Galvenā atšķirība starp LAMP un PCR testu ir tāda, ka LAMP tiek veikta nemainīgā temperatūrā (60-650C), lai ar amplifikācijas palīdzību iegūtu DNS kopijas, kamēr tiek veikta PCR. izmantojot virkni temperatūras izmaiņu, lai ar amplifikācijas palīdzību izveidotu DNS kopijas.
LAMP un PCR ir in vitro amplifikācijas metodes, ko izmanto, lai iegūtu tūkstošiem DNS kopiju. LAMP ražotās DNS daudzums ir daudz lielāks nekā daudzums, kas iegūts ar PCR metodēm, piemēram, RT-PCR. LAMP ir jaunāka tehnika salīdzinājumā ar PCR tehniku. Bet tas ir tehniski vienkārši un viegli izpildāms apmācītam zinātniekam laboratorijas apstākļos. Tas padara to par potenciāli noderīgu metodi COVID-19 noteikšanai. Tomēr RT-PCR ir pašreizējais standarta COVID-19 tests. Lai gan šīs metodes ir labi zināmas pētniekiem un klīnicistiem, kuriem ir pieredze DNS pastiprināšanā, plašākai sabiedrībai tās joprojām var būt salīdzinoši nezināmas.
Kas ir LAMPAS pārbaude?
Cilpas mediētā izotermiskā amplifikācija (LAMP) COVID-19 testiem sākas ar paraugu ņemšanu no deguna vai rīkles, izmantojot tamponu. Paraugus var ņemt arī, izmantojot citas metodes, piemēram, gļotas no stipra klepus. Tāpat kā PCR tehnika, piemēram, RT-PCR, paraugā esošā vīrusa RNS vispirms tiek pārveidota par DNS, kas ļauj to kopēt. LAMP reakcija tiek veikta nemainīgā temperatūrā (60-650C).
Vīrusa DNS pastiprināšanos, kas ietver LAMP tehnoloģiju un reaģentus, var noteikt, kad reakcijas maisījums kļūst duļķains, jo veidojas “magnija pirofosfāts”. Šī mākoņainība ļauj zinātniekiem un ārstiem viegli diagnosticēt COVID-19. Testa rezultātu precizitāti var uzlabot, reakcijas maisījumā izmantojot īpašas fluorescējošas vai krāsu mainošas krāsvielas. Šīs krāsvielas mijiedarbojas ar vīrusa DNS, un var izmērīt gaismas vai krāsas izmaiņu intensitāti, lai iegūtu aptuveni tādu vīrusa RNS molekulu skaitu, kāds sākotnēji bija paraugā.
Kas ir PCR tests?
PCR ir ļoti izplatīta zinātniska metode, ko plaši izmanto pētniecībā un medicīnā 20–30 gadus, lai noteiktu DNS. PCR testus izmanto tieši, lai noteiktu antigēnu, nosakot vīrusa RNS. Parasti vīrusa RNS organismā atrodas pirms antivielu noteikšanas vai slimības simptomu parādīšanās. Tāpēc PCR tests var noteikt, vai kādam vīruss ir vai nav agri. Pašlaik PCR ir standarta tests COVID-19 noteikšanai. Ir dažādi PCR paņēmienu veidi, piemēram, reāllaika PCR, ligzdoto PCR, multiplekso PCR, karstās palaišanas PCR un liela attāluma PCR utt. PCR izmanto virkni temperatūras izmaiņu, lai ar amplifikācijas palīdzību iegūtu DNS kopijas.
RT-PCR ir īpaša PCR tehnikas versija. To lieto, ja tiek noteikta RNS. Tagad to izmanto COVID-19 testēšanai. RT-PCR ir diezgan jutīga un uzticama metode. RT-PCR, kad paraugs ir savākts, tiek izmantotas ķīmiskas vielas, lai noņemtu nevēlamus proteīnus, taukus un citas molekulas, atstājot RNS. Testa komplekta fermenti vispirms pārvērš RNS par DNS, kas pēc tam pastiprina vīrusa DNS, lai noteiktu vīrusu. Fluorescējošās krāsvielas parasti izmanto, lai saistīties ar pastiprināto DNS un radītu gaismu. Iekārta to var nolasīt, lai iegūtu testa rezultātu.
Kādas ir līdzības starp LAMP un PCR testu?
- Tās ir pastiprināšanas metodes.
- Abi rada kopētu DNS.
- Tās ir ļoti jutīgas un uzticamas metodes nekā imūnās metodes, piemēram, antivielu noteikšana.
- Tie abi tiek izmantoti Covid-19 testēšanai.
Kāda ir atšķirība starp LAMP un PCR testu?
Galvenā atšķirība starp LAMP un PCR testiem ir tāda, ka LAMP gadījumā pastiprināšana tiek panākta, izmantojot nemainīgu temperatūru (60-650C), savukārt PCR gadījumā cikliskums nepieciešama temperatūra. Pašlaik ir pieejami vairāki LAMP metožu veidi. Bet vissvarīgākie COVID-19 noteikšanai ir reversās transkripcijas cilpas mediētā izotermiskā tehnika (RT-LAMP) un transkripta mediētā pastiprināšana (TMA). Turklāt pašlaik klīniskajā praksē ir pieejamas dažādu veidu PCR metodes slimību diagnostikai, piemēram, reāllaika PCR, RT-PCR, ligzdotā PCR, multipleksā PCR, karstās palaišanas PCR, liela attāluma PCR utt.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir norādītas atšķirības starp LAMP un PCR testu.
Kopsavilkums - LAMP vs PCR tests
Cilpas mediētā izotermiskā amplifikācija ir līdzīgs process PCR testiem, piemēram, RT-PCR, taču tas rada vairāk vīrusu DNS kopiju nemainīgā temperatūrā. Polimerāzes ķēdes reakcijas tests pašlaik ir pasaulē visizplatītākais un standarta testēšanas veids slimību diagnosticēšanai, piemēram, COVID-19 diagnosticēšanai. Tas tiek uzskatīts par diezgan uzticamu. PCR izmanto virkni temperatūras izmaiņu, lai ar amplifikācijas palīdzību iegūtu DNS kopijas. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp LAMP un PCR testu.
