Galvenā atšķirība - YAC vs BAC vektori
Vektorus izmanto molekulārajā klonēšanā. Vektoru var definēt kā DNS molekulu, kas darbojas kā nesējs sveša ģenētiskā materiāla pārnešanai citā šūnā. Vektors, kas satur svešu DNS, ir pazīstams kā rekombinantā DNS, un tam vajadzētu būt spējīgam to replicēt un ekspresēt saimniekorganismā. Rauga mākslīgā hromosoma (YAC) un baktēriju mākslīgā hromosoma (BAC) ir divu veidu vektori, kas iesaistīti klonēšanas procesā. Galvenā atšķirība starp YAC un BAC ir tā, ka YAC ir mākslīgi konstruēta vektoru sistēma, kas izmanto noteiktu rauga hromosomas reģionu, lai rauga šūnās ievietotu lielus ģenētisko materiālu segmentus, savukārt BAC ir mākslīgi konstruēta vektoru sistēma, izmantojot noteiktu E reģionu.coli hromosomu, lai E. coli šūnās ievietotu lielus DNS segmentus.
Kas ir YAC vektori?
YAC (Rauga mākslīgā hromosoma) ir mākslīgi izveidota hromosoma, kas spēj pārnēsāt lielu svešas DNS segmentu un vairoties rauga šūnās. Tam ir centromērs, telomēri, kā arī autonomi replikējošas sekvences, kas ir būtiskas replikācijai un stabilitātei. YAC jābūt arī selektīvam marķierim vai marķieriem un restrikcijas vietām, lai tas būtu efektīvs klonēšanas vektors. Lielu secību no 1000 kb līdz 2000 kb var ievietot YAC un pārnest uz raugu. YAC transformācijas efektivitāte ir ļoti zema.
Attēls 01: YAC Vector
Kas ir BAC vektori?
Baktēriju mākslīgā hromosoma (BAC) ir mākslīgi izveidota hromosoma molekulārai klonēšanai. Tam ir specifiski E. coli F plazmīdas reģioni, un tā ir apļveida un īpaši saritināta. BAC ir izstrādāts, lai klonētu DNS fragmentus baktērijām, īpaši E. coli. Tas var saturēt DNS fragmentus, kuru izmērs ir līdz 300 kb. Salīdzinot ar YAC, BAC klonēšanas ieliktņiem ir mazāki izmēri. BAC tika izstrādāti 1992. gadā un joprojām ir populāri, pateicoties tā stabilitātei un vieglai uzbūvei. BAC ir noderīgi arī vakcīnu izstrādē.
Attēls 02: BAC vektors molekulārajā klonēšanā
Kāda ir atšķirība starp YAC un BAC vektoriem?
YAC pret BAC vektoriem |
|
| YAC ir ģenētiski modificēta hromosoma, kuras klonēšanai tiek izmantota rauga DNS. | BAC ir ģenētiski modificēta DNS molekula, kuras klonēšanai izmanto E. coli DNS. |
| Dzimums | |
| YAC tika izstrādāti, lai klonētu lielus genoma DNS fragmentus raugā. | BAC tika izstrādāti lielu genoma fragmentu klonēšanai Escherichia coli. |
| Ievietot garumu | |
| YAC var saturēt megabāzes lieluma genoma ieliktņus. (1000 kb – 2000 kb). | BAC var pārvadāt 200–300 kb vai mazākus ieliktņus. |
| Būvniecība | |
| YAC DNS ir grūti attīrīt neskartu, un YAC vektoru sistēmas ģenerēšanai nepieciešama augsta koncentrācija. | BAC ir viegli attīrāms, un to var viegli uzbūvēt. |
| Himērisms | |
| YAC bieži ir himēras. | BAC reti ir himēriski. |
| Stabilitāte | |
| YAC ir nestabila. | BAC ir stabils. |
| Modifikācijas | |
| Rauga rekombinācija ir ļoti iespējama un vienmēr paliek aktīva. Tādējādi tas var ģenerēt dzēšanu un citus pārkārtojumus YAC. | E. coli rekombinācija tiek novērsta un tiek ieslēgta, kad nepieciešams. Tādējādi tas samazina nevēlamos BAC pārkārtojumus. |
| Apkope | |
| Manipulējot ar rekombinantiem YAC, parasti YAC ir jāpārvieto uz E. coli turpmākai manipulācijai. Tāpēc tas ir darbietilpīgs process. | BAC modifikācija notiek tieši E. coli. Tātad DNS pārnešana nav nepieciešama. Tādējādi process nav darbietilpīgs. |
Kopsavilkums - YAC vs BAC vektori
YAC ir kļuvis par būtisku pētniecības instrumentu klonēšanas procesos, jo tas spēj klonēt lielus DNS fragmentus saimniekorganismā. Tomēr YAC ir vairāki trūkumi kā vektori, piemēram, būvniecības grūtības, himērisms, nestabilitāte utt. Tāpēc, lai pārvarētu šīs problēmas, zinātnieki ir izstrādājuši BAC vektorus. BAC ir izveidots, izmantojot īpašus E. coli hromosomas reģionus. Tas ir stabils vektors, un to var viegli konstruēt. Tomēr DNS garums, ko var apstrādāt BAC, ir līdz pat 20 reizēm mazāks nekā YAC. Šī ir atšķirība starp YAC un BAC vektoru sistēmām. Mūsdienās laboratorijās priekšroka tiek dota BAC, nevis YAC.
