Enzīms pret olb altumvielām
Olb altumvielas un fermenti ir bioloģiskas makromolekulas, kas sastāv no daudzām aminoskābēm, kas savienotas kopā kā lineāras ķēdes. Aminoskābe ir šo makromolekulu galvenā strukturālā un funkcionālā vienība. Aminoskābes molekula sastāv no četrām pamata grupām; proti, aminogrupa, sānu ķēde (R-grupa), karboksilgrupa un ūdeņraža atoms, kas ir saistīti ar centrālo oglekļa atomu. Būtībā ir divdesmit dabā sastopamas aminoskābes, un tās atšķiras tikai ar sānu ķēdi (R-grupa). Aminoskābju secība nosaka olb altumvielu un enzīmu struktūru un funkcijas.
Enzīmi
Fermenti ir īpaši trīsdimensiju lodveida proteīni, kas var darboties kā bioloģiskas molekulas, lai katalizētu un regulētu ķīmiskās reakcijas organismos. Vienā šūnā ir tūkstošiem dažādu enzīmu. Tas ir tāpēc, ka gandrīz katrai reakcijai šūnā ir nepieciešams savs īpašs enzīms. Parasti fermenti izraisa šūnu reakcijas, kas notiek miljons reižu ātrāk nekā atbilstošas nekatalizētas reakcijas. Aktīvās vietas, kas atrodas uz fermenta virsmas, nosaka to specifiskuma pakāpi. Fermentu specifiskuma veidi ietver absolūto specifiskumu, stereoķīmisko specifiku, grupas specifiskumu un saišu specifiku. Aktīvās vietas ir plaisas vai iedobes uz fermenta virsmas, ko izraisa terciārās struktūras veidošanās. Dažas aktīvās vietas saista tikai vienu konkrētu savienojumu, bet citas var saistīt cieši saistītu savienojumu grupu. Fermentus neietekmē reakcija, ko tie katalizē. Ir četri faktori, kas ietekmē fermenta aktivitāti, proti; temperatūra, pH, substrāta koncentrācija un fermentu koncentrācija.
Proteīni
Olb altumvielas ir visdažādākās bioloģiskās makromolekulas gan funkcionāli, gan strukturāli. Tie ir aminoskābju polimēri. Aminoskābju secība nosaka to pamatstruktūru un funkciju. Olb altumvielu pamatfunkcijas ir enzīmu katalīze, aizsardzība, transportēšana, atbalsts, kustība, regulēšana un uzglabāšana. Olb altumvielu struktūru var izteikt četru līmeņu hierarhijā; primārais, sekundārais, terciārais un kvartārais. Aminoskābju secība ir proteīna primārā struktūra. Sekundārās struktūras veidošanās ir saistīta ar regulāru grupu mijiedarbību peptīdu mugurkaulā ar ūdeņraža saišu veidošanos. Tas rada divu dažādu veidu struktūras, proti; beta (β) – kroku loksnes, bet alfa (α) – spirāles vai spoles. Proteīna molekulas locījums un saites beidzot veido tās 3-D formu, ko sauc par terciāro struktūru. Olb altumvielas ar vairākiem polipeptīdiem rada kvartāru struktūru.
Kāda ir atšķirība starp enzīmu un proteīnu?
• Visi fermenti ir lodveida proteīni, bet ne visi proteīni ir globulāri. Daži proteīni ir lodveida, bet daži nav (šķiedru daļām ir garas plānas struktūras).
• Atšķirībā no citiem proteīniem fermenti var darboties kā katalizatori, katalizēt un regulēt bioloģiskās reakcijas.
• Fermenti ir funkcionāli proteīni, savukārt proteīni var būt funkcionāli vai strukturāli.
• Atšķirībā no citiem proteīniem fermenti ir ļoti specifiskas substrāta molekulas.
• Olb altumvielas var sagremot vai sadalīt enzīmu (proteāžu) ietekmē.