Galvenā atšķirība starp izochizomeriem un izokaudomeriem ir tā, ka izochizomeri atpazīst un atdala vienu un to pašu restrikcijas vai atpazīšanas vietu, savukārt izokaudomeri atpazīst nedaudz atšķirīgas restrikcijas vietas un šķeļ vienā un tajā pašā vietā.
Restrikcijas enzīmi jeb restrikcijas endonukleāzes ir nukleāžu veids, kas šķeļ divpavedienu DNS. Viņi spēj atpazīt specifiskas sekvences, ko sauc par restrikcijas vietām un kurām ir palindromiska izcelsme. Baktērijas ražo restrikcijas enzīmus pret svešiem patogēniem, īpaši pret vīrusiem. Tas ir aizsardzības mehānisma veids, ko parāda baktērijas. Atkarībā no fermenta struktūras un griezumu rakstura ir trīs veidu restrikcijas enzīmi, piemēram, I tipa restrikcijas enzīmi, II tipa restrikcijas enzīmi un II tipa restrikcijas enzīmi. Turklāt, atkarībā no bioķīmiskās aktivitātes un izolācijas avota, pastāv trīs veidu restrikcijas enzīmi, piemēram, izochizomeri, neoshizomeri un izokaudomeri.
Kas ir izošizomeri?
Izoshizomeri ir restrikcijas enzīmu veids, kas nāk no dažādiem avotiem, bet atpazīst un atdala vienu un to pašu restrikcijas vietu DNS. Tāpēc diviem izoshizomeriem ir viena un tā pati atpazīšanas vieta. Tie sadalās vienā un tajā pašā vietā, tāpēc tie ir raksturīgi vienai un tai pašai atpazīšanas secībai. Piemēram, restrikcijas enzīmi SphI un BbuI ir divi izošizomeri, kas atpazīst un sadalās pie CGTAC/G.
Attēls 01: Restrikcijas enzīms
Cits izoshizomeru pāris ir HpaII un MspI. Viņi abi atpazīst secību 5′-CCGG-3′ un atdala DNS. Turklāt Bsp EI un Acc III ir arī izoshizomeri, kas ir attiecīgi no Bacillus sugām un Acinetobacter calcoaceticus. Izoshizomerus var izolēt no dažādām baktērijām. Tā kā tie nāk no dažādām baktērijām, to ierobežošanas nosacījumi var atšķirties viens no otra.
Kas ir izokaudomeri?
Izokaudomeri ir restrikcijas enzīmu veids, kas atpazīst nedaudz atšķirīgas sekvences, taču tie sadalās vienā un tajā pašā vietā, veidojot vienādus galus. Isocaudomers nāk arī no dažādām baktērijām. Sau3a un BamHI ir izokaudomeru pāris. Tie rada 5'-GATC-3' lipīgu galu pēc tās pašas vietas šķelšanās. Vēl viens izokaudomeru pāris ir NcoI no Nocardia corallina un PagI no Pseudomonas alcaligenes. Šie divi enzīmi arī saistās dažādās atpazīšanas secībās, bet tiek sagriezti vienā un tajā pašā vietā un rada tādus pašus lipīgos galus. Tāpēc griešanas gali ir savietojami viens ar otru, un tos var savienot viens ar otru. XhoI, PspXI un SalI arī ir izokaudomeri.
Kādas ir izošizomeru un izokaudomeru līdzības?
- Izoshizomeri un izokaudomeri ir divu veidu restrikcijas enzīmi.
- Diviem izoshizomeriem ir viena un tā pati gremošanas vieta, līdzīgi diviem izokaudomēriem, kuriem ir viena un tā pati gremošanas vieta.
- Tiem ir prokariotu izcelsme.
- Abām ir ierobežojuma atpazīšanas vietne, kā arī gremošanas vietne.
- Tie ražo galus, kas ir savietojami viens ar otru.
- Turklāt šie fermenti ir noderīgi instrumenti rekombinantās DNS tehnoloģijā.
Kāda ir atšķirība starp izošizomeriem un izokaudomēriem?
Izoshizomeri ir restrikcijas enzīmi, kas atpazīst vienu un to pašu DNS secību un šķeļ vienā un tajā pašā restrikcijas vietā, savukārt izokaudomeri ir restrikcijas enzīmi, kas atpazīst nedaudz atšķirīgas DNS sekvences, bet rada vienādus lipīgos galus, griežot tajā pašā vietā. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp izoshizomeriem un izokaudomēriem.
Tālāk esošajā infografikā ir parādītas atšķirības starp izochizomeriem un izokaudomēriem.
Kopsavilkums - izošizomeri pret izokaudomeri
Izoshizomeri ir restrikcijas enzīmi, kas atpazīst vienu un to pašu DNS secību un sadalās vienā un tajā pašā vietā. No otras puses, izokaudomeri ir restrikcijas enzīmi, kas atpazīst nedaudz atšķirīgas sekvences un sadalās vienā un tajā pašā vietā, veidojot vienādus galus. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp izoshizomeriem un izokaudomēriem. SphI, BbuI, HpaII un MspI ir vairāki izoshizomeru piemēri, savukārt Sau3a un BamHI ir divi izokaudomeru piemēri. Gan izoshizomerus, gan izokaudomērus dabiski ražo baktērijas.
