Galvenā atšķirība starp NAAT un PCR ir tāda, ka NAAT pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot vairākus veidus, tostarp polimerāzes ķēdes reakciju, virkņu pārvietošanu vai transkripcijas izraisītu amplifikāciju, savukārt PCR ir metode, kas pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot tikai termiskā riteņbraukšana.
Patogēnus galvenokārt identificē pēc to ģenētiskā materiāla pastiprināšanas. Lielākā daļa paņēmienu šajā jomā ir vērsti uz patogēna ģenētiskā materiāla noteikšanu, pastiprinot noteiktas sekvences reāllaikā. Tāpēc diagnostikas kontekstā rezultāti tiek iegūti ļoti ātri. NAAT, PCR, biosensors un LCR ir vairākas metodes, ko izmanto laboratorijās, lai pastiprinātu patogēna ģenētisko materiālu.
Kas ir NAAT?
Nukleīnskābes amplifikācijas tests (NAAT) ir metode molekulārajā bioloģijā, kas pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot vairākus veidus, piemēram, polimerāzes ķēdes reakciju, virkņu pārvietošanas pastiprināšanu vai transkripcijas izraisītu amplifikāciju. Ģenētiskā materiāla pastiprināšanu var veikt arī, izmantojot tādas metodes kā ligācijas ķēdes reakcija un sazarota DNS reakcija (kvantipleksa b DNS) NAAT procedūrā. NAAT izmanto Watson-Crick bāzes savienojuma specifiku. NAAT procedūrā vienpavedienu zonde vai praimera molekula tiek hibridizēta ar mērķa DNS vai RNS molekulu. Tāpēc zondes virknes dizains ir ļoti nozīmīgs, lai uzlabotu noteikšanas jutīgumu un specifiskumu. Pēc tam nākamais NAAT solis pastiprina ģenētisko materiālu, izveidojot daudzas tā kopijas noteikšanai.
Attēls 01: NAAT
NAAT pašlaik izmanto vairāku patogēnu, piemēram, Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis un SARS-COV2, noteikšanai. Turklāt NAAT tests ir izstrādāts, lai saīsinātu loga periodu. Loga periods ir laika periods no brīža, kad pacients ir inficēts, līdz brīdim, kad antivielu testi uzrāda pozitīvu rezultātu. Turklāt FDA NAAT skrīninga metodi pirmo reizi apstiprināja 1999. NAAT ir daudz priekšrocību, tostarp zema DNS vai RNS līmeņa noteikšana, augsta jutība un augsta specifika.
Kas ir PCR?
PCR ir metode molekulārajā bioloģijā, kas pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot tikai termisko ciklu. PCR apzīmē polimerāzes ķēdes reakciju. Tas ir tests, lai noteiktu ģenētisko materiālu no konkrēta organisma, piemēram, baktērijām, sēnītēm un vīrusiem. Slimību diagnostikā PCR nosaka patogēna klātbūtni, ja personai pārbaudes laikā ir patogēns. Slimību diagnostikā PCR protokolam ir vairāki posmi, tostarp paraugu ņemšana, DNS ekstrakcija, PCR un sekvencēšana. Pārbaudot patogēnus, savākto paraugu izmanto ģenētiskā materiāla (DNS vai RNS) iegūšanai. PCR procedūrai ir nepieciešamas īpašas ķīmiskas vielas, primeri un fermenti, lai PCR mašīnā, ko sauc par termisko ciklu, ražotu miljoniem ģenētiskā materiāla kopiju. Kad patogēns ir pastiprināts no PCR produkta, to var noteikt. Zinātnieki izmanto īpašu programmatūru, lai interpretētu rezultātus.
Attēls 02: PCR
Turklāt pašlaik pētījumā tiek izmantoti dažādi PCR veidi. Starp tiem ir vairākas RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD un Nested PCR. PCR ir īpaši noderīga faringīta (Streptokoku izraisīts faringīts), netipiskas pneimonijas (Chlymydia pneumoniae), masalu (Morbillivirus), hepatīta (HBV) un čūlainas uroģenitālās infekcijas (Haemophilus ducreyi) noteikšanā.
Kādas ir līdzības starp NAAT un PCR?
- NAAT un PCR ir divas svarīgas molekulāri bioloģiskās metodes, ko izmanto ģenētiskā materiāla pastiprināšanai.
- Nukleīnskābes (DNS vai RNS) pastiprina ar abām metodēm.
- Tās ir ātras un ātras metodes.
- Pašlaik slimības diagnosticēšanai tiek izmantotas abas metodes.
- Tās ir dārgākas nekā parastās metodes.
Kāda ir atšķirība starp NAAT un PCR?
NAAT ir metode molekulārajā bioloģijā, kas pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot vairākas metodes, savukārt PCR ir metode molekulārajā bioloģijā, kas pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot tikai termisko ciklu. NAAT izmanto dažādas ģenētiskā materiāla amplifikācijas metodes, piemēram, polimerāzes ķēdes reakciju, virkņu pārvietošanas amplifikāciju, transkripcijas izraisītu amplifikāciju, ligācijas ķēdes reakciju un sazarotu DNS reakciju (quantiplex b DNS). No otras puses, PCR izmanto dažādas ģenētiskā materiāla pastiprināšanas metodes, piemēram, RT-PCR. Multipleksais PCR, RAPD, Nested PCR. Tātad šī ir galvenā atšķirība starp NAAT un PCR.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir parādītas atšķirības starp NAAT un PCR, lai tos varētu salīdzināt.
Kopsavilkums - NAAT pret PCR
Laboratorijās tiek izmantoti dažādi molekulāri bioloģiskie instrumenti, lai pastiprinātu ģenētiskos materiālus. NAAT, PCR, biosensors un LCR ir vairākas šādas metodes. NAAT ir molekulāri bioloģiskā metode, kas pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot vairākus veidus, piemēram, polimerāzes ķēdes reakciju, virknes pārvietošanu vai transkripcijas izraisītu amplifikāciju. PCR ir metode molekulārajā bioloģijā, kas pastiprina ģenētisko materiālu, izmantojot termisko ciklu. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp NAAT un PCR.
