Galvenā atšķirība starp PARP1 un PARP2 ir tāda, ka augu un dzīvnieku PARP1 satur Zn-pirksta DNS saistošos motīvus, bet augu PARP2 nes N-termināla SAP DNS saistošos motīvus.
Poli ADP ribozes polimerāze (PARP) ir proteīnu grupa, kas ir kodolenzīmi. PARP saimē ir 17 dažādi PARP enzīmu veidi. PARP1 un PARP2 ir divi enzīmi, kas ir būtiski normālai DNS atjaunošanas darbībai.
Kas ir PARP?
PARP (poli ADP ribozes polimerāze) ir proteīnu saime, kas kalpo daudzos šūnu procesos, piemēram, DNS labošanā, genoma stabilitātē un ieprogrammētā šūnu nāvē. Tie katalizē procesu, ko sauc par ADP-ribosilāciju. ADP-ribosilēšana attiecas uz ADP-ribozes vienību pievienošanu no nikotīnamīda adenīna dinukleotīda (NAD) mērķa substrātiem, lai labotu DNS virknes pārtraukumus.
PARP fermenti ir DNS saistoši proteīni. Tos aktivizē DNS molekulās esošie niķi. Kad tie saistās ar DNS pārtraukumiem, tie hidrolizē NAD+ par nikotīnamīdu un veicina ADP-ribozes polimerizāciju. Tāpēc PARP kodolenzīmi piedalās DNS remontā. Turklāt poli-ADP-ribosilācija darbojas kā pēctranslācijas modifikācija, kurai ir galvenā loma replikācijā, transkripcijas regulēšanā, telomēru uzturēšanā un olb altumvielu degradācijā. PARP enzīmi piedalās arī genoma stabilitātes uzturēšanā, hromatīna struktūras regulēšanā, šūnu proliferācijā un apoptozē.
Kas ir PARP1?
PARP1 ir PARP proteīnu saimes loceklis. Tas ir pirmais un vislabāk raksturotais proteīns šajā ģimenē. Tas darbojas kā pirmais reaģētājs, kas atklāj DNS bojājumus un pēc tam atvieglo labošanas mehānisma izvēli. Turklāt PARP1 regulē vienas virknes DNS bojājumu novēršanu.
Attēls 01: PARP1
Papildus vienas virknes DNS pārtraukumu novēršanai PARP1 regulē replikācijas dakšas progresēšanu un restartēšanu. Turklāt tas veicina alternatīvu nehomologu gala savienošanu.
Kas ir PARP2?
PARP2 ir vēl viens PARP proteīnu saimes loceklis. Tas ir cieši saistīts ar PARP1 enzīmu. Gēns PARP2 kodē PARP2 proteīnu cilvēkiem. PARP2 ir katalītiskais domēns, bet tam trūkst N termināla DNS saistošā domēna. PARP inhibitoru pretvēža zāles var inhibēt PARP2, līdzīgi kā PARP1.
2. attēls: PARP2
Augos, jo īpaši Arabidopsis thaliana, PARP2 ir nozīmīga loma aizsargreakcijās pret DNS bojājumiem un baktēriju patoģenēzi nekā PARP1.
Kādas ir līdzības starp PARP1 un PARP2?
- PARP1 un PARP2 ir divu veidu kodolenzīmi.
- Tie izmanto NAD+ kā substrātu, lai katalizētu poli ADP ribosilāciju.
- Abus aktivizē DNS vienas virknes pārtraukumi.
- Zīdītāju PARP1 un PARP2 atrodas kodolā.
- Gan PARP1, gan PARP2 mijiedarbojas ar hromatīnu.
- Tie novērš DNS bojājumus.
- Dažas PARP inhibitoru pretvēža zāles, kuru mērķis ir PARP1, arī inhibē PARP2.
Kāda ir atšķirība starp PARP1 un PARP2?
PARP1 ir PARP proteīnu saimes loceklis, kam ir katalītiskais domēns un N-gala DNS saistošais domēns, savukārt PARP2 ir PARP saimes loceklis, kam trūkst N-termināla DNS saistošā domēna. Galvenā atšķirība starp PARP1 un PARP2 ir tāda, ka augu un dzīvnieku PARP1 satur Zn-pirksta DNS saistošos motīvus, savukārt augu PARP2 nes N-termināla SAP DNS saistošos motīvus.
Šajā infografikā ir apkopota atšķirība starp PARP1 un PARP2.
Kopsavilkums - PARP1 pret PARP2
PARP ir kodolenzīmi, kas uztver DNS bojājumus un tos novērš. PARP1 un PARP2 ir divi no tiem, kas ir cieši saistīti. Abiem fermentiem ir katalītiskais domēns. Bet PARP2 trūkst N-termināla DNS saistošā domēna, kas atrodas PARP1. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp PARP1 un PARP2. Abu veidu fermenti kā substrātu izmanto NAD+.
