Galvenā atšķirība starp Rho atkarīgo un Rho neatkarīgo izbeigšanu ir tāda, ka Rho atkarīgā izbeigšanā Rho faktors saistās ar transkriptu un pārtrauc transkripciju, pārtraucot ūdeņraža saites starp veidni un transkriptu, savukārt Rho neatkarīgā izbeigšana pārtrauc transkripciju izveidojot matadata cilpas struktūru un pēc tam ar U bagātu reģionu transkriptā.
Transkripcija ir viens no diviem gēnu ekspresijas posmiem. Tas ir process, kas rada mRNS sekvenci no ģenētiskās informācijas, kas paslēpta gēna DNS secībā. Transkripcija notiek trīs posmos: iniciācija, pagarināšana un izbeigšana. RNS polimerāzes enzīms saistās ar gēna promotora secību un sāk katalizēt RNS virknes sintēzi. Kamēr nav atrasta terminatora secība, RNS polimerāze pievieno nukleotīdus un veido RNS virkni. Prokariotos izbeigšana notiek, izmantojot divas galvenās izbeigšanas stratēģijas: Rho atkarīgā izbeigšana un Rho neatkarīgā izbeigšana. Rho faktors ir proteīns, kam ir helikāzes aktivitāte.
Kas ir Rho atkarīga pārtraukšana?
Rho atkarīga izbeigšana ir viens no diviem transkripcijas pārtraukšanas stratēģijas veidiem, kas notiek prokariotos. Rho faktors ir proteīns, kam ir helikāzes aktivitāte.
Attēls 01: Rho atkarīga pārtraukšana
Rho proteīns saistās ar RNS transkriptu un pārvietojas gar RNS polimerāzi 5’-3’ virzienā, veicinot ūdeņraža saišu disociāciju starp DNS veidni un RNS transkriptu. Kad Rho faktors sasniedz transkripcijas burbuli, tas atdala DNS/RNS hibrīdu un atbrīvo transkriptu no transkripcijas burbuļa. Kad tas notiek, transkripcija tiek pārtraukta.
Kas ir Rho neatkarīgā izbeigšana?
Rho neatkarīga izbeigšana ir otrā stratēģija, kas pārtrauc prokariotu transkripciju. Parasti terminatora apgabalam ir apgriezta atkārtojuma secība. Tūlīt pēc apgrieztās atkārtošanās secības ir adenīna bagāts reģions (AAAA). Kad RNS polimerāze virzās uz priekšu, tā rada mRNS secību. Tā kā abi reģioni ir komplementāri apgrieztās atkārtošanās secības reģionā, ūdeņraža saites dēļ tas veido matadata cilpas struktūru. Nākamais reģions būs U bagātais reģions. Matadatas struktūra pārtrauc RNS polimerāzes aktivitāti.
2. attēls: Rho neatkarīga darbības pārtraukšana
Turklāt U bagātajos reģionos ir vāja mijiedarbība starp transkripta U bāzēm un veidnes A bāzēm. Šīs vājās adenīna-uracila saites destabilizē DNS veidni un RNS transkriptu un atdala viena otru. Beigās transkripcija tiek atbrīvota no transkripcijas vietnes.
Kādas ir līdzības starp Rho atkarīgo un Ro neatkarīgo izbeigšanu?
- Atkarīga no Rho un no Rho neatkarīga izbeigšana ir divas galvenās izbeigšanas stratēģijas, kas sastopamas prokariotos.
- Abas veidlapas izlaiž transkriptu no DNS veidnes, lai pārtrauktu transkripciju.
Kāda ir atšķirība starp Rho atkarīgo un Rho neatkarīgo izbeigšanu?
Rho atkarīgo izbeigšanu nodrošina Rho proteīns, savukārt Rho neatkarīgā izbeigšana notiek, veidojot matadata cilpas struktūru. Tātad, šī ir galvenā atšķirība starp Rho atkarīgo un Rho neatkarīgo izbeigšanu. Turklāt Rho proteīns izmanto ATP enerģiju, savukārt Rho neatkarīgā izbeigšana neietver Rho proteīnu un neizmanto ATP enerģiju. Tāpēc šī ir arī būtiska atšķirība starp Rho atkarīgo un Rho neatkarīgo izbeigšanu.
Tālāk esošajā infografikā ir parādīti vairāk salīdzinājumu saistībā ar atšķirību starp Rho atkarīgo un Rho neatkarīgo izbeigšanu.
Kopsavilkums - Rho atkarīgais pret Rho neatkarīgo izbeigšanu
Rho atkarīgā un Rho neatkarīgā izbeigšana ir divi galvenie transkripcijas beigu mehānismi, kas sastopami prokariotos. Rho proteīns ir atbildīgs par transkripcijas izbeigšanu Rho atkarīgā izbeigšanā. Turpretim Rho neatkarīgā pārtraukšana notiek, veidojot matadata cilpas struktūru. Tātad šī ir galvenā atšķirība starp Rho atkarīgo un Rho neatkarīgo izbeigšanu.
