Galvenā atšķirība starp plazmīdu un kosmīdu ir tā, ka plazmīda ir divpavedienu, apļveida un slēgta ārpushromosomu DNS, kas atrodas baktērijās un arhejās, savukārt kosmīds ir hibrīda vektoru sistēma, kas veidojas cos secības apvienošanas rezultātā. lambda fāga un baktēriju plazmīdas DNS.
Genētiskā inženierija ir biotehnoloģijas padziļināts pētījums. Gēnu inženierijas tehnika var mainīt vai mainīt dzīvo organismu genomu. Turklāt gēnu inženierija ir noderīga gēnu terapijā un ģenētisko traucējumu ārstēšanā. Pirms gēnu ievietošanas cita organisma genomā ir jāizveido rekombinantā DNS molekula, kas var pārnēsāt vajadzīgo DNS fragmentu un nonākt saimniekorganismā. Tāpēc rekombinantās DNS tehnoloģijas laikā to veic vektoru sistēma. Tādējādi vektors darbojas kā nesējs vai starpnieks starp donoru un saimniekorganismu. Plazmīds un kosmīds ir divu veidu vektori, ko parasti izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā un gēnu inženierijā. Daži ir dabiski vektori, bet daži ir mākslīgi vektori. Plazmīds ir dabisks vektors, savukārt kosmīds ir mākslīgi konstruēts vektors. Abiem veidiem ir plusi un mīnusi.
Kas ir plazmīda?
Plazmīda ir maza, apļveida, divpavedienu DNS, kas atrodas prokariotu organismos, galvenokārt baktērijās un arhejās. Tie pastāv kā slēgti apļi baktēriju iekšpusē. Turklāt plazmīdas nav genoma DNS. Tādējādi plazmīdu klātbūtne vai neesamība prokariotu šūnās neietekmē šo šūnu izdzīvošanu. Plazmīdas ir ārpushromosomu DNS. Tomēr plazmīdas nodrošina papildu priekšrocības baktērijām un arhejām. Tie satur īpašus gēnus, piemēram, rezistenci pret antibiotikām, rezistenci pret dažādiem smagajiem metāliem, makromolekulu degradāciju utt.
Turklāt plazmīdas spēj pašreplicēties, nesaistoties ar hromosomām. Tas nes gēnus vai informāciju, kas nepieciešama tās replikācijai un uzturēšanai. Turklāt tās ir neatkarīgas DNS. Šo īpašo īpašību dēļ plazmīdas ļoti plaši izmanto molekulārajā bioloģijā kā vektorus.
01. attēls: plazmīdas
DNS divpavedienu raksturs, rezistences pret antibiotikām gēni, pašreplicēšanās spēja un īpašas restrikcijas vietas ir svarīgas īpašības, kas padara plazmīdas piemērotākas kā vektora molekulas rekombinantās DNS tehnoloģijā. Turklāt plazmīdas ir viegli izolēt un pārveidot par saimniekbaktērijām.
Kas ir Cosmid?
Cosmid ir hibrīda vektoru sistēma. Tas ir mākslīgs vektors, kas izveidots, apvienojot Lambda fāga daļiņu cos sekvences un plazmīdu. Šīs cos vietas vai sekvences ir gari DNS fragmenti, kas sastāv no 200 bāzes pāriem. Tiem ir saliedēti vai lipīgi gali, kas ļauj plazmīdai iekļauties vīrusa DNS. Tāpēc cos vietas ir būtiskas DNS iesaiņošanai. Ir trīs cos vietnes, proti, cosN vietne, cosB vietne un cosQ vietne. Šīs vietas ir saistītas ar DNS virknes sašķelšanu ar termināzes aktivitāti, termināzes noturēšanu un DNS degradācijas novēršanu, ko veic attiecīgi DNāzes.
2. attēls: Kosmids
Kosmidi var replicēt vienpavedienu DNS vai divpavedienu DNS, izmantojot piemērotu replikācijas sākumu. Tie satur arī antibiotiku rezistences gēnus, kas var būt noderīgi kā marķieri transformēto šūnu atlasē. Tādējādi, līdzīgi kā plazmīdām, kosmīdi ir arī labi vektori rekombinantās DNS tehnoloģijā.
Kādas ir līdzības starp plazmīdu un kosmīdu?
- Plazmīds un kosmīds ir vektori, ko parasti izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā.
- Abi spēj pašreplicēties.
- Tiem ir replikācijas izcelsme.
- Turklāt viņiem ir vairākas klonēšanas vietnes.
- Tie satur arī pret antibiotikām rezistentus gēnus, kas ir noderīgi kā marķieri.
- Svešo DNS var ievietot abos veidos un izveidot rekombinantas molekulas.
- Abiem vektoriem ir pieejamas vienkāršas skrīninga metodes.
- Abas ir noderīgas, lai izveidotu genoma bibliotēkas.
Kāda ir atšķirība starp plazmīdu un kosmīdu?
Plazmīds un kosmīds ir divu veidu klonēšanas vektori, ko izmanto gēnu inženierijā. Plazmīdas ir mazas, apļveida divpavedienu ekstrahromosomu DNS molekulas, kas atrodas baktērijās un arhejās. No otras puses, kosmīds ir hibrīds vektors, kas izveidots no lambda fāga DNS un plazmīdas DNS cos sekvencēm. Šī ir galvenā atšķirība starp plazmīdu un kosmīdu. Turklāt plazmīdas var saturēt līdz 25 kb lielus DNS fragmentus, savukārt komīdas var saturēt līdz 45 kb lielus fragmentus. Tādējādi šī ir vēl viena atšķirība starp plazmīdu un kosmīdu.
Sīkāka informācija ir sniegta infografikā par atšķirību starp plazmīdu un kosmīdu.
Kopsavilkums - plazmīda pret kosmīdu
Plazmīda ir dabiski sastopama ekstrahromosomāla DNS, savukārt kosmīds ir fāga DNS un plazmīdas DNS hibrīds vektors. Abi ir klonēšanas vektori, ko izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā. Kosmīdi satur īpašus lipīgus galus, kas pazīstami kā cos vietas, kas nepieciešami in vitro iesaiņošanai. No otras puses, plazmīdas satur vairākas pazīmes, kas padara tās par ideāliem vektoriem gēnu inženierijā. Abi var tikt pakļauti neatkarīgai replikācijai vai in vitro iesaiņošanai baktēriju šūnās. Plazmīdas spēj saturēt svešu DNS fragmentu 25 kb garumā, savukārt kosmīdi spēj saturēt svešu DNS fragmentu 45 kb garumā. Tādējādi kosmīdi ir noderīgi klonēšanas nolūkos, lai klonētu lielākus DNS fragmentus, jo plazmīdu vektori nevar klonēt lielākus fragmentus. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp plazmīdu un kosmīdu.
