Galvenā atšķirība starp cis un trans splicēšanu ir tāda, ka cis splicēšana ir intramolekulārs mehānisms, kas noņem intronus un savieno eksonus, kas atrodas vienā un tajā pašā RNS transkriptā, savukārt transsplicēšana ir starpmolekulārs mehānisms, kas noņem intronus vai outronus un savienojas ar eksoniem, kas neatrodas vienā RNS transkriptā.
RNS splicēšana ir RNS apstrādes veids pirms proteīnu sintēzes. Šajā procesā jaunizveidotais pirmsziņotāja RNS transkripts tiek pārveidots par nobriedušu messenger RNS. Nobriedusi messenger RNS palīdz ražot proteīna molekulu. RNS savienošanas laikā introni (nekodējošie reģioni) tiek noņemti, un eksoni (kodējošie reģioni) tiek savienoti kopā, lai izveidotu nobriedušu mRNS. Cis un trans splicēšana ir divu veidu RNS savienošanas mehānismi.
Kas ir Cis savienošana?
Cis savienošana ir intramolekulārs mehānisms, kas noņem intronus un savieno eksonus, kas atrodas vienā un tajā pašā RNS transkriptā. Normāla cis splicēšana apstrādā vienu RNS molekulu. Cis splicēšana ir tipisks pre-mRNS splicēšanas process, ko veic spliceosomas. Intronā donora vieta (introna 5' gals), atzarojuma vieta (netālu no introna 3' gala) un akceptora vieta (introna 3' gals) ir ļoti svarīga savienošanai. Savienojuma donora vieta ietver invariantu secību GU introna 5' galā. Savienojuma akceptora vietai introna 3' galā ir nemainīga AG secība. Augšup straumē no AG secības atrodas reģions, ko sauc par pirimidīna reģionu (polipirimidīna trakts). Tālāk augšpus polipirimidīna trakta atrodas atzarojuma punkts, kas ietver adenozīna nukleotīdu. Šis nukleotīds ir iesaistīts lariatu veidošanā.
Attēls 01: Cis un Trans-splicing
Galvenās spliceosomas ir U1, U2, U4, U5 un U6. Starp tiem U1 un U2 ir ļoti svarīgi. Cis savienojumā U1 saistās ar 5' savienojuma vietu, bet U2 - ar atzarojuma punktu netālu no 3' savienojuma vietas. U5/U4/U6 saista eksonus 5' vietā, bet U6 saistās ar U2. Vēlāk tiek izlaists U1. U5 pāriet no eksona uz intronu, un U6 saistās 5' savienojuma vietā. Turklāt tiek izlaists arī U4. U6/U2 katalizē pāresterificēšanu, liekot introna 5' galam sasaistīties ar A nukleotīdu uz introna. Tas izraisa lariatu veidošanos. Veidojot lariatu, U5 saistās ar eksonu 3' savienojuma vietā, un 5' vieta tiek sašķelta. Savienojuma pēdējā fāzē U2/U5/U6 paliek saistīti ar lariatu, un 3' vieta tiek sašķelta. Papildus tam šajā fāzē eksoni tiek ligēti, izmantojot ATP hidrolīzi.
Kas ir transsplicēšana?
Transsplicēšana ir starpmolekulārs mehānisms, kas noņem intronus vai outronus un savieno eksonus, kas neatrodas vienā RNS transkriptā. Trans-splicingā pre-mRNS molekulā nav 5' savienojuma vietas, lai U1 proteīns varētu saistīties. Tā vietā ierobežotā savienojuma līdera (SL) RNS tiek transsplicēta uz sekvences ārpusē.
2. attēls: Transsplicing
Outron ir pre-mRNS apgabals starp 5' vāciņu un trans-splicēšanas vietu. Tomēr U2 proteīns parasti saistās ar 3' savienojuma vietu. Pēc outrona noņemšanas savienojuma līdera (SL) eksons tiek savienots ar pirmo eksonu pre-mRNS. Turklāt transsplicēšana ir mehānisms, kas tiek novērots noteiktos mikroorganismos, piemēram, Kinetoplastae klases protistos, lai izteiktu gēnus.
Kādas ir līdzības starp Cis un Trans savienošanu?
- Cis un transsplicēšana ir divu veidu RNS savienošanas mehānismi.
- Abos mehānismos introni tiek noņemti.
- Arī abos mehānismos eksoni tiek savienoti, veidojot nobriedušu mRNS.
- Abi mehānismi ir sastopami eikariotos.
- Prokariotos šo mehānismu nav.
Kāda ir atšķirība starp Cis un Trans savienošanu?
Cis splicēšana ir intramolekulārs mehānisms, kas noņem intronus un savieno eksonus, kas atrodas vienā un tajā pašā RNS transkriptā, savukārt transsplicēšana ir starpmolekulārs mehānisms, kas noņem intronus vai outronus un savieno eksonus, kas neatrodas tajā pašā RNS. atšifrējums. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp cis un trans savienošanu. Turklāt cis splicēšanas laikā introni tiek noņemti, veidojot nobriedušu mRNS. No otras puses, trans-splicing introni vai outroni tiek noņemti, veidojot nobriedušu mRNS.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir norādītas atšķirības starp cis un trans splicēšanu, lai veiktu salīdzinājumu.
Kopsavilkums - Cis vs Trans savienošana
RNS splicēšana ir RNS apstrādes veids pirms olb altumvielu sintēzes procesa. Cis un trans splicēšana ir divu veidu RNS splicēšanas mehānismi, kas atrodami eikariotos. Cis splicēšana ir intramolekulārs mehānisms, kas noņem intronus un savieno eksonus, kas atrodas vienā un tajā pašā RNS transkriptā, savukārt transsplicēšana ir starpmolekulārs mehānisms, kas noņem intronus vai outronus un savieno eksonus, kas neatrodas tajā pašā RNS transkriptā. Tādējādi diskusija par atšķirību starp cis un trans splicēšanu ir pabeigta.
