Galvenā atšķirība starp CDS un cDNS ir tāda, ka CDS jeb kodējošā secība ir transkripta daļa, kas faktiski tiek pārvērsta olb altumvielās, savukārt cDNS secība ir DNS secība, kas iegūta no mRNS ar reversās transkripcijas palīdzību.
Gēns ir nukleotīdu secība, kas kodē proteīnu. Tas sastāv no dažādiem reģioniem kā promotora reģions, transkripcijas iniciācijas vieta, eksoniem, sākuma kodons, introni un stopkodons. Tāpēc gēnam ir gan kodējošas, gan nekodējošas sekvences. Kodēšanas sekvences jeb CDS attiecas uz eksoniem un diviem kodoniem, kas ir sākuma kodons un beigu kodons. Tā ir secība, kas faktiski tiek pārveidota par proteīnu. Turpretim cDNS ir DNS sekvence, kas iegūta no mRNS ar reversās transkripcijas palīdzību.
Kas ir CDS?
CDS jeb kodējošā secība ir gēna daļa, kas faktiski tiek pārveidota par proteīnu. Tas sastāv no eksoniem un diviem kodoniem kā AUG kodonu un stopkodonu. Atšķirībā no cDNS, CDS nesatur divus netulkotus reģionus: 5' UTR un 3 UTR. Turklāt introni nav iekļauti CDS.
Attēls 01: Kodēšanas secība
Salīdzinot ar visu genomu un indivīdu, kodēšanas sekvences ir neliela daļa. Kodēšanas secība sastāv no nepieciešamās nukleotīdu secības, lai izveidotu proteīna aminoskābju secību.
Kas ir cDNS?
cDNS jeb komplementārā DNS ir DNS secība, kas ģenerēta no mRNS sekvences. To sintezē process, ko sauc par reverso transkripciju. Enzīms reversā transkriptāze katalizē cDNS sintēzi, un mRNS sekvence darbojas kā cDNS sintēzes veidne. Būtībā eikariotu šūnu mRNS var ekstrahēt un attīrīt, lai izveidotu cDNS. Pēc cDNS konstruēšanas no mRNS tās var klonēt baktēriju šūnā, lai izveidotu cDNS bibliotēkas. cDNS bibliotēkas ir svarīgas kodēšanas reģionu, gēnu funkciju un gēnu ekspresijas analīzei utt.
Attēls 02: cDNS
Atšķirībā no kodēšanas secības, cDNS satur divus UTR, kas ir 3' UTR un 5' UTR. Līdzīgi kā kodēšanas secībā, cDNS nesatur intronus.
Kādas ir CDS un cDNS līdzības?
- CDS un cDNS ir nukleīnskābes.
- Tie ir izgatavoti no dezoksiribonukleotīdiem.
- Gan CDS, gan CDNA nesatur intronus, kas ir nekodējoši reģioni.
- Abos ir ģenētiskais kods vai informācija, lai ražotu proteīnu.
Kāda ir atšķirība starp CDS un cDNS?
CDS jeb kodējošā secība ir gēna daļa, kas faktiski tiek pārveidota par proteīnu. No otras puses, cDNS sekvence ir DNS sekvence, kas iegūta no mRNS ar reversās transkripcijas palīdzību. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp CDS un cDNS. Turklāt CDS sastāv no eksoniem un diviem kodoniem, kas ir sākuma kodons un stopkodons. Turpretim cDNS sastāv no pilnīgas mRNS sekvences un diviem UTR.
Turklāt cDNS sintēze tiek veikta mākslīgi no mRNS ar reversās transkripcijas palīdzību, savukārt CDS ir atrodami genoma DNS.
Zemāk infografikā ir parādīti vairāk salīdzinājumu, lai saskatītu atšķirību starp CDS un cDNS.
Kopsavilkums - CDS pret cDNA
Kodēšanas secība un cDNS ir divu veidu nukleotīdu sekvences. Kodējošā secība atrodas gēnā, savukārt cDNS tiek sintezēta mākslīgi. Kodējošajai secībai ir eksoni un divi kodoni, savukārt cDNS ir mRNS secība un divi UTR. Gan CDS, gan cDNS ir tikai nukleotīdu sekvences, kas faktiski pārvēršas proteīnos. Tie nesatur intronus. Atšķirībā no CDS, cDNS sintēzes procesā ir nepieciešams reversās transkriptāzes enzīms. Arī cDNS var pārvērsties par cDNS bibliotēkām. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp CDS un cDNS.
