Galvenā atšķirība starp proteīna apakšvienību un domēnu ir tāda, ka proteīna apakšvienība ir atsevišķa proteīna polipeptīda ķēde, kas savienojas ar citām polipeptīdu ķēdēm, veidojot proteīna kompleksu, savukārt proteīna domēns ir blakus esošais polipeptīdu ķēdes reģions. proteīna, kas bieži neatkarīgi salokās kompaktā, lokālā un daļēji neatkarīgā vienībā.
Proteīna apakšvienība un domēns ir ļoti svarīgas multimēru proteīna daļas. Olb altumvielas ir polimēri, kas izgatavoti no polipeptīdiem. Katra polipeptīda ķēde veidojas no monomēra, kas pazīstams kā aminoskābe. Sarežģīts proteīns satur atšķirīgas struktūrvienības, piemēram, apakšvienības, domēnus, motīvu un kroku. Šīs sarežģītā proteīna strukturālās vienības ir ārkārtīgi svarīgas tās struktūrai un galu galā arī tās funkcijai.
Kas ir proteīna apakšvienība?
Proteīna apakšvienība ir atsevišķa proteīna polipeptīda ķēde, kas savienojas ar citām polipeptīdu ķēdēm, veidojot olb altumvielu kompleksu. Strukturālajā bioloģijā proteīna apakšvienība ir viena proteīna molekula, kas kopā ar citām olb altumvielu molekulām veido olb altumvielu kompleksu. Dabiski sastopamajiem proteīniem ir salīdzinoši mazs apakšvienību skaits, piemēram, hemoglobīns un DNS polimerāze. Tāpēc tos sauc par oligomēriem. Citi proteīni sastāv no liela skaita apakšvienību, tāpēc tos raksturo kā multimērus. Piemēram, mikrotubulas un citi citoskeleta proteīni ir multimēri. Multimēra proteīna apakšvienības var būt identiskas (homologas) vai pilnīgi atšķirīgas (heteroloģiskas).
Attēls 01: Olb altumvielu apakšvienība
Dažos multimēros proteīnos viena apakšvienība var būt katalītiskā apakšvienība. No otras puses, otra ir regulējoša apakšvienība. Katalītiskās apakšvienības funkcija katalizē fermentatīvo reakciju, savukārt regulējošās apakšvienības funkcija veicina vai kavē tās aktivitāti. Enzīmu, kas sastāv gan no katalītiskām, gan regulējošām apakšvienībām, kad tas ir samontēts, parasti sauc par holoenzīmu. Piemēram, I klases enzīmam fosfoinositīda 3-kināzei ir p110 katalītiskā apakšvienība un p85 regulējošā apakšvienība. Turklāt proteīnam ir jābūt vienam gēnam katrai apakšvienībai. Tas ir tāpēc, ka apakšvienību veido atsevišķa polipeptīdu ķēde, kurai ir viens kodējošais gēns.
Kas ir proteīna domēns?
Proteīna domēns ir proteīna polipeptīdu ķēdes blakus esošais reģions, kas bieži neatkarīgi salokās kompaktās, lokālās un daļēji neatkarīgās vienībās. Proteīna domēns ir pazīstams arī kā proteīna polipeptīdu ķēdes reģions, kas pats stabilizējas un salokās neatkarīgi no pārējām. Tās ir atšķirīga strukturāla un funkcionāla vienība proteīnā. Parasti domēni ir atbildīgi par noteiktu funkciju vai mijiedarbību, kas veicina proteīna vispārējo lomu. Piemēram, SH3 domēnā ir aptuveni 50 aminoskābju atlikumi. Tie sastopami dažādos proteīnu diapazonos, tostarp adapterproteīnos, fosfatidilinozitol-3-kināzēs, fosfolipāzēs un miozīnos. Šie SH3 domēni ir iesaistīti olb altumvielu un olb altumvielu mijiedarbībā.
2. attēls: proteīna domēni
Domēnu garums ir dažāds no 50 aminoskābēm līdz 250 aminoskābēm. Īsākos domēnus, piemēram, cinka pirkstu, stabilizē metāla joni un disulfīdu tilti. Domēns bieži rada funkcionālas vienības, piemēram, kalmodulīna kalciju saistošo EF-rokas domēnu. Turklāt domēnus var apmainīt ar gēnu inženieriju starp vienu proteīnu uz citu, lai izveidotu himēriskus proteīnus.
Kādas ir līdzības starp proteīna apakšvienību un domēnu?
- Proteīna apakšvienība un domēns ir multimēra proteīna strukturālās vienības.
- Abas sastāv no aminoskābēm.
- Tie ir saistīti ar terminu “polipeptīdu ķēde”.
- Turklāt tie abi ir ārkārtīgi svarīgi proteīna vispārējai funkcijai.
Kāda ir atšķirība starp proteīna apakšvienību un domēnu?
Proteīna apakšvienība ir atsevišķa proteīna polipeptīda ķēde, kas savienojas ar citām polipeptīdu ķēdēm, veidojot olb altumvielu kompleksu. No otras puses, proteīna domēns ir proteīna polipeptīdu ķēdes blakus esošais reģions, kas bieži neatkarīgi salokās kompaktās, lokālās un daļēji neatkarīgās vienībās. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp proteīna apakšvienību un domēnu. Turklāt proteīna apakšvienība ir lielāka nekā proteīna domēns.
Šajā tabulā ir apkopota atšķirība starp proteīna apakšvienību un domēnu tabulas veidā.
Kopsavilkums - proteīna apakšvienība pret domēnu
Olb altumvielu celtniecības bloki ir aminoskābes. Olb altumvielas veidojas aminoskābju kondensācijas rezultātā. Olb altumvielu struktūras svārstās no desmitiem līdz vairākiem tūkstošiem aminoskābju. Olb altumvielu struktūru stabilizē nekovalentās mijiedarbības, piemēram, ūdeņraža saites, jonu saites, Van der Vālsa spēki, hidrofobās saites un kovalentās mijiedarbības, piemēram, disulfīdu saites. Sarežģīts proteīns satur atšķirīgas struktūrvienības, piemēram, apakšvienības, domēnus, motīvu un kroku. Olb altumvielu apakšvienība ir atsevišķa proteīna polipeptīda ķēde, kas savienojas ar citām polipeptīdu ķēdēm, veidojot olb altumvielu kompleksu. No otras puses, proteīna domēns ir proteīna polipeptīdu ķēdes reģions, kas stabilizējas un salokās neatkarīgi no pārējām. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirībām starp proteīna apakšvienību un domēnu.
