Galvenā atšķirība starp restrikcijas endonukleāzi un eksonukleāzi ir tāda, ka restrikcijas endonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas atpazīst noteiktu DNS sekvenci un šķeļ DNS šajā secībā vai blakus tai, savukārt eksonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas šķeļ nukleotīdus polinukleotīds no 5' gala vai 3' gala pa vienam.
Nukleāzes ir fermenti, kas sašķeļ fosfodiestera saites starp nukleīnskābju nukleotīdiem. Dzīvos organismos tie ir būtiski instrumenti daudziem DNS atjaunošanas aspektiem šūnā. Šo enzīmu defekti var izraisīt ģenētisku nestabilitāti un imūndeficītu. Restrikcijas nukleāzes ir specifiskas nukleāzes, kuru darbība ir atkarīga no noteiktas nukleotīdu secības. Piemērs ir restrikcijas endonukleāze. Pastāv pamata klasifikācija nukleāzēm, pamatojoties uz aktivitātes lokusu, piemēram, endonukleāze un eksonukleāze. Endonukleāze sagremo reģionus mērķa DNS molekulas vidū. Eksonukleāze sagremo nukleīnskābes no galiem. Tādējādi restrikcijas endonukleāze un eksonukleāze ir divu veidu nukleāzes enzīmi.
Kas ir restrikcijas endonukleāze?
Restrikcijas endonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas atpazīst noteiktu DNS secību un atdala DNS šajā secībā vai blakus tai. Specifiskā DNS sekvence ir pazīstama kā restrikcijas vieta. To sauc arī par restrikcijas enzīmu vai restriktāzi. Restrikcijas endonukleāze ir ļoti specifisks enzīms. Tā ir viena klase no plašākas endonukleāzes enzīmu grupas. Restrikcijas endonukleāzes parasti iedala piecos veidos, kas atšķiras pēc to struktūras un spējas atpazīšanas vietā sagriezt DNS substrātu. Pieci veidi ir I tips, II tips, III tips, IV tips un V tips.
Attēls 01: Restrikcijas endonukleāze
Restrikcijas endonukleāzes parasti atrodamas baktērijās un arhejās. Tie nodrošina baktēriju aizsardzības mehānismu pret vīrusiem. Ir zināmas vairāk nekā 3600 restrikcijas endonukleāzes. Tie pārstāv vairāk nekā 250 dažādu specifiku. Vairāk nekā 3000 no tiem ir detalizēti izpētīti. Turklāt vairāk nekā 800 no tiem ir pieejami komerciāli.
Kas ir eksonukleāze?
Eksonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas pa vienam atdala nukleotīdus polinukleotīdā no 5' gala vai 3' gala. Tas notiek hidrolīzes reakcijas rezultātā, kas beigās pārtrauc fosfodiestera saites starp nukleotīdiem. Eikariotiem un prokariotiem ir trīs veidu eksonukleāzes. Šīs eksonukleāzes ir iesaistītas normālā mRNS apritē. Tās ir 5' līdz 3' eksonukleāze (Xrn1), 3' līdz 5' eksonukleāze un poli-A specifiskā 3' līdz 5' eksonukleāze. 5' līdz 3' eksonukleāze ir atkarīgs proteīns, kas noņem apvalku. 3’-5’ eksonukleāze ir neatkarīgs proteīns. Poli-A specifiskā 3’ līdz 5’ eksonukleāze ir pazīstama arī kā poli-A specifiskā ribonukleāze, kas iesaistīta poli-A astes eksonukleolītiskā degradācijā.
2. attēls: eksonukleāze
Gan arhejās, gan eikariotos RNS degradāciju veic daudzproteīnu eksosomu komplekss, kas sastāv no 3’–5’ eksoribonukleāzēm.
Kādas ir līdzības starp restrikcijas endonukleāzi un eksonukleāzi?
- Restrikcijas endonukleāze un eksonukleāze ir divu veidu nukleāzes enzīmi.
- Abi fermenti sagriež DNS molekulas.
- Šie fermenti ir atrodami prokariotos.
- Tās ir olb altumvielas.
Kāda ir atšķirība starp restrikcijas endonukleāzi un eksonukleāzi?
Restrikcijas endonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas atpazīst noteiktu DNS sekvenci un atdala DNS šajā secībā vai blakus tai, savukārt eksonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas atdala nukleotīdus polinukleotīdā no 5' gala vai 3' gala. pa vienam. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp restrikcijas endonukleāzi un eksonukleāzi. Turklāt restrikcijas endonukleāze ir sastopama tikai prokariotos, savukārt eksonukleāze ir sastopama gan prokariotos, gan eikariotos.
Šajā infografikā tabulas veidā ir norādītas atšķirības starp restrikcijas endonukleāzi un eksonukleāzi, lai tos salīdzinātu.
Kopsavilkums - restrikcijas endonukleāze pret eksonukleāzi
Nukleāzes ir fermenti, kas sarauj fosfodiestera saites starp nukleīnskābju nukleotīdiem. Restrikcijas endonukleāze un eksonukleāze ir divu veidu nukleāzes enzīmi. Restrikcijas endonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas atpazīst noteiktu DNS secību un atdala DNS šajā secībā vai blakus tai. Eksonukleāze ir nukleāzes enzīms, kas atdala nukleotīdus polinukleotīdā no to 5' gala vai 3' gala pa vienam. Tādējādi šeit ir apkopota atšķirība starp restrikcijas endonukleāzi un eksonukleāzi.
