Galvenā atšķirība starp guanidīna tiocianātu un guanidīna hidrohlorīdu ir tā, ka guanidīna tiocianāts ir spēcīgāks proteīna denaturants, ko biežāk izmanto RNS izolācijā, savukārt guanidīna hidrohlorīds ir vājāks proteīna denaturants, ko retāk izmanto RNS izolācijā.
Denaturācija ir process, kurā olb altumvielas zaudē savu ceturkšņa struktūru, terciāro struktūru un sekundāro struktūru, kas parasti atrodas to sākotnējā stāvoklī. To var izdarīt, izmantojot kādu ārēju spriegumu vai savienojumus, piemēram, stipru skābi vai bāzi, koncentrētu neorganisko sāli, organisko šķīdinātāju (spirtu, hloroformu), maisīšanu, starojumu vai siltumu. Guanidīna tiocianāts un guanidīna hidrohlorīds ir divi dažādi proteīnu denaturantu veidi.
Kas ir guanidīna tiocianāts?
Guanidīna tiocianāts (GTC) ir spēcīgāks proteīnu denaturējošs līdzeklis, ko biežāk izmanto RNS izolēšanai. To sauc arī par guanidīnija izotiocianātu (GITC). Tā kā tas ir haotropisks līdzeklis, tas ir ķīmisks savienojums, ko parasti izmanto kā vispārēju proteīnu denaturantu. Haotrops līdzeklis ir molekula ūdens šķīdumā, kas var izjaukt ūdeņraža saišu tīklu starp ūdens molekulām. Tas ietekmē citu šķīdumā esošo molekulu, piemēram, makromolekulu, piemēram, olb altumvielu un nukleīnskābju, dabiskā stāvokļa stabilitāti, vājinot hidrofobo efektu. Haotropiskie līdzekļi, piemēram, guanidīna tiocianāts, samazina kārtības daudzumu olb altumvielu struktūrā, ko veido ūdens molekulas gan masā, gan hidratācijas apvalkos ap hidrofobām aminoskābēm. Tas var izraisīt olb altumvielu denaturāciju.
Guanidīna tiocianātu var izmantot, lai deaktivizētu vīrusus, piemēram, gripu, kas izraisa tādas slimības kā Spānijas gripa 1918. gadā. Tāpēc to var izmantot medicīnas vai slimnīcas iestatījumos. Turklāt guanidīna tiocianātu izmanto arī šūnu un vīrusu daļiņu lizēšanai RNS un DNS ekstrakcijās. Šeit guanidīna tiocianāta funkcija ir palīdzēt lizēšanai un novērst RNāzes enzīmu un DNāzes enzīmu aktivitāti, denaturējot. Šie fermenti citādi sabojātu ekstraktu (RNS vai DNS).
Kas ir guanidīna hidrohlorīds?
Guanidīna hidrohlorīds (GdnHCl) ir vājāks proteīna denaturants, ko retāk izmanto RNS izolēšanai. To sauc arī par guanidīna hlorīdu (GdmCl). Tas ir guanidīna hidrohlorīda sāls. Guanidīna hidrohlorīds ir haotropisks un viens no denaturantiem, ko izmanto proteīnu locīšanas fizikāli ķīmiskajos pētījumos.
Attēls 01: Guanidīna hidrohlorīds
Guanidīna hidrohlorīdam ir arī spēja samazināt enzīmu aktivitāti un palielināt hidrofobo molekulu šķīdību. Parasti augstākās guanidīna hidrohlorīda koncentrācijās olb altumvielas zaudē sakārtoto struktūru. Šajā guanidīna hidrohlorīda koncentrācijā olb altumvielas mēdz nejauši savērpties. Medicīnas vai slimnīcas apstākļos guanidīna hidrohlorīds ir indicēts, lai mazinātu muskuļu vājuma un vieglas noguruma simptomus, kas saistīti ar Ītona-Lamberta sindromu. Turklāt guanidīna hidrohlorīda lietošanas blakusparādības var būt perist altika, caureja un letāls kaulu smadzeņu nomākums.
Kādas ir līdzības starp guanidīna tiocianātu un guanidīna hidrohlorīdu?
- Guanidīna tiocianāts un guanidīna hidrohlorīds ir divi dažādi proteīnu denaturantu veidi.
- Abu denaturantu struktūrās ir guanidīns.
- Tie ir haotropiski līdzekļi.
- RNS izolēšanai var izmantot abus denaturantus.
- Tos abus izmanto medicīnā vai slimnīcās.
Kāda ir atšķirība starp guanidīna tiocianātu un guanidīna hidrohlorīdu?
Guanidīna tiocianāts ir spēcīgāks proteīnu denaturants, ko biežāk izmanto RNS izolācijā, savukārt guanidīna hidrohlorīds ir vājāks proteīna denaturants, ko retāk izmanto RNS izolācijā. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp guanidīna tiocianātu un guanidīna hidrohlorīdu. Turklāt guanidīna tiocianāta ķīmiskā formula ir C2H6N4S, savukārt ķīmiskā formula ir: no guanidīna hidrohlorīda ir CH5N3HCl.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir parādītas atšķirības starp guanidīna tiocianātu un guanidīna hidrohlorīdu, lai tos varētu salīdzināt.
Kopsavilkums - guanidīna tiocianāts pret guanidīna hidrohlorīdu
Guanidīna tiocianāts un guanidīna hidrohlorīds ir divi dažādi proteīnu denaturantu veidi. Abi denaturanti ir haotropi. Guanidīna tiocianāts ir spēcīgāks proteīnu denaturants, ko biežāk izmanto RNS izolācijā, savukārt guanidīna hidrohlorīds ir vājāks proteīna denaturants, ko retāk izmanto RNS izolācijā. Tātad, šeit ir apkopota atšķirība starp guanidīna tiocianātu un guanidīna hidrohlorīdu.
