpēc ģenētiskā karte darbojas kā diagnostikas rīks, lai noteiktu tādus apstākļus kā Dauna sindroms un Tērnera sindroms utt. Kariotipēšana ir viens no paņēmieniem, ko var izmantot ģenētiskās kartes ģenerēšanai. Krāsošana ir svarīgs paņēmiens ģenētiskās kartes izveidošanai, kurā tiek izmantoti tādi traipi kā etīdija bromīds, akridīna apelsīns un Giemsa. Gēnu kartēšana var ģenerēt arī saišu kartes, kurās notiek saistīto gēnu atrašanās vietas noteikšana.
Kas ir gēnu sekvencēšana?
Gēnu sekvencēšana ir metode, ko izmanto, lai identificētu un secinātu precīzu gēna bāzes pāru secību. Tādējādi, izmantojot gēnu sekvencēšanu, secībā var secināt adenīna, guanīna, timīna un citozīna bāzu secību. Pirmā visa genoma sekvencēšana notika mikroorganismos. Cilvēka genoma sekvencēšanas projekts bija viens no pagrieziena punktiem molekulārās bioloģijas vēsturē. Pašlaik gēnu sekvencēšanai ir svarīga loma rūpniecībā un medicīnas jomā. Tas precīzi apstiprina konkrēta gēna klātbūtni genomā.
2. attēls: gēnu sekvencēšana
Ir dažādi paņēmieni gēnu sekvencēšanai. Maksims un Gilberts bija pionieri ķīmiskās metodes ieviešanā gēnu vai DNS sekvencēšanai. Tomēr potenciāli bīstamu ķīmisko vielu izmantošana noved pie atteikšanās no ķīmiskās secības noteikšanas tehnikas. Vēlāk Sanger ieviesa secības paņēmienu, kurā netika izmantotas nekādas bīstamas ķīmiskas vielas. Tomēr pašlaik automatizētai sekvencēšanai un nākamās paaudzes sekvencēšanai ir svarīga loma konkrēta gēna secības izsecināšanā.
Kādas ir līdzības starp gēnu kartēšanu un gēnu sekvencēšanu?
- Abām metodēm ir svarīga loma ģenētiskajā diagnostikā.
- Šīs metodes spēj apstiprināt gēnu klātbūtni genomā.
- Tādas metodes kā polimerāzes ķēdes reakcija var izmantot abos procesos.
Kāda ir atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu sekvencēšanu?
Galvenā atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu sekvencēšanu ir informācija, ko ģenerē abas metodes. Gēnu kartēšana sniedz informāciju par konkrēta gēna atrašanās vietu hromosomā, savukārt gēnu sekvencēšana ģenerē informāciju par konkrēta gēna bāzes pāru secību. Tomēr abām metodēm ir nozīme gēna raksturošanā. Tādējādi abu paņēmienu pabeigšanas laiks un izmaksas atšķiras.
Tālāk esošajā infografikā ir apkopota atšķirība starp gēnu kartēšanu un gēnu sekvencēšanu.
Kopsavilkums - gēnu kartēšana pret gēnu sekvencēšanu
Gēnu kartēšana un gēnu sekvencēšana ir divas metodes, kas palīdz raksturot gēnu. Lai gan gēnu karte ļauj noteikt gēna atrašanās vietu, gēnu secība nodrošina konkrētā gēna bioķīmiskos datus. Gēnu kartēšana un gēnu sekvencēšana ir ļoti svarīga ģenētiskajos pētījumos un ģenētiskajā diagnostikā. Turklāt abas metodes tagad ir automatizētas, lai nodrošinātu, ka metodes ir ātras un precīzas. Informācija, kas iegūta, izmantojot gēnu kartēšanu un gēnu sekvencēšanu, tiek izmantota pakārtotajos procesos molekulārās diagnostikas laikā.
