Galvenā atšķirība starp saliktajiem transpozoniem un IS elementiem ir tāda, ka saliktie transpozoni ir transpozonu veids, kas satur papildu gēnus, piemēram, antibiotiku rezistences gēnus, savukārt IS elementi (vai ievietošanas secības elementi) ir transponējami elementi, kas satur tikai tādus gēnus, koda transponēšana, kas katalizē transponēšanas darbību.
A transposons ir DNS fragments, kas var mainīt savu pozīciju baktēriju genomā. Tāpēc tās ir mobilas DNS sekvences. Tie pārvietojas jaunās genoma vietās, veicot izmaiņas baktēriju genoma secībā, izraisot būtiskas izmaiņas ģenētiskajā informācijā. Transposoni ir pazīstami arī kā lecošie gēni, jo tie var bloķēt gēnu transkripciju un pārkārtot baktērijas ģenētisko materiālu. Turklāt tie ir atbildīgi par zāļu rezistences, antibiotiku rezistences gēnu kustību starp plazmīdām un hromosomām. Salikti transpozoni un IS elementi ir divu veidu mobilie ģenētiskie elementi, kas atrodami baktērijās. Abi var pārvietoties no vienas vietas uz citu genomā.
Kas ir saliktie transpozoni?
Salikts transpozons ir DNS segments, kuram blakus ir divas līdzīgu ievietošanas secības elementu kopijas. Kompozīta transpozonā ir centrālais proteīnu kodējošais reģions. Gēni bieži ir pret antibiotikām rezistenti gēni. Tie var saturēt arī kataboliskos gēnus. Turklāt saliktais transposons sastāv no diviem apgrieztiem atkārtojumiem. Viss saliktā transposona garums pārvietojas kā viena pilnīga vienība.
01. attēls: saliktā transpozone
Tn10 ir salikts transposons. Tas sastāv no 6,5 kb centrālā kodējošā reģiona (pret tetraciklīnu rezistenta gēna) un 1,4 kb apgrieztās ievietošanas sekvences elementiem katrā galā. IS elementi nodrošina transponēšanu. Transpozāze ir enzīms, kas katalizē transposona kustību. Saliktos transpozonus var pastiprināt, veidojot primerus IS elementiem.
Kas ir IS elementi?
Ievietošanas secības elementi jeb IS elementi ir mobilā ģenētiskā elementa veids. Tie ir vienkārša transpozonu forma. Tie satur tikai gēnus, kas kodē transpozāzes enzīmus. Transpozonu enzīmi katalizē transpozonu transponēšanu. Strukturāli IS elementu kodēšanas secību papildina divi apgriezti atkārtojumi. Piemēram, IS elementu ar nosaukumu IS911 papildina divas 36 bp apgrieztas atkārtotas ekstremitātes.
IS elementi ir visizplatītākie autonomie transponējamie elementi baktēriju genomā. Tādējādi tie ir ārkārtīgi svarīgi prokariotu genoma organizācijai un evolūcijai. Turklāt IS elementi rodas kā saliktu transpozonu daļas. Parasti tiek atrasti divi IS elementi, kas atrodas blakus saliktā transposona kodēšanas secībai. Taču vienību transpozoniem nav blakus esošo IS elementu.
Tā kā IS elementi var pārvietoties genomā, tie var pārtraukt citu gēnu kodēšanas secību un deaktivizēt gēnus, bloķējot ekspresiju.
Kādas ir līdzības starp saliktajiem transposoniem un IS elementiem?
- Gan kompozīti transpozoni, gan IS elementi spēj mainīt pozīciju baktēriju genomā.
- Kodēšanas apgabalu abos transposonos parasti papildina apgriezti atkārtojumi.
- Saliktu transposonu papildina divi atsevišķi IS elementi.
Kāda ir atšķirība starp saliktajiem transposoniem un IS elementiem?
Saliktie transpozoni ir mobilie ģenētiskie elementi, kas sastāv no divām ievietošanas sekvencēm (IS), kas bieži atrodas blakus vienam vai vairākiem antibiotiku rezistences gēniem. No otras puses, IS elementi ir vienkāršu transponējamu elementu veids, kas satur gēnus, kas kodē transpozāzes enzīmu, lai katalizētu transponēšanu. Tātad šī ir galvenā atšķirība starp saliktajiem transpozoniem un IS elementiem.
Tālāk ir parādīts saraksts ar atšķirībām starp saliktajiem transpozoniem un IS elementiem tabulas veidā, lai salīdzinātu tos blakus.
Kopsavilkums - saliktie transpozoni pret IS elementiem
Baktērijas genomam ir ģenētiski elementi, kas ir mobili. Saliktie transposoni un IS elementi ir divu veidu mobilie ģenētiskie elementi. Saliktie transposoni satur pret antibiotikām rezistentus gēnus un blakus esošos IS elementus. IS elementi satur ģenētisko kodu, lai radītu transpozāzi, kas katalizē transpozonu kustību. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp saliktajiem transpozoniem un IS elementiem.
