Galvenā atšķirība - Metabolomika pret Metabonomiku
Metabolīti ir mazas molekulas, kas iesaistītas vielmaiņas reakcijās šūnās. Metabolīti ietver vielmaiņas starpproduktus, hormonus, sekundāros metabolītus, signālmolekulas utt. Tās ir funkcionējošas šūnu bioķīmisko reakciju molekulas. Pilns bioloģiskā parauga vai viena organisma metabolītu komplekts ir pazīstams kā metaboloms. Metabolome ir dinamiska kolekcija, kas ķermenī mainās katru sekundi. Metabolomika un metabonomika ir divi termini, kas saistīti ar organisma metabolomu izpēti. Galvenā atšķirība starp metabolomiku un metabonomiku ir tā, ka metabolomika vairāk rūpējas par normālu endogēno metabolismu un vielmaiņas profilēšanu šūnu vai orgānu līmenī, savukārt metabonomika vairāk nodarbojas ar vielmaiņas profilēšanas paplašināšanu, izmantojot informāciju par vielmaiņas traucējumiem vides faktoru, slimību, zarnu dēļ. mikroorganismiem un vielmaiņas profilēšanas salīdzināšanai utt. Metabolomiku galvenokārt nosaka masas spektrometrija, un metabonomikā metabolītu analīzei tiek izmantota KMR spektroskopija.
Kas ir Metabolomika?
Metabolomika ir vielmaiņas procesu izpēte, kas notiek šūnās, biofluīdos, audos vai organismos. Tas ietver šūnu metabolītu identificēšanu un kvantitatīvu noteikšanu, izmantojot labus analītiskos un statistikas rīkus. Metabolomika tiek uzskatīta par svarīgu pētījumu, jo tā atklāj informāciju par organisma vielmaiņu.
Lai pētītu substrātus un vielmaiņas reakciju produktus, metabolomika izmanto masas spektrometriju kā analītisko platformu. Masu spektrometrija atklāj metabolītu veidus un to koncentrācijas, atspoguļojot šūnu vai audu faktisko bioķīmisko stāvokli. Līdz ar to metabolomiku var uzskatīt par labāko organisma molekulārā fenotipa pārstāvi. Metabolomika ir mazo organismu molekulu omiskā tehnoloģija, kas tiek salīdzināta ar citiem omikas pētījumiem; metabolomika ir ļoti svarīga, jo tā tieši atspoguļo šūnu bioķīmiskās reakcijas pašreizējo stāvokli.
Metabolmiku var uzskatīt arī par proteomikas paplašinājumu, jo tā rodas fermentu aktivitāšu dēļ, kas ir proteīni, kā parādīts nākamajā attēlā.
Attēls 01: Metabolomikas shēma
Kas ir Metabonomika?
Metabonomika ir definēta kā daudzparametrisko vielmaiņas reakciju kvantitatīvs mērījums noteiktos laikos saistībā ar patofizioloģisku stresu vai ģenētisku modifikāciju. To parasti piemēro pētījumiem par cilvēku uzturu un reakciju uz zālēm vai slimībām. Šo pieeju aizsāka Džeremijs Nikolsons Londonas Imperiālajā koledžā, un tā ir izmantota vairākās jomās, tostarp toksikoloģijā, slimību diagnostikā, uzturā utt. Vēsturiski metabonomika bija viena no pirmajām metodēm, lai pētījumos izmantotu sistēmu bioloģijas jomu. vielmaiņu.
Metabonomika vairāk rūpējas par bioķīmisko profilu salīdzināšanu, nevis atsevišķu metabolisko savienojumu identificēšanu metabolomikā. Tāpēc metabonomiku var definēt kā metabolomikas apakškopu. Tas galvenokārt uzsver dažādu populāciju vielmaiņas profilu salīdzināšanu attiecībā uz slimībām, vides stresu, ģenētisko modifikāciju, uzturu, zālēm utt., jo metabolīti ir labie marķieri, kas signalizē par slimības apstākļiem, zāļu iedarbību, vides stresu, toksīnu iedarbību. utt.
Metabonomiskie pētījumi atklāj gan intracelulārus, gan ārpusšūnu metabolītus. Tas izmanto augstas caurlaidspējas metodes, lai vienlaikus un atkārtoti analizētu lielu skaitu metabolītu, ļaujot īslaicīgi izmeklēt šūnu fizioloģisko stāvokli. Tas arī atklāj korelāciju starp metabolītiem un organisma patoloģisko stāvokli. Lai atbalstītu metabonomiskos pētījumus, var izmantot genomiku un proteomiku, jo tās ir savstarpēji saistītas, kā parādīts attēlā.
Kāda ir atšķirība starp Metabolomiku un Metabonomiku?
Metabolomika vs metabolomika |
|
| Metabolomika ir visa organisma metabolītu kopuma izpēte | Metabonomika ir kvantitatīvs pētījums par dzīvo sistēmu daudzparametrisko vielmaiņas reakciju laikā uz patofizioloģiskiem stimuliem vai ģenētiskām modifikācijām. |
| Galvenā problēma | |
| Metabolomika vairāk nodarbojas ar vielmaiņas profilēšanu un atsevišķu šūnās esošo metabolītu identificēšanu. | Metabonomika ir vairāk saistīta ar metabolītu vai populāciju vielmaiņas profilu salīdzināšanu saistībā ar ģenētiskajām modifikācijām, slimībām, vides stresu, patoloģiskiem stimuliem, zālēm utt. |
| Informācija | |
| Metabolomika galvenokārt ir vērsta uz endogēno metabolismu. | Metabonomika neaprobežojas tikai ar endogēno metabolismu. Tā sniedz informāciju par vielmaiņas traucējumiem, ko izraisa iekšēji un ārēji faktori, piemēram, uztura paradumi, toksīni, slimību procesi utt. |
| Analītiskie rīki | |
| Tā kā galvenā analītiskā platforma izmanto masas spektrometriju | Metabonomika kā galveno analītisko platformu izmanto KMR spektroskopiju. |
Kopsavilkums - Metabolomika vs Metabonomika
Metaboloms ir pilns mazu molekulu komplekts, ko sauc par metabolītiem, kas atrodas šūnā vai organismā. Metabolomika ir visa metaboloma izpēte, lai radītu vielmaiņas profilu. Metabolomika ļauj zinātniekiem izmērīt faktisko šūnas vai organisma fizioloģisko stāvokli. Metabonomika ir daļa no metabolomikas, kas sniedz informāciju par dzīvo sistēmu daudzparametriskām vielmaiņas reakcijām uz patofizioloģiskiem stimuliem un ģenētiskām modifikācijām. Metabonomika ir saistīta ne tikai ar individuālu vielmaiņas profilu veidošanu, piemēram, metabolomiku; tas salīdzina vielmaiņas profilus saistībā ar citiem faktoriem, piemēram, vides stresu, slimībām, toksīniem utt. Gan metabolomika, gan metabonomika ietver organismu metabolītu pētījumus, lai noteiktu šūnu faktisko fizioloģisko stāvokli. Tāpēc dažreiz šie divi tiek uzskatīti par sinonīmiem, neņemot vērā atšķirību starp metabolomiku un metabonomiku.
