Galvenā atšķirība starp Cosmid un Phagemid ir tajās ietverto secību veidā. Kosmīds satur cos vietu un plazmīdu. Tāpēc tas ir hibrīds vektors, savukārt Phagemid ir plazmīda, kas satur F1 fāga replikācijas sākumpunktu F1.
Kosmīdus un fagemīdus izmanto klonēšanas nolūkos, īpaši, lai klonētu lielākus DNS fragmentus. Tos plaši izmanto, īpaši klonējot gēnus, kas ir atbildīgi par dažādu proteīnu ražošanu. Kosmīdi un fagemīdi tiek vai nu replikēti atsevišķi kā plazmīdas, vai arī tiek iesaiņoti vīrusu daļiņās un pēc tam replikēti.
Kas ir kosmīds?
A Cosmid, ko dēvē par hibrīdu plazmīdu, ietver cos vietas, kas ekstrahētas no Lambda fāga daļiņām, un plazmīdu. Šīs cos vietas ir gari DNS fragmenti ar 200 bāzes pāriem. Tādējādi tiem ir saliedēti vai lipīgi gali, kas ļauj plazmīdai iekļauties vīrusa DNS. Tāpēc cos vietas ir ļoti svarīgas DNS iesaiņošanai.
Ir trīs Cos vietnes;
- cosN vietne - iesaistīta DNS virknes niķošanā ar termināzes aktivitāti
- cosB vietne - iesaistīta termināļa turēšanā.
- cosQ vietne - iesaistīta DNS degradācijas novēršanā, ko veic DNāzes.
Attēls 01: Cosmid
Arī kosmīdi var replicēt vienpavedienu DNS vai divpavedienu DNS, izmantojot piemērotu replikācijas sākumu. Kosmīdi parasti satur antibiotiku rezistences gēnus kā marķierus transformantu atlasei. Tādējādi kosmīda kā vektora izmantošana var atvieglot klonēšanu, un vektora šķelšana ar restrikcijas enzīmu var iegūt šos fragmentus.
Kas ir fagemīda (phasmid)?
Phagemīds, saukts arī par Phasmid, ir arī hibrīda vektora veids. Fagemīda satur īpašu replikācijas sākumpunktu, ko sauc par f1 replikācijas sākumu. F1 replikācijas izvilkumu izcelsme no f1 fāga.
Phagemid var replicēt gan vienpavedienu, gan divpavedienu DNS. Replikācija var notikt vai nu kā plazmīda, vienlaikus veicot neatkarīgu replikāciju, vai arī var tikt iesaiņota fāgu daļiņās un visbeidzot inficēt baktēriju saimniekorganismu E coli. Inficējot E coli šūnas, f1 fāgam ir nepieciešama pilusa klātbūtne. Līdz ar to dzimuma pilieni ir svarīgi fagemīdu iesaiņošanas laikā in vitro.
Kādas ir kosmīda un fagemīda līdzības?
- Gan Cosmid, gan Phagemid ir klonēšanas vektori, ko izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā.
- Cosmid un Phagemid var replicēt vienpavedienu un divpavedienu DNS.
- Abas var tikt pakļautas neatkarīgai replikācijai, kas līdzīga plazmīdām.
- Cosmid un Phagemid var tikt iesaiņoti in vitro un inficēt baktēriju šūnas.
- Gan Cosmid un Phagemid klonēšanai ir nepieciešams piemērots replikācijas sākums.
Kāda ir atšķirība starp Cosmid un Phagemid?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid ir hibrīds vektors, kas satur cos vietu un plazmīdu. | Phagemid ir plazmīda, kas satur F1 fāga replikācijas sākumpunktu F1. |
| Cos vietņu klātbūtne | |
| Cos vietas atrodas kosmīdā un ir nepieciešamas in vitro iesaiņošanai. | Cos vietnes fagemidā nav. |
| F1 replikācijas izcelsmes klātbūtne | |
| Kosmīdā var būt vai nebūt replikācijas izcelsme. | F1 replikācijas izcelsme atrodas fagemidā. |
| Antibiotiku rezistentu gēnu klātbūtne | |
| Kosmidos atrodas pret antibiotikām rezistenti gēni, lai identificētu transformantus no netransformantiem. | Fagemīdos nav pret antibiotikām rezistentu gēnu. |
| Prasība pēc in vitro iepakojuma | |
| Nepieciešama Cos vietne. | Nepieciešams seksa piluss. |
Kopsavilkums - Cosmid vs Phagemid
Cosmid un Phagemid ir klonēšanas vektori, ko izmanto rekombinantās DNS tehnoloģijā. Kosmīdi ir hibrīdi vektori, kas satur īpašus lipīgus galus, kas pazīstami kā cos vietnes. in vitro iepakojumam ir nepieciešamas šīs cos vietnes. Lai gan fagemīdi ir plazmīdas, kas satur f1 replikācijas sākumpunktu, kas iegūts no f1 fāga. Gan kosmīds, gan fagemīds var tikt pakļauts neatkarīgai replikācijai vai in vitro iesaiņošanai baktēriju šūnās. Šīs ir galvenās atšķirības starp kosmīdu un fagemīdu.
