Galvenā atšķirība starp primeru un promotoru ir tāda, ka praimeris ir komerciāli sintezēta īsa DNS sekvence, ko izmanto PCR mērķa DNS sekvences amplifikācijai, savukārt promotors ir specifiska DNS sekvence, kas nodrošina drošu sākotnējo saistīšanās vietu RNS. polimerāze un transkripcijas faktori, lai uzsāktu transkripciju.
Primer un promotors ir divu veidu DNS sekvences. Primer ir neliels DNS fragments, kas nepieciešams polimerāzes ķēdes reakcijai (PCR). Tam ir īsas nukleotīdu sekvences, kas papildina DNS virknes blakus esošo galu. Ir divu veidu primeri, un tie darbojas kā sākumpunkts jaunu DNS virkņu sintēzei. Turpretim promotors ir specifiska DNS sekvence, kas atrodas augšpus gēna transkripcijas iniciācijas vietas. Tas tieši mijiedarbojas ar transkripcijas mehānisma komponentiem, piemēram, RNS polimerāzi un transkripcijas faktoriem, lai kontrolētu DNS transkripciju. Tāpēc RNS polimerāze un citi transkripcijas faktori saistās ar promotora secību un ierosina transkripciju.
Kas ir Primer?
Primeri ir īsas DNS sekvences, kas paredzētas mērķa DNS sekvenču pastiprināšanai. Strukturāli tiem ir īsas nukleotīdu sekvences, kas ir komplementāras ar DNS dubulto virkņu blakus esošajiem galiem. Parasti tie ir aptuveni 20 nukleotīdus gari. PCR laikā Taq polimerāze katalizē nukleotīdu pievienošanu jau esošajā nukleotīdu secībā. Tādējādi gruntskrāsas kalpo par sākumpunktu jaunu pavedienu sintēzei. Taq polimerāze darbojas tikai 5' līdz 3' virzienā. Tādējādi DNS sintēze notiek arī tajā pašā 5' līdz 3' virzienā. Tā kā DNS ir divpavedienu, PCR ir nepieciešami divu veidu primeri. Tie ir zināmi kā priekšējais primers un reversais primers, pamatojoties uz primera pagarinājuma virzienu DNS sintēzes laikā.
Attēls 01: Primers
Paredzēts praimeris ar antisense DNS virkni un iniciē gēna + virknes sintēzi 5’ līdz 3’ virzienā. Tam ir īsa nukleotīdu secība, kas ir komplementāra antisense virknes 3' blakus esošajam galam. Reversais praimeris saplūst ar sensoro virkni un ierosina kodējošās virknes komplementāras virknes sintēzi, kas ir gēna virkne 5’-3’ virzienā. Tādējādi reversais primer ir izstrādāts kā papildinājums kodējošās daļas 3' galam. Gan reversie, gan priekšējie primeri ir svarīgi, lai izveidotu no miljoniem līdz miljardiem konkrētu DNS reģionu kopiju, kas ir mērķētas vai ieinteresētas.
Kas ir reklamētājs?
Promotors ir DNS sekvence, kas atrodas gēna transkripcijas iniciācijas vietas augšpus vai 5′ galā. Tas nodrošina saistīšanās vietu RNS polimerāzei un noteiktiem regulējošiem elementiem, lai uzsāktu gēna transkripciju. Tā ir regulējoša secība, kas nepieciešama, lai ieslēgtu vai izslēgtu gēnu. Promotorā ir noteikta nukleotīdu secība. Tam var būt 100–1000 bāzes pāru. Veicinātājs parāda transkripcijas virzienu. Turklāt tas norāda sajūtu virzienu, kas ir jātranskribē.
Attēls 02: Gēnu veicinātājs
Ir trīs veidu promotora elementi: galvenais promotors, proksimālais promotors un distālais promotors. Galvenais promotors ir minimālā promotora daļa, kas nepieciešama transkripcijas uzsākšanai. Tas atrodas vistuvāk sākuma kodonam. TATA kaste ir konservēts reģions, kas atrodams daudzos eikariotu kodola promotoros. Tas ir atrodams 25 līdz 35 bāzes pārus augšpus transkripcijas sākuma vietas. Proksimālais promotors ir atrodams vairāk pirms galvenā promotora. Parasti tas atrodas 250 bāzes pārus augšpus sākuma kodona un satur primāros regulējošos elementus. Distālais promotors atrodas augšpus proksimālā promotora, un tas satur papildu regulējošos elementus. Baktēriju promotoros savos promotoros ir divi īsas secības elementi. TATAAT ir konsensa secība, kas atrodas -10 no baktēriju promotora, savukārt TTGACA ir konsensa secība pie -35. Tie ir zināmi kā elementi -10 un elementi -35.
Kādas ir līdzības starp Primer un Promoter?
- Primer un promotors ir divu veidu DNS sekvences.
- Tās sastāv no nukleotīdu sekvencēm.
- Gēnu ekspresijai ir svarīgi gan primer, gan promotors.
Kāda ir atšķirība starp Primer un Promoter?
Primer ir īsa nukleotīdu secība, kas paredzēta mērķa DNS amplifikācijai. Turpretim promotors ir specifiska regulējoša DNS sekvence, kas atrodas augšpus gēna transkripcijas iniciācijas vietas. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp primeru un promotoru. Primeru garums ir aptuveni 20 bāzes pāri, savukārt promotoram var būt 100–1000 bāzes pāru. Funkcionāli primeri tiek izmantoti kā sākuma sekvences jaunās virknes sintēzei, savukārt promotori kontrolē gēnu transkripciju, nodrošinot saistīšanās vietas RNS polimerāzei un citiem transkripcijas faktoriem.
Turklāt promotors ir definēts kā transkripcijas virziens un norāda gēna sajūtu virkni. Strukturāli primer ir īsa, vienpavedienu DNS sekvence, savukārt promotors ir gara divpavedienu DNS sekvence.
Tālāk esošajā informācijas grafikā ir sniegti vairāk salīdzinājumu, kas saistīti ar atšķirību starp primeru un promotoru.
Kopsavilkums - Primer vs Promoter
Primeri ir īsas nukleotīdu sekvences, kas komplementāras ar mērķa DNS dubultās virknes blakus esošajiem galiem. PCR izmanto divu veidu praimerus. Tie kalpo kā sākuma secības jaunu virzienu sintēzei. Grunts ir komerciāli izstrādātas, un tās ir temperatūras stabilas secības. No otras puses, promotors ir gēna regulējošā secība, kas atrodas augšpus transkripcijas iniciācijas vietas. Promotori kontrolē gēnu transkripciju. Tie nodrošina saistīšanās vietas RNS polimerāzei un transkripcijas faktoriem, lai uzsāktu transkripciju. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp primeru un promotoru.
