Galvenā atšķirība starp snRNS un snoRNS ir tāda, ka snRNS ietver alternatīvu pre-mRNS splicēšanu, savukārt snoRNS ietver rRNS un tRNS modificēšanu, mRNS rediģēšanu un genoma nospiedumu.
Mazā RNS ir polimēru RNS molekulas, kas sastāv no mazāk nekā 200 nukleotīdiem. Tie parasti nav kodēti. Tie pastāv starp kurjeru RNS signālu pārnēsāšanai. Mazās RNS rodas no ideālas divpavedienu RNS, ko ražo no RNS atkarīgas RNS polimerāzes darbība. Mazajām RNS ir svarīga loma šūnu diferenciācijā, augšanā un proliferācijā, apoptozē, metabolismā, migrācijā un aizsardzībā. Tāpēc mazās RNS ir svarīgi un kritiski attīstības un fizioloģijas regulatori. Maza kodola RNS un maza nukleolārā RNS ir divas mazu RNS molekulu klases.
Kas ir snRNS?
Mazā kodola RNS jeb snRNS ir mazu RNS molekulu klase, kas atrodamas eikariotu šūnu kodolā. Vidējais snRNS garums ir aptuveni 150 nukleotīdu. RNS polimerāze II vai RNS polimerāze III transkribē snRNS. Galvenā snRNS funkcija ir pirmsvēstneša RNS apstrāde kodolā. Tie arī palīdz regulēt transkripcijas faktorus vai RNS polimerāzi II un uzturēt telomērus.
Attēls 01: Mazās RNS darbības mehānisms
Ir divas snRNS klases, kuru pamatā ir kopīgas sekvences pazīmes un saistītie proteīna faktori, piemēram, RNS saistošais LSm proteīns. Abas klases ir Sm klases snRNS un Lsm klases snRNS. Sm klases snRNS sastāv no augsta uridīna satura U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 un U12. RNS polimerāze II transkribē SM klases snRNS. Pēc pre-snRNS transkripcijas tie parasti saņem 7-metilguanozīna 5' vāciņu kodolā. Pēc tam tos caur kodola porām eksportē uz citoplazmu tālākai apstrādei. Lsm klases snRNS ir augsts uridīna saturs U6 un U6atac. RNS polimerāze III transkribē Lsm klases snRNS, un tā neatstāj kodolu. Visbiežāk sastopamās cilvēka snRNS sastāvdaļas ir U1 spliceosomāla RNS, U2 spliceosomāla RNS, U4 spliceosomāla RNS, U5 spliceosomāla RNS un U6 spliceosomāla RNS.
Kas ir snoRNA?
Mazā nukleolārā RNS jeb snoRNS ir mazu RNS molekulu klase, kas vada ķīmiskās modifikācijas citās RNS, piemēram, ribosomu RNS, pārneses RNS un mazās kodola RNS. Katra snoRNS molekula modifikācijas procesa laikā ir saistīta ar aptuveni četriem galvenajiem proteīniem RNS/olb altumvielu kompleksā. SnoRNS satur antisense elementu, kas ir aptuveni 10-20 nukleotīdu. Šīs bāzes papildina secību, kas aptver nukleotīdus, kas ir vērsti uz modifikāciju pirmsRNS molekulā.
2. attēls: maza kodola RNS
Ir divas snoRNS klases. Tie ir C/D kastes snoRNS un H/ACA kastes snoRNS. C/D box snoRNS ir saistīta ar metilēšanu, un H/ACA box snoRNS ir saistīta ar pseidouridilāciju. Katra snoRNS molekula darbojas kā ceļvedis vienai vai divām mērķa RNS modifikācijām. C / D kastes snoRNS satur divus īsus konservētus secības motīvus C un D, attiecīgi netālu no snoRNS 5' un 3' galiem. Īsi reģioni, kas sastāv no 5 nukleotīdiem, izkārtojas augšpus C kastes un lejpus D kastes un veido cilmes kastes struktūru. Tādējādi C un D lodziņu motīvi tiek tuvināti. Cilmes kastes struktūra ir svarīga pareizai snoRNS sintēzei un nukleolārajai lokalizācijai. H/ACA kastes snoRNS ir sekundāra struktūra, kas sastāv no divām matadatas un diviem vienpavediena reģioniem. To parasti sauc par matadata-eņģes-matadatas-astes struktūru. H / ACA kastes snoRNS sastāv arī no diviem konservētiem motīviem H un ACA. Abi atrodas vienpavedienu reģionos. H kaste atrodas eņģē, un ACA atrodas astes reģionā. Trīs nukleotīdi veido secības 3' galu.
Kādas ir līdzības starp snRNS un snoRNS?
- snRNS un snoRNS ir mazas RNS.
- Abas ir eikariotu šūnās.
- Abas ir nekodējošas RNS molekulas.
- Turklāt viņi piedalās RNS modificēšanā transkripcijas procesa laikā.
Kāda ir atšķirība starp snRNS un snoRNS?
snRNS piedalās alternatīvā pre-mRNS savienošanā, savukārt snoRNS galvenokārt modificē RNS molekulas. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp snRNS un snoRNS. Turklāt snRNS ir aptuveni 150 nukleotīdu garas, un tās bieži ir saistītas ar proteīnu un kompleksu grupu, ko sauc par maziem kodola ribonukleoproteīniem. snoRNS ir aptuveni 60–170 nukleotīdu garas, un tās galvenokārt atrodamas kodolā.
Turklāt snRNS transkribē vai nu RNS polimerāze II, vai RNS polimerāze III, turpretim snoRNS transkribē tikai RNS polimerāze II.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir parādītas atšķirības starp snRNS un snoRNS, lai tos varētu salīdzināt.
Kopsavilkums - snRNA vs snoRNA
snRNS un snoRNS ir mazu RNS molekulu klases. snRNS piedalās alternatīvā pre-mRNS savienošanā, savukārt snoRNS galvenokārt modificē RNS molekulas. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp snRNS un snoRNS. Mazās RNS ir polimēru RNS molekulas, kas sastāv no mazāk nekā 200 nukleotīdiem un parasti nekodē. snRNS ir atrodamas eikariotu kodolā. snoRNS ir atrodamas arhejās un eikariotos. SnRNS transkripcija notiek caur RNS polimerāzi II un II, savukārt snoRNS transkripcijā ir iesaistīta tikai RNS polimerāze II. Tātad, šeit ir apkopota atšķirība starp snRNS un snoRNS.
