Galvenā atšķirība starp TATA un CAAT box ir tā, ka TATA kaste ir konservēts nukleotīdu reģions, kuram ir TATAWAW konsensa secība, savukārt CAAT box ir konservēts nukleotīdu reģions ar konsensa secību GGCCAATCT.
TATA kaste un CAAT kaste ir divi nukleotīdu reģioni, kas ietekmē eikariotu gēnu transkripciju. Tās ir nekodējošas DNS sekvences, kas atrodamas pirms transkripcijas sākuma vietas. Faktiski tie atrodas regulēšanas reģionā, kas ir pazīstams kā veicinātājs. Gan TATA kaste, gan CAAT kaste ir atbildīgas par transkripcijas efektivitāti. Tās ir konsensa secības, kas nav mainījušās visā evolūcijas procesā.
Kas ir TATA Box?
TATA kaste vai Goldberga-Hogness kaste ir konsensa secība, kas atrodama eikariotu gēnu promotora reģionā. TATA kaste ir veicinātāja galvenais elements. Tas atrodas 25 bāzes pārus augšpus transkripcijas iniciācijas vietas. Tas tiek saglabāts visā evolūcijas procesā. TATA kastes konsensa secība ir TATAWAW, kur W ir A vai T. Tā ir nekodējoša DNS sekvence. Tomēr TATA kaste ir svarīga gēna transkripcijai. Tā ir TATA saistošā proteīna (TBP) un citu transkripcijas faktoru saistīšanās vieta. Kad tie saistās TATA kastē, eikariotu gēnos notiek RNS polimerāzes II piesaiste un pareiza transkripcijas regulēšana.
Attēls 01: TATA Box
Tā kā TATA kaste ir iesaistīta transkripcijas regulēšanā, TATA kastes mutācijas var izraisīt fenotipiskas izmaiņas, kas izraisa tādas slimības kā kuņģa vēzis, spinocerebellāra ataksija, Hantingtona slimība, aklums, β-talasēmija, imūnsupresija, Žilbēra sindroms, un HIV-1 utt.
Kas ir CAAT Box?
CAAT kaste ir nukleotīdu reģions ar GGCCAATCT konsensa secību. Līdzīgi kā TATA kastē, CAAT kaste atrodas arī gēna promotora reģionā. Tāpēc tas atrodas aptuveni 75–80 bāzes pārus augšpus transkripcijas vietas.
2. attēls: CAAT kaste
Īpaši transkripcijas faktori ir saistīti ar CAAT lodziņu. Šī saistīšanās stabilizē pirmsiniciācijas kompleksu, lai atvieglotu enzīma RNS polimerāzes saistīšanos. Tāpat CAAT kaste darbojas kā regulējoša secība. Mutācijas CAAT kastes reģionā ļoti ietekmē promotora reakciju un transkripcijas regulēšanu.
Kādas ir līdzības starp TATA un CAAT Box?
- TATA un CAAT ir divi nukleotīdu apgabali, kas atrodami eikariotu gēnu regulējošā secībā.
- Tie ir atrodami pirms transkripcijas sākšanas vietas.
- Abas ir vienprātīgas DNS sekvences.
- Tās ir būtiskas transkripcijas regulēšanai, tāpēc tās ir regulējošas secības.
Kāda ir atšķirība starp TATA un CAAT Box?
TATA kaste ir konservēts nukleotīdu reģions, kas atrasts aptuveni 25–30 bāzes pārus augšpus transkripcijas iniciācijas vietas. No otras puses, CAAT kaste ir konservēts nukleotīdu reģions, kas atrasts apmēram 75–80 bāzes pārus augšpus transkripcijas iniciācijas vietas. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp TATA un CAAT kastīti. Turklāt TATA lodziņā ir TATAWAW konsensa secība, savukārt GGCCAATCT ir CAAT lodziņa konsensa secība.
Turklāt vēl viena būtiska atšķirība starp TATA un CAAT kastīti ir tā, ka TATA kaste nodrošina saistīšanās vietu TBP un transkripcijas faktoriem un piedalās transkripcijas regulēšanā, savukārt CAAT kaste signalizē par RNS transkripcijas faktora saistīšanās vietu.
Zemāk infografikā ir apkopotas atšķirības starp TATA un CAAT kastēm.
Kopsavilkums - TATA vs CAAT Box
TATA kaste un CAAT kaste ir divas daļas no eikariotu gēnu promotoru saglabātā reģiona. Tie atrodas augšpus transkripcijas uzsākšanas vietai. Abi ietekmē gēnu transkripciju, nodrošinot vietas TATA saistošo proteīnu un transkripcijas ierosināšanas faktoru saistīšanai. TATA kaste atrodas 25–35 bāzes pārus augšpus transkripcijas iniciācijas vietas, savukārt CAAT kaste atrodas 75–80 bāzes pārus augšpus transkripcijas iniciācijas vietas. TATA lodziņa konsensa secība ir TATAWAW, savukārt CAAT kastes vienprātības secība ir GGCCAATCT. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp TATA un CAAT lodziņu.
