Galvenā atšķirība starp 1D un 2D gēla elektroforēzi ir īpašības, ko izmanto proteīnu atdalīšanai gēla elektroforēzē. 1D gēla elektroforēze atdala olb altumvielas tikai pēc molekulmasas, savukārt 2D gēla elektroforēze atdala olb altumvielas, pamatojoties uz to izoelektrisko punktu un molekulmasu.
Olb altumvielu atdalīšana ar gēla elektroforēzi ir svarīga metode proteīnu raksturošanai. Olb altumvielām ir dažādas īpašības; tāpēc atdalīšana ir sarežģītāka, salīdzinot ar DNS atdalīšanu ar agarozes gēla elektroforēzi.
Kas ir 1D gēla elektroforēze?
1D Gēla elektroforēze, kas pazīstama arī kā vienas dimensijas gēla elektroforēze, ir proteīnu atdalīšanas metode, kuras pamatā ir molekulmasa. Olb altumvielu atdalīšana galvenokārt notiek, izmantojot poliakrilamīda gēla elektroforēzi. Pamatojoties uz gēla elektroforēzes koncepciju, molekulas atdalās pēc to molekulmasas un lādiņa īpašībām.
Tādēļ, lai nodrošinātu vienmērīgu lādiņu proteīniem, pirms gēla elektroforēzes tiek veikta apstrāde ar nātrija dodecilsulfātu (SDS). SDS denaturē olb altumvielas un nodrošina proteīna vienmērīgu negatīvu lādiņu; kad notiek elektriskā lauka pielietošana, proteīni migrē uz pozitīvo galu, pamatojoties uz to molekulmasu. Tādējādi atdalīšanas gadījumā tiek ņemts vērā tikai viens īpašums. Tāpēc šo metodi sauc par 1D gēla elektroforēzi.
Attēls 01: 1D gēla elektroforēze
1D gēla elektroforēzes laikā olb altumvielas tiek atdalītas, pamatojoties uz to molekulmasu. Šajā sakarā mazākas masas molekulas gēlā migrē ātrāk, salīdzinot ar augstas molekulmasas olb altumvielām. Tādējādi liela svara olb altumvielas paliek tuvu iedobēm.
Kas ir 2D gēla elektroforēze?
2D gēla elektroforēze vai divdimensiju gēla elektroforēze atdala olb altumvielas, pamatojoties uz divām īpašībām. Abas īpašības ir proteīna izoelektriskais punkts un molekulmasa. Šī olb altumvielu atdalīšanas metode palielina olb altumvielu atdalīšanas izšķirtspēju. Proteīna izoelektriskais punkts ir atkarīgs no pH, pie kura proteīns ir neitrāls.
2. attēls: 2D gēla elektroforēze
Tādējādi 2D gēla elektroforēzē proteīnam pirmajā dimensijā ļauj darboties ar fiksētu pH gradientu. Otrajā dimensijā olb altumvielas tiek atdalītas, izmantojot vertikālu vai horizontālu poliakrilamīda gēla elektroforēzi. Tādējādi olb altumvielas atdalās pēc to molekulmasas otrajā dimensijā.
Turklāt šī gēla elektroforēzes metode palielina olb altumvielu atdalīšanas izšķirtspēju. Tāpēc atdalītās olb altumvielas ir tīrākas. Tomēr tehnikas izmaksas ir daudz augstākas nekā vienas dimensijas gēla elektroforēze.
Kādas ir līdzības starp 1D un 2D gēla elektroforēzi?
- Abas metodes atdala olb altumvielas.
- Tādēļ tie ir svarīgi proteīnu raksturošanā.
Kāda ir atšķirība starp 1D un 2D gēla elektroforēzi?
Galvenā atšķirība starp 1D un 2D gēla elektroforēzi ir tāda, ka 1D gēla elektroforēze atdala olb altumvielas, pamatojoties tikai uz molekulmasu, bet 2D gēla elektroforēze atdala olb altumvielas, pamatojoties gan uz izoelektrisko punktu, gan pēc molekulmasas. Šīs pamata atšķirības starp 1D un 2D gēla elektroforēzi dēļ atšķiras arī olb altumvielu atdalīšanas izšķirtspēja un abu metožu izmaksas.2D gēla elektroforēze parāda augstu izšķirtspēju nekā 1D gēla elektroforēze. Tomēr 2D gēla elektroforēze ir dārgāka nekā 1D gēla elektroforēze.
Zemāk esošajā infografikā ir apkopota atšķirība starp 1D un 2D gēla elektroforēzi.
Kopsavilkums - 1D pret 2D gēla elektroforēze
Olb altumvielu atdalīšana ir atkarīga no daudziem faktoriem. 1D gēla elektroforēze atdala olb altumvielas, pamatojoties tikai uz molekulmasu. Tomēr divdimensiju vai 2D gēla elektroforēze palielina olb altumvielu atdalīšanas izšķirtspēju. Turklāt 2D gēla elektroforēze atdala olb altumvielas, pamatojoties uz izoelektrisko punktu un molekulmasu. Tāpēc šie dati ir svarīgi proteīnu pakārtotajai apstrādei un proteomikas jomā. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp 1D un 2D gēla elektroforēzi.
