Galvenā atšķirība starp T4 DNS ligāzi un E. coli DNS ligāzi ir tāda, ka T4 DNS ligāze ir enzīms, kas tiek izolēts no bakteriofāga T4, savukārt E. coli DNS ligāze ir enzīms, ko izdala no baktērijas E. coli..
DNS ligāze ir specifisks enzīma veids, kas veicina DNS virkņu savienošanu kopā, veidojot fosfodiestera saiti. Tam ir svarīga loma, labojot dzīvo organismu DNS vienas virknes pārrāvumus un divšķiedru pārtraukumus. Turklāt DNS ligāze tiek izmantota gan DNS remontā, gan DNS replikācijā. Papildus iepriekš minētajiem lietojumiem DNS ligāzi plaši izmanto arī molekulārās bioloģijas eksperimentos, piemēram, rekombinantās DNS tehnoloģijā. T4 DNS ligāze un E. coli DNS ligāze ir divu veidu DNS ligāzes enzīmi.
Kas ir T4 DNS Ligāze?
T4 ligāze ir DNS savienojošais enzīms, kas ir izolēts no bakteriofāga T4. T4 bakteriofāgs ir vīruss, kas inficē Escherichia coli. T4 ligāzes enzīms ir visbiežāk izmantotā DNS ligāze molekulāri bioloģiskajos laboratorijas pētījumos. Parasti T4 ligāze katalizē divu kohēzīvu vai neasu galu dubultās DNS virknes savienošanos starp blakus esošo nukleotīdu 5' fosfāta un 3' hidroksilgrupām. Tas var arī katalizēt RNS savienošanos ar DNS vai RNS virkni dupleksā molekulā. Tomēr šis enzīms nepievienosies vienpavedienu nukleīnskābēm. Turklāt tā var arī ligēt neaso galu DNS ar daudz lielāku efektivitāti nekā E. coli DNS ligāze.
Attēls 01: T4 DNS ligāze
Šim fermentam ir nepieciešams ATP kā kofaktors. Daži gēnu inženierijas pētījumu eksperimenti jau ir radījuši aktīvākus DNS ligāzes enzīmus nekā savvaļas tipa T4 DNS ligāze. Vienā no pieejām viņi izveidoja saplūšanas enzīmu molekulu, ķemmējot T4 DNS ligāzi ar p50 vai NF-kB molekulu. Šis jaunais T4 ligāzes enzīms klonēšanas nolūkos bija par 160% aktīvāks, salīdzinot ar savvaļas tipa T4 DNS ligāzi. Turklāt optimālā temperatūra T4 DNS ligāzei, lai precīzāk katalizētu ligācijas reakciju, ir 16 °C.
Kas ir E Coli DNS Ligāze?
E. coli DNS ligāze ir enzīms, ko izdala no E. coli baktērijām. Gēns, kas atbild par E. coli DNS ligāzes veidošanos, ir lig gēns. E. coli DNS, ligāze, kā arī lielākā daļa prokariotu DNS ligāžu izmanto enerģiju, ko iegūst NAD (nikotīnamīda adenīna dinukleotīds), lai izveidotu fosfodiestera saiti.
2. attēls: E. Coli DNS ligāze
E. coli DNS ligāze ir ligācijas enzīms, kas var savienot DNS fragmentus, katalizējot fosfodiestera saišu veidošanos starp divpavedienu DNS fragmentiem, kas satur 5' fosfāta galus un 3' hidroksilgrupas galus. Turklāt tas nesaista neaso galu DNS, izņemot īpašos apstākļos, piemēram, molekulāros pieblīvēšanas apstākļos ar polietilēnglikolu. Tas arī nevar efektīvi savienot RNS ar DNS. Turklāt E. coli DNS ligāzes aktivitāti var pastiprināt DNS polimerāzes 1 klātbūtne pareizajā koncentrācijā. Tomēr, ja DNS polimerāzes 1 enzīma koncentrācija ir augstāka, tas nelabvēlīgi ietekmē E. coli DNS ligāzes aktivitāti.
Kādas ir līdzības starp T4 DNS ligāzi un E Coli DNS ligāzi?
- T4 DNS ligāze un E-coli DNS ligāze ir divu veidu DNS ligāzes enzīmi.
- Abas ir olb altumvielas, kas sastāv no aminoskābēm.
- Šie fermenti katalizē fosfodiestera saites veidošanos starp blakus esošajiem 5' fosfāta un 3' hidroksilgrupas galiem dupleksajā DNS.
- Tos plaši izmanto molekulārās bioloģijas eksperimentos, piemēram, rekombinantās DNS tehnoloģijā.
Kāda ir atšķirība starp T4 DNS ligāzi un E Coli DNS ligāzi?
T4 DNS ligāze ir enzīms, ko izdala no bakteriofāga T4, savukārt E. coli DNS ligāze ir enzīms, kas tiek izolēts no E. coli baktērijām. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp T4 DNS ligāzi un E. coli DNS ligāzi. Turklāt T4 DNS ligāzes enerģijas avots ir ATP. No otras puses, E. coli DNS ligāzes enerģijas avots ir NAD.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir parādītas atšķirības starp T4 DNS ligāzi un E coli DNS ligāzi, lai salīdzinātu līdzās.
Kopsavilkums - T4 DNS ligāze pret E Coli DNS ligāzi
T4 DNS ligāze un E. coli DNS ligāze ir divi enzīmi, kas katalizē fosfodiestera saites veidošanos starp blakus esošiem 5’ fosfāta un 3’ hidroksilgaliem dupleksajā DNS. T4 ligāze ir enzīms, ko izdala no bakteriofāga T4, savukārt E. coli DNS ligāze ir enzīms, kas tiek izolēts no E. coli baktērijām. Tātad šī ir galvenā atšķirība starp T4 DNS ligāzi un E coli DNS ligāzi.
