Galvenā atšķirība starp VNTR un zondi ir tāda, ka VNTR ir īsa nukleotīdu secība, kas genomā notiek kā tandēma atkārtojums, savukārt zonde ir mākslīgi sintezēta īsa DNS vai RNS secība, ko var radioaktīvi iezīmēt.
VNTR apzīmē mainīga numura tandēma atkārtojumu. Tā ir īsa nukleotīdu secība, kas genomā sakārtota tandēma atkārtojumos. VNTR dabiski sastopami mūsu genomā. Zonde ir mākslīgi sintezēta īsa DNS vai RNS secība. Gan zonde, gan VNTR ir nukleīnskābes vai īsas nukleotīdu sekvences. Tos plaši izmanto dažādās molekulāri bioloģiskajās tehnikās, galvenokārt tiesu medicīnas pētījumos. VNTR un zondei ir dažas līdzības, kā arī atšķirības. Tādējādi rakstā mēģināts izcelt atšķirību starp VNTR un zondi.
Kas ir VNTR?
VNTR ir īsa nukleotīdu secība, kas mūsu genomā pastāv kā tandēma atkārtojums. VNTR atrodas daudzās hromosomās. Turklāt VNTR dažādiem indivīdiem atšķiras pēc garuma, jo dažādu cilvēku VNTR atkārtojumu skaits ir atšķirīgs. Būtībā tas ir saistīts ar alēlēm, kas mantotas no viņu vecākiem. Tāpēc VNTR galvenokārt izmantojam vecāku identifikācijai (mantojumam) vai personiskām vajadzībām. Līdzīgi tos ir iespējams izmantot arī ģenētikā, tiesu ekspertīzē, bioloģiskajos pētījumos un DNS pirkstu nospiedumu noņemšanā. Tāpēc VNTR ir svarīgs instruments molekulārajā bioloģijā.
01. attēls: VNTR
Mantojumā mēs analizējam VNTR datus, izmantojot divus pamatprincipus: mantojuma saskaņošanu un identitātes saskaņošanu. Mantojuma saskaņošanas laikā indivīdam ir jābūt atbilstošai alēlei ar katra vecāka alēli. Identitātes saskaņošanas laikā abām VNTR alēlēm ir jāatrodas noteiktā genoma vietā.
Kas ir zonde?
Molekulārās bioloģijas kontekstā zonde ir mākslīgi sintezēts DNS vai RNS fragments, kura garums ir no 100 līdz 1000 bāzēm. Mēs varam radioaktīvi marķēt šīs zondes. Tādējādi mēs tos izmantojam, lai noteiktu mērķa nukleotīdu sekvences, kas ir komplementāras zondes secībai. Kad paraugam pievienojam zondes, notiek hibridizācija ar komplementārajām sekvencēm vai mērķa sekvencēm, un mums ir viegli identificēt mērķa sekvences. Tā kā zondes satur radioaktivitāti, mēs varam tās viegli atklāt.
2. attēls: zonde
Tiesu ekspertīzē mēs parasti izmantojam zondes DNS profilēšanas metodēs, piemēram, īsu tandēma atkārtošanās reģionu noteikšanā, restrikcijas fragmenta garuma polimorfismu noteikšanā un DNS pirkstu nospiedumu noņemšanā.
Kādas ir līdzības starp VNTR un Probe?
- Nukleīnskābes ir VNTR un Probe pamatelementi.
- Mēs tos izmantojam gēnu identifikācijas procesos.
- Tāpat abu to garumi ir mainīgi.
- Tie ir svarīgi instrumenti kriminālistikas pētījumos, DNS pirkstu nospiedumu noņemšanā, ģenētikā utt.
Kāda ir atšķirība starp VNTR un Probe?
VNTR ir genoma reģions, kas sakārtots kā tandēma atkārtojumi, savukārt zonde ir īsa DNS vai RNS secība, kas sintezēta mākslīgi, lai paraugā noteiktu mērķa sekvences. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp VNTR un zondi. Turklāt svarīga atšķirība starp VNTR un zondi ir tā, ka atšķirībā no VNTR mēs varam radioaktīvi marķēt zondes.
Turklāt VNTR galvenokārt veic vecāku identifikāciju, savukārt zondes palīdz noteikt mērķa nukleotīdu sekvences DNS vai RNS paraugos, kas ir komplementāras zondes secībai. Tādējādi šī ir arī būtiska atšķirība starp VNTR un zondi.
Šajā infografikā ir sniegta plašāka informācija par atšķirību starp VNTR un zondi.
Kopsavilkums - VNTR pret zondi
VNTR un zondes parasti izmanto molekulārās analīzes metodēs, piemēram, kriminālistikas pētījumos un DNS pirkstu nospiedumu noņemšanā. Abi sastāv no mainīga garuma. Tomēr galvenā atšķirība starp VNTR un zondi ir tāda, ka VNTR ir genoma reģions, kas sakārtots ar tandēma atkārtojumiem, savukārt zonde ir DNS vai RNS fragments, ko varētu radioaktīvi marķēt. Turklāt VNTR atrodas genomā. Taču zondes ir mākslīgi sintezētas, un tās var radioaktīvi marķēt, lai noteiktu mērķa nukleotīdu sekvences DNS vai RNS paraugos, kas ir komplementāras ar zondes sekvenci. Tādējādi šis ir kopsavilkums par atšķirību starp VNTR un zondi.
