Galvenā atšķirība starp mērķtiecīgu un nemērķtiecīgu proteomiku ir tā, ka mērķtiecīgās proteomikas mērķis ir izmērīt noteikta proteīna pārpilnību, savukārt nemērķtiecīga proteomika nav vērsta uz konkrētu proteīnu.
Proteomika ir liela mēroga proteīnu, to struktūru un funkciju pētījums. Tas pēta visu olb altumvielu komplementu šūnā, audos vai organismā noteiktos apstākļos. Ir divu veidu proteomika kā mērķtiecīga proteomika un nemērķēta proteomika.
Kas ir mērķa proteomika?
Kā norāda nosaukums, mērķtiecīga proteomika ir vērsta uz konkrētu proteīnu vai peptīdu kompleksā olb altumvielu maisījumā analīzei. Pēc tam tā analizē šī iepriekš izvēlētā specifiskā proteīna klātbūtni un daudzumu. Šī metode ir iespējama tikai vienam paraugam vai vairākiem paraugiem. Šī metode ir piemērota pat noteiktai olb altumvielu grupai. Tā rezultātā tiek iegūti precīzāki, kvantitatīvāki un sensitīvāki dati. Turklāt masas spektrometrija kopā ar mērķtiecīgu proteomiku nodrošina precīzākus ticamus mērījumus. Šīs metodes analīzei tiek izmantots trīskāršā kvadrupola masas spektrometrs (QQQ).
Attēls 01: Proteomika
Mērķtiecīga proteomika ir piemērota metode, ja vēlaties pārbaudīt, vai notriektais mērķis patiešām ir notriekts vai ja vēlaties noteikt konkrēta proteīna/peptīda daudzumu asins serumā, smadzeņu šķidrumā vai šūnu lizātā utt. Varat arī izmantojiet to, ja vēlaties pārbaudīt, vai konkrēts proteīns ir atšķirīgi izteikts paraugos vai laika kursa eksperimenta laikā.
Kas ir nemērķēta proteomika?
Nemērķēta proteomika, kā minēts nosaukumā, tās analīzei nav vērsta uz konkrētu proteīnu vai peptīdu. Discovery proteomika ir vēl viens nemērķtiecīgās proteomikas nosaukums. Faktiski tā ir “globālāka” analīze. Parasti nemērķtiecīgas proteomikas veikšana ir atbilde uz jautājumu “kāds proteīns vai olb altumvielas ir šajā paraugā vai vairākos paraugos?”. Šī metode nav jutīga kā mērķtiecīga proteomika. Bet tas var identificēt un izmērīt daudzus proteīnus, tostarp jaunus proteīnus. Nemērķtiecīga proteomika var radīt gan kvantitatīvus, gan kvalitatīvus mērījumus.
Kādas ir līdzības starp mērķtiecīgu un nemērķtiecīgu proteomiku?
- Gan mērķtiecīga, gan nemērķtiecīga proteomika mēra proteīnus paraugos.
- Tie ir svarīgi proteomu analīzē.
- Šajās metodēs tiek izmantota masas spektrometrija.
Kāda ir atšķirība starp mērķtiecīgu un nemērķtiecīgu proteomiku?
Pirmkārt, mērķtiecīga proteomika ir noteikta proteīna vai peptīda klātbūtnes un daudzuma noteikšana kompleksā olb altumvielu maisījumā. Turpretim nemērķēta proteomika ir kvantitatīvs un kvalitatīvs proteīnu pētījums paraugā vai paraugos, nemērķējot uz noteiktu proteīnu. Mērķtiecīga proteomika tiek veikta ar iepriekš atlasītiem vai mērķētiem proteīniem, savukārt nemērķtiecīga proteomika tiek veikta, lai noskaidrotu proteīnu veidus šajā paraugā. Turklāt mērķtiecīga proteomika ir jutīgāka nekā nemērķēta proteomika.
Kopsavilkums - mērķtiecīga un nemērķtiecīga proteomika
Rezumējot, mērķtiecīga un nemērķtiecīga proteomika ir divu veidu proteīnu pētījumi. Kā liecina to nosaukumi, mērķtiecīga proteomika ir vērsta uz noteiktu proteīnu, savukārt nemērķēta proteomika nav vērsta uz konkrētu proteīnu. Šī ir atšķirība starp mērķtiecīgu un nemērķētu proteomiku.
