Galvenā atšķirība starp ORF un eksonu ir tāda, ka ORF jeb atvērtais nolasīšanas rāmis ir DNS sekvences posms, kas sākas ar translācijas iniciācijas vietu (sākuma kodons) un beidzas ar translācijas beigu vietu (stopkodons), kamēr eksons ir nukleotīdu secība gēnā, kas kodē aminoskābes.
Atvērts lasīšanas rāmis ir lasīšanas rāmja daļa. Lasīšanas kadrus nolasa ribosomas, lai iegūtu proteīnus. ORF ir nepārtraukts kodonu posms, kas nodrošina pilnībā funkcionējošu proteīnu. Tas sākas ar sākuma kodonu un beidzas ar stopkodonu. ORF iekšpusē nav stopkodona, kas pārtrauc kodēšanas secību. Tulkošana sākas ar sākuma kodonu un beidzas ar stopkodonu. Eksons ir gēna nukleotīdu secība. Tas kodē proteīna aminoskābes. Tāpēc eksoni ir gēna kodējošie reģioni.
Kas ir ORF?
Atvērtais lasīšanas rāmis jeb ORF ir nepārtraukts nukleotīdu secības posms, kas sākas ar sākuma kodonu un beidzas ar beigu kodonu. Vienkāršiem vārdiem sakot, ORF attiecas uz nukleotīdu secības reģionu, kas atrodas starp sākuma un beigu kodoniem. Starplaikos nav stopkodona, kas pārtrauc ORF. Nukleotīdu secība starp sākuma un beigu kodonu kodē aminoskābes. Parasti sākuma kodons ir ATG, bet stopkodoni ir TAG, TAA un TGA. ORF nodrošina funkcionālu proteīnu, kad tiek transkribēts un tulkots. Tāpēc ORF ietver sākuma kodonu, vairākus kodonus vidējā reģionā un stopkodonu. Interesanti, ka ORF garums ir dalīts ar trīs.
Attēls 01: ORF
Prokariotos, jo nav intronu, ORF ir gēna kodējošais reģions, kas transkribējas tieši mRNS. Tā kā eikariotos ir introni, ORF ir kodona secība, kas rodas pēc apstrādes vai RNS savienošanas. ORF ir pierādījums, kas palīdz prognozēt gēnu, jo garie ORF, visticamāk, ir daļa no gēna.
Kas ir eksons?
Eksoni ir gēnu kodējošās nukleotīdu sekvences, kas pārvēršas olb altumvielās. Tie atrodas abās introna pusēs. Pēc nekodējošu sekvenču noņemšanas no pre-mRNS nobriedušā mRNS molekula sastāv tikai no eksonu sekvencēm. Tad galīgās RNS molekulas (nobriedušās mRNS) nukleotīdu secība pārvēršas noteikta proteīna aminoskābju secībā.
Attēls 02: Eksoni
Gandrīz visiem gēniem ir sākotnējā nukleotīdu secība, kas to atšķir kā gēnu no galvenās DNS vai RNS virknes, kas ir pazīstama kā atvērtais lasīšanas rāmis (ORF. Dažos gēnos divi ORF iezīmē visu gēnu un eksonus). atrodas kodēšanas secībā. Lai gan izklausās, ka eksoni vienmēr tiek izteikti gēnos, ir gadījumi, kad intronu sekvences iejaucas eksonā, izraisot mutācijas, un šo procesu sauc par eksonizāciju.
Kādas ir līdzības starp ORF un Exon?
- Gan ORF, gan eksons ir nukleotīdu sekvences.
- Ilgs ORF un eksoni ir gēna daļas.
- Abām ir kodēšanas secības.
Kāda ir atšķirība starp ORF un Exon?
ORF un eksons ir nukleotīdu sekvences. ORF attiecas uz jebkuru DNS sekvences posmu, kas atrodas starp sākuma kodonu un stopkodonu. Turpretim eksons ir gēna, kas kodē aminoskābes, nukleotīdu secība. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp ORF un eksonu. Eksoni ir gēna daļas, savukārt garais ORF, iespējams, ir gēna daļa. Turklāt abās eksona pusēs ir introni, savukārt ORF neietver intronus.
Zemāk infografikā tabulas veidā ir apkopota atšķirība starp ORF un eksonu.
Kopsavilkums - ORF vs Exon
Atvērtais lasīšanas rāmis (ORF) ir lasīšanas rāmja daļa. Tas ir nepārtraukts DNS sekvences posms, kas sākas ar sākuma kodonu un beidzas ar stopkodonu. Eksons ir gēna nukleotīdu secība. Tas kodē daļu no mRNS sekvences. Tāpēc eksoni ir gēnu sekvences daļas, kas tiek ekspresētas olb altumvielās. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp ORF un eksonu.
