Galvenā atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti ir genoma kartēšanā izmantotajās metodēs. Veidojot ģenētisko karti, gēnu saišu modeļu pētīšanai tiek izmantoti ģenētiskie marķieri un ģenētiskie loki, savukārt fiziskajā kartēšanā tiek izmantotas molekulārās bioloģijas metodes, piemēram, ierobežojuma fragmenta garuma polimorfisms (RFLP) un hibridizācijas metodes.
Ģenētiskās kartes un fiziskās kartes veido divu veidu kartes, kas tiek veidotas, lai parādītu gēnus, kas atrodas hromosomās. Tie ir iesaistīti ģenētiskajā diagnostikā un genoma analīzes evolūcijas prognozēšanā. Turklāt viņi izmanto, lai analizētu attālumus starp gēnu lokusiem un analizētu gēnu polimorfismus.
Kas ir ģenētiskā karte?
Ģenētiskā karte ir balstīta uz gēnu loku atrašanās vietām un ģenētiskajiem marķieriem, kas identificēti, izmantojot saišu analīzi un gēnu asociācijas pētījumus. Mendeļa ģenētika izskaidro ģenētiskās kartes, un Gregors Mendels ir persona, kas ieviesa šo jēdzienu. Ģenētiskā karte ir noderīga, pētot hromosomu atrašanās vietas un gēnus, kas iesaistīti konkrētu iezīmju radīšanā. Šie gēni, ko mantojušas meitas paaudzes, pēc tam tiek identificēti kā konkrētas slimības vai rakstura ģenētiskie marķieri.
Attēls 01: ģenētiskā karte
Pirms ģenētiskās kartes izveides ir nepieciešamas vairākas audzēšanas metodes daudzās paaudzēs un pēc tam jāanalizē vairošanās modeļi konkrētai iezīmei vai īpašībai. Un arī gēnu asociācijas pētījumi vēl vairāk atbalsta dažādu alēļu identificēšanu, kas ir atbildīgas par specifiskiem mantojuma modeļiem ģenētiskajā kartēšanā. Alēļu frekvences un gēnu frekvences palīdz paredzēt konkrēta gēna gēnu karti hromosomā.
Kas ir fiziskā karte?
Gēnu fiziskās kartes konstruē, izmantojot molekulāri bioloģiskās metodes, piemēram, restrikcijas enzīmu gremošanu utt. Tādējādi restrikcijas karte ir cits šīs kartes nosaukums. Ģenerējot fizisko karti, sākumā restrikcijas enzīmi sagriež DNS fragmentos. Pēc tam šie fragmenti atdalās ar gēla elektroforēzi. Nākamais solis ir DNS fiziskās kartes ģenerēšana. Kā nākamo soli pēc hibridizācijas tos var pakļaut blotēšanas metodēm. Pašlaik tiek izmantotas augstas caurlaidspējas metodes, piemēram, fluorescences in situ hibridizācija, lai ģenerētu fiziskas kartes, ko izmantot kā ģenētiskos marķierus.
2. attēls: fiziskā karte
Fiziskās kartes ir precīzākas un ātrākas salīdzinājumā ar ģenētiskajām kartēm. Tādējādi to izmantošana gēnu polimorfisma analīzē ir augsta salīdzinājumā ar ģenētiskajām kartēm. Fiziskajā kartēšanā netiek ņemti vērā arī Mendeļa ģenētiskie modeļi.
Kādas ir līdzības starp ģenētisko karti un fizisko karti?
- Abas kartes ietver ģenētisko marķieru raksturošanu.
- Genoma mēroga pētījumos tiek izmantotas abas kartes.
- Ģenētiskā karte un fiziskā karte ir noderīgas ģenētiskajā diagnostikā.
Kāda ir atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti?
Ģenētiskā karte ir gēnu karte, kuras pamatā ir gēnu saišu un gēnu asociācijas pētījumi, kas veikti ar ģenētisko marķieri vai hromosomas gēnu lokusiem. Fiziskā karte ir gēnu karte, kurā gēnu karte ir fiziski iegūta, izolējot DNS un iegūstot precīzu ģenētisko marķieri, izmantojot molekulārās bioloģijas metodes. Attiecībā uz šajās divās kartēs izmantotajām metodēm atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti ir tāda, ka ģenētiskajā kartē tiek izmantotas gēnu saiknes un gēnu asociācijas analīzes metodes, savukārt fiziskajā kartē tiek izmantotas restrikcijas kartēšanas un hibridizācijas metodes. Tāpēc ģenētiskās kartes precizitāte ir zema, savukārt fiziskajā kartē tā ir augsta.
Salīdzinot šajās divās kartēs izmantoto metožu ātrumu, ģenētiskajai kartei ir mazāk ātras, laikietilpīgas metodes. Tomēr fiziskajai kartei ir ļoti ātras metodes. Līdz ar to ģenētiskā karte ir mazāk efektīva, savukārt fiziskā karte ir ļoti efektīva. Turklāt ģenētiskās kartes ir balstītas uz Mendeļa mantojuma modeļiem, savukārt fiziskās kartes nav tieši balstītas uz Mendeļa mantojuma modeļiem.
Kopsavilkums - ģenētiskā karte salīdzinājumā ar fizisko karti
Genoma pētījumos izmanto ģenētiskos marķierus, kas atrodas hromosomās. Lai pētītu šos marķierus, tie ir jākartē, izmantojot dažādas metodes. Mendeļa ģenētika ir ģenētisko karšu pamatā. Ģenētiskās kartēšanas laikā tiek pētītas dažādas pazīmes daudzām paaudzēm un gēni tiek analizēti, izmantojot gēnu saiknes un gēnu asociācijas pētījumus. Turpretim fiziskās gēnu kartes ietver ģenētisko marķieru fizisku izolāciju un raksturošanu, tos ekstrahējot. Šī ir galvenā atšķirība starp ģenētisko karti un fizisko karti.
