Galvenā atšķirība starp RNS polimerāzes kodolu un holoenzīmu ir tāda, ka RNS polimerāzes kodols ir enzīms, kam nav sigmas faktora, savukārt RNS polimerāzes holoenzīms ir enzīms, kas sastāv no sigmas faktora.
Transkripcija baktērijās ir process, kurā baktēriju DNS segments tiek kopēts tikko sintezētā mRNS virknē, izmantojot RNS polimerāzes enzīmu. Šis process notiek trīs galvenajos posmos: uzsākšana, pagarināšana un izbeigšana. Baktēriju RNS polimerāze sastāv no 6 apakšvienībām. RNS polimerāzes kodols sastāv no β, β′, α2 un ω apakšvienībām. Šis RNS polimerāzes kodols pārvēršas par holoenzīmu, kad σ (sigma) faktors ir saistīts ar kodola enzīmu. RNS polimerāzes kodols un holoenzīms ir divas baktēriju RNS polimerāzes enzīma formas.
Kas ir RNS polimerāzes kodols?
RNS polimerāzes kodols ir enzīms, kas iesaistīts baktēriju transkripcijā un nav sigmas faktora. Tas sastāv no 5 apakšvienībām, kas apzīmētas kā β, β′, α2 un ω. Šis enzīms neuzsāk specifisku transkripciju no baktēriju un fāgu DNS promotoriem. Tas ir tāpēc, ka tas neatpazīst nekādus specifiskus baktēriju vai fāgu DNS promotorus. Tomēr šis enzīms saglabā spēju transkribēt RNS no nespecifiskām iniciācijas sekvencēm. Turklāt sigmas faktora pievienošana šim fermentam ļauj fermentam uzsākt RNS sintēzi no specifiskiem baktēriju un fāgu promotoriem. RNS polimerāzes kodola enzīma molekulmasa ir aptuveni 400 kDa.
Attēls 01: RNS polimerāzes kodols
Pamatenzīms satur RNS polimerāzes katalītiskās īpašības. α apakšvienība ir homodimērs, kura izmērs ir 36,5 kDa. To kodē rpoA gēns. Šīs apakšvienības funkcijas ir RNAP montāža, mijiedarbība ar DNS un transkripcijas faktori transkripcijas regulēšanai. Β apakšvienība ir 150,4 kDa liela. To kodē rpoB gēns. Šīs apakšvienības funkcijas ir DNS un RNS saistīšanās, RNS sintēze, NTP saistīšanās, RMP saistīšanās vieta un σ faktora saistīšanās. β′ apakšvienība ir 155 kDa liela, un to kodē rpoC gēns. Šīs apakšvienības funkcijas ir DNS saistīšanās, RNS sintēze, katalītiskā Mg2+ koordinācija, ppGpp saistīšanās vieta 1 un σ faktora saistīšanās. Turklāt ω faktors ir 10, 2 kDa liels, un to kodē rpoZ gēns. ω faktora funkcija ir RNAP locīšana un ppGpp saistīšanās vieta 1.
Kas ir RNS polimerāzes holoenzīms?
RNS polimerāzes holoenzīms sastāv no specifiska komponenta, kas pazīstams kā sigmas faktors, kas nav β, β′, α2 un ω apakšvienības. Sigmas faktora dēļ RNS polimerāzes holoenzīms var atpazīt promotorus. Sigmas faktors arī palīdz pareizi novietot RNS polimerāzes holoenzīmu un attīties sākuma vietā. Kad sigmas faktors veic vajadzīgo un specifisko funkciju, tas disociējas no RNS polimerāzes holoenzīma, savukārt RNS polimerāzes katalītiskā daļa (β, β′, α2 un ω) paliek DNS un turpina transkripciju.
Attēls 02: RNS polimerāzes holoenzīms
Sigmas faktoru skaits dažādās baktēriju sugās ir atšķirīgs. E. coli ir septiņi sigmas faktori. Turklāt sigmas faktori izceļas ar to raksturīgo molekulmasu. Piemēram, σ70 ir sigmas faktors ar molekulmasu 70 kDa. Dažādos vides apstākļos baktērijas izmanto dažādus sigmas faktorus. Dažādu σ faktoru piemēri: σ19, σ24, σ18, σ32, σ38 un σ54
Kādas ir līdzības starp RNS polimerāzes kodolu un holoenzīmu?
- RNS polimerāzes kodols un holoenzīms ir divas baktēriju RNS polimerāzes enzīma formas.
- Abas formas ir iesaistītas baktēriju transkripcijā.
- Viņiem ir apakšvienības.
- Tās ir olb altumvielu molekulas, kas sastāv no aminoskābēm.
Kāda ir atšķirība starp RNS polimerāzes kodolu un holoenzīmu?
RNS polimerāzes kodols ir enzīms, kam nav sigmas faktora, savukārt RNS polimerāzes holoenzīms ir enzīms, kas sastāv no sigmas faktora. Tādējādi šī ir galvenā atšķirība starp RNS polimerāzes kodolu un holoenzīmu. Turklāt RNS polimerāzes kodols galvenokārt piedalās transkripcijas pagarināšanas posmā, savukārt RNS polimerāzes holoenzīms galvenokārt katalizē transkripcijas uzsākšanas posmā.
Tālāk esošajā infografikā tabulas veidā ir parādītas atšķirības starp RNS polimerāzes kodolu un holoenzīmu, lai salīdzinātu to blakus.
Kopsavilkums - RNS polimerāzes kodols pret holoenzīmu
Baktēriju RNS polimerāze ir no vairākām apakšvienībām DNS atkarīgs enzīms. Tas piedalās baktēriju transkripcijā. Tas ir galvenais gēnu ekspresijas enzīms un regulēšanas mērķis. RNS polimerāzes kodols un holoenzīms ir divas baktēriju RNS polimerāzes enzīma formas. RNS polimerāzes kodolam nav sigmas faktora, savukārt RNS polimerāzes holoenzīms sastāv no sigmas faktora. Tātad, šeit ir apkopota atšķirība starp RNS polimerāzes kodolu un holoenzīmu.
