siRNA vs miRNA
RNS ir ļoti svarīgas molekulas, kas palīdz veidot organismu dzīvi. Nesen zinātnieki ir atklājuši nelielas RNS, ko sauc par RNS traucējumiem vai RNAi, kas darbojas pēc transkripcijas, lai kontrolētu gēnu ekspresiju. Divi galvenie mazo RNS veidi ir mikro RNS vai miRNS un maza traucējošā RNS vai siRNS. Šīs molekulas pamatā regulē gēnu ekspresiju, nomācot mērķa gēnu. Gan miRNS, gan siRNS ir ļoti līdzīgi bioģenēzes ceļi, lai gan starp tiem pastāv dažas atšķirības. MiRNS un siRNS izcelsme ir no dsRNS molekulām. Nobriedušas miRNS ir strukturāli līdzīgas siRNS molekulām.
miRNA
Mikro RNS vai miRNS ir mazas RNS molekulas, kas ir starpnieks translācijas gēnu regulācijas galīgajā pārbaudē. MiRNS atcelšana var izraisīt vēzi un citu slimību attīstību. Tāpēc miRNS nekodētajā reģionā kodētās informācijas pareiza regulēšana ir ļoti svarīga daudzos šūnu pamatprocesos.
siRNA
siRNS tiek sauktas arī par īsu traucējošu vai klusējošu RNS, un tās sastāv no divpavedienu RNS ar 20 līdz 25 bāzes pāriem. SiRNS galvenā loma ir traucēt specifisku gēnu ekspresiju ar komplementārām nukleotīdu sekvencēm. siRNS sastāv no īsas divpavedienu RNS ar fosforilētiem 5’ galiem un hidroksilētiem 3’ galiem ar diviem pārkareniem nukleotīdiem.
Kāda ir atšķirība starp siRNA un miRNA?
• miRNS iegūta no specifiskiem genoma lokusiem, savukārt siRNS iegūta no mRNS, transposoniem, vīrusiem vai heterohromatiskas DNS.
• MiRNS sintēze tiek apstrādāta no garākiem prekursoru matadata transkriptiem (primārā kodola miRNS secība ar RNāzes III endonukleāzi), savukārt siRNS sintēze tiek apstrādāta no gariem bimolekulāriem RNS dupleksiem.
• Katra miRNS matadata prekursora molekula rada vienu miRNS dupleksu, savukārt katra siRNS prekursora molekula rada vairākus siRNS dupleksus.
• siRNS sekvences ir reti konservētas, savukārt miRNS sekvences ir labi konservētas.
• Visas bāzes siRNS veicina tās mērķa specifiku, turpretim tikai 5' puse no miRNS veicina tā mērķa specifiku.
• miRNS bieži saistās ar mērķa transkriptu netulkoto 3 collu reģionu, turpretim siRNS veido komplementāru dupleksu jebkur gar mērķa mRNS.
• miRNA norāda “heteroklusēšanu”, savukārt siRNA izmanto “automātiskajai klusināšanai”.
• miRNS darbojas kā signāls, lai novērstu tulkošanu, savukārt siRNS fiziski novērš tulkošanu.
