Galvenā atšķirība starp I un II grupas introniem ir tāda, ka I grupas intronos savienošanās reakciju ierosina guanozīna kofaktors, savukārt II grupas intronos savienošanās reakciju ierosina iekšējais adenozīns.
Pre-mRNS ir primārais transkripts, kam ir gan introni, gan eksoni. Pirms mRNS pirms translācijas jāpārvērš mRNS. RNS splicēšana vai pre-mRNS splicēšana ir viena no šādām pēctranskripcijas modifikācijām. RNS savienošanā introni tiek noņemti no pre-mRNS molekulas, un eksoni tiek savienoti kopā. I un II grupas introni ir pašsavienojoši introni. Tie atdalās no pre-mRNS molekulas bez citu enzīmu palīdzības. Tāpēc tie ir RNS enzīmi vai ribozīmi, kas katalizē savu savienojumu no pre-mRNS. Turklāt tiem ir iespēja darboties kā mobilie elementi. Savienojuma laikā notiek virkne transesterifikācijas reakciju, lai izgrieztu intronu un sasaistītu eksonus. Šie ribozīmi atrodas visos trīs domēnos, tostarp baktērijās, arhejās un eikariotos.
Kas ir I grupas introni?
I grupas introni ir pašsavienojošu ribozīmu veids, kas atrodams baktērijās, bakteriofāgos un eikariotos (organellu un kodola genomos). Tie ir atrodami būtiskajos gēnos. Viņi spēj katalizēt savu splicēšanu no pre-mRNS molekulas. I grupas intronos var būt daži simti līdz trīs tūkstoši nukleotīdu. Turklāt tiem ir neliela secību līdzība starp organismiem.
Attēls 01: I grupas introni
Sekundārās struktūras ir ļoti konservētas četros īsos reģionos. Ir divi pāresterifikācijas reakcijas savienošanas posmi. I grupas introni ierosina savienošanas mehānismu ar guanozīna kofaktora 3' hidroksilgrupas nukleofīlo uzbrukumu 5P savienojuma vietā.
Kas ir II grupas introni?
II grupas introni ir pašsavienojošo intronu veids, kas atrodams organismos, kas pieder visiem trim domēniem. Tie ir ribozīmi, kas katalizē savas splicēšanas reakcijas no pre-mRNS. Tie ir atrodami rRNS, tRNS un proteīnus kodējošajos gēnos. Bet atšķirībā no I grupas introniem tie nav atrodami kodola genomos.
2. attēls: II grupas introni
II grupas introni katalizē savienošanu, izmantojot divus pāresterifikācijas posmus, kas līdzīgi I grupas introni. Šie enzīmi ierosina savienošanas reakciju ar nukleofīlo uzbrukumu 2′ OH no atzarojuma vietas adenozīna 5′ savienojuma savienojumam. Savienojuma reakciju laikā II grupas introni veido lariatam līdzīgu struktūru. Turklāt intronu savienošana notiek, ja nav GTP.
Kādas ir līdzības starp I un II grupas introniem?
- I un II grupas introni ir divu veidu RNS enzīmi, ribozīmi, kas katalizē savu savienojumu ar dažādiem mehānismiem.
- Tie ir lieli ribozīmi.
- Abi ir atrodami visos trīs domēnos.
- Tie ir mobilie elementi.
- Turklāt tie ir atrodami rRNS, tRNS un proteīnus kodējošajos gēnos.
- Abus fermentus izmanto kā instrumentus biotehnoloģijā un molekulārajā medicīnā mērķtiecīgai gēnu izslēgšanai/notriekšanai, gēnu piegādei vai gēnu terapijas sistēmām.
Kāda ir atšķirība starp I un II grupas introniem?
I grupas introni ir ribozīmi, kas atrodami baktērijās, bakteriofāgos un eikariotu organellu un kodola genomos. II grupas introni ir ribozīmi, kas atrodami baktērijās, arhejās un eikariotu organellās. Turklāt I grupas introni ierosina savienošanas reakciju ar guanozīna kofaktora 3′ hidroksilgrupas nukleofīlo uzbrukumu 5P savienojuma vietā, savukārt II grupas introni ierosina splicēšanas reakciju ar adenozīna atzarojuma vietas 2′ OH nukleofīlo uzbrukumu. 5′ savienojuma krustojums. Tātad šī ir galvenā atšķirība starp I un II grupas introniem.
Turklāt II grupas introni savienošanas laikā veido lariatam līdzīgu struktūru, savukārt I grupas introni neveidojas. Tādējādi šī ir vēl viena būtiska atšķirība starp I un II grupas introniem. Turklāt I grupas introni ir atrodami eikariotu kodola genomos, savukārt II grupas introni nav atrodami eikariotu kodola genomos.
Zemāk infografikā tabulas veidā ir norādītas atšķirības starp I un II grupas introniem, lai tos salīdzinātu.
Kopsavilkums - I grupa pret II grupu introni
I un II grupas introni ir lieli ribozīmi, kas katalizē pāresterifikācijas reakciju, lai izdalītu intronus no primārā transkripta. Tie ir atrodami visās trīs jomās. Tie abi ir mobilie ģenētiskie elementi. Turklāt tos izmanto kā instrumentus biotehnoloģijā un molekulārajā medicīnā. Tomēr I grupas introni ierosina savienošanas reakciju ar guanozīna kofaktora 3′ OH nukleofīlo uzbrukumu 5P savienojuma vietā. Bet II grupas introni ierosina savienošanas reakciju ar adenozīna atzarojuma vietas 2′ OH nukleofīlo uzbrukumu 5′ savienojuma savienojumam. Turklāt II grupas introni savienošanas laikā veido lariatam līdzīgu struktūru, savukārt I grupas introni neveido lariatam līdzīgu struktūru. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp I un II grupas introniem.
